| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,680,531 | A→G | 11.4% | I470T (ATC→ACC) | yhjJ ← | putative periplasmic M16 family chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,680,531 | 0 | A | G | 11.4% | 246.1 / 3.4 | 109 | I470T (ATC→ACC) | yhjJ | putative periplasmic M16 family chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/39); new base G (11/2); total (63/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.23e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CCGTTATTCAGTATCGCGGCGCGATTATCCCGCGTGAGGCGATGCCAGCGTAAACGCAGCATATGCAAAAGGCTGGATAAAGTGTTACCCCTC‑TATCCAGC‑TCATCCATAAATACCTGATGGTTGTGCTAACTCATCACCATCAGGCATTACTGTGCAGGTGGAATATCCGTCACTTCAGGATGTACGTCATCCGTGGCGACAGAGGTGGTCGCAGCGGCGGTAGATGGGGCCATGATTTGATCCCAGACCGCCTGCAACGCTTTCATGTTAAATTCCGGCTCGCCTTTCGGCTGCAGCAGTATTAACGCCATATCATTCGACA‑ACTGTTGACGCAGATCCTGATTTAACATCTCTACCGTCAGGCTATTAAGGAAATCCTGCCGCAGTTTCTGATATTGCTCCGGCG‑CGATATCGACAACCTGATTTTGCAACGAACGCATCCGCTGACCCATCAGAATATCGGTATCAGCTC > NC_000913/3680295‑3680768 | ccGTTATTCAGTATCGGGGCGCGATTATCCCGCGTGAGGCGATGCCAGCGTAAACGCAGCATATGCAAAAGGCTGGATAAAGTGTTACCCCTC‑TATCCAGC‑TCATCCATAAATACCTGATGGTTGTGCTAACTCATCACCATCAGGCATTACTGTGCAGGTGGAATATCCGTCACTTCAGGATGTACGTCATCCGTGGCGACAGAGGTGGTCGCAGCGGCGGTAGATGGGGCCATGAtt < 1:306782/239‑1 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ccgggggggggtgatgggggCCTTGGTTGGCCCCCGGGCCGGCTGCAACGTTTTAATTTTAAATTCCGGCTCGCCTTTCGGCTGCAGCAGTATTAACGCCATATCATTCGACA‑ACTGTTGACGCAGATCCTGATTTAACATCTCTACCGTCAGGCTATTAAGGAAATCCTGCCGCAGTTTCTGATATTGCTCCGGCG‑CGATATCGACAACCTGATTTTGCAACGAACGCATCCGCTGa < 2:129428/222‑1 (MQ=255) cGCAGGGGCGGTAGATGGGGCCATGATTGGACCCCAGACCGCCTGCAACGCTTTCATGTTAAATTCCGGCTCGCCTTTCGGCTGCAGCAGTATTAACGCCATATCATTCGACA‑ACTGTTGACGCAGATCCTGATTTAACATCTCTACCGTCAGGCTATTAAGGAAATCCTGCCGCAGTTTCTGATATTGCTCCGGCG‑CGATATCGACAACCTGATTTTGCAACGAACGCATCCGCTGa < 1:1067306/238‑1 (MQ=255) aGCGGCGGTAGATGGGGCCATGATTTGATCCCAGACCGCCTGCAACCCTTTCATGTTAAATTCCGGCTCGCCTTTCGGCTGCAGCAGGATTAACGCCCTATCATTCGACA‑ACTGTTGACGCCGATCCTGATTTAACATCTCTACCGTCAGGCTATTAAGGAAAACCTGCCGCCGTTTTTGATATTTGTCCGGCGCCGAT‑TCGCCAACCTGATTTTGCCACAAACACAACCGCTGcccc > 2:553049/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |