| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,826,834 | 0 | T | G | 15.4% | 296.0 / 2.5 | 125 | G542G (GGT→GGG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/71); new base G (23/2); total (52/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.39e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GATACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCTACA‑CCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGT‑GGCGCGGTGGCTTCTCACTGCGTGCTGCTCT‑ACAAAACGCCGC‑TTTCTAAAACGGCGCAAATTCGCCTGCAAGTGCTGCGCGACAGTAACGACGGTTTTGT > NC_000913/3826601‑3827070 | ccccccccccGTACCGACATCTTGGCCCGCGTGACCCACGCCGGCATACCTGAAGGTCGTCAGGCGTGCGGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCG‑TTTAAACAAGGTGA‑GCt < 2:940724/235‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |