| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,069,799 | 0 | G | T | 12.0% | 407.0 / 8.0 | 174 | T201K (ACA→AAA) | yihR | putative sulphoquinovose mutarotase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (67/84); new base T (17/6); total (84/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
GTTAGGCGGGCAACTCATAGGTTCAACTGCCAGTCCCTGACGCTGTAATTTTTCACCGCTATAAA‑CCTGCACCCAGAGTTGATCGGAACAAAGGCTTACCGAAAGCGCCTGCTGTGGATGGGTAATGGTCATTTCCCACAAATCATTAGCGGTTTTAAAG‑GTGTGGTCGATTTTTGTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGCTCATCAACGTGGTGAAGC‑GTTGTCGGATT‑CGC‑GTGCTCATCGACGGCATAAACCTGGTTTGCCGGAAGCTGGAACAGATATTCATCAACAGATGTTAAGTTGCAGGTTAAATAAGGATGAATACCCACGCCATAAGGCGCTGCGACAGTGCCGATATTCTGGCTTGCGATCTCAACGGAAAGACCCGTGTGTGCGTTGAGCGAATAAACAACTTGTGAAGCCAGCATAAACGGATAGCCGTAACTGGGCGGCAGAAAA > NC_000913/4069561‑4070035 | ttAGGCGGGCAACTCATAGGTTCAACTGCCAGTCCCTGACGCTGTAATTTTTCACCGCTATAAA‑CCTGCACCCAGAGTTGATCGGAACAAAGGCTTACCGAAAGCGCCTGCTGTGGATGGGTAATGGTCATTTCCCACAAATCATTAGCGGTTTTAAAG‑GGGTGGTCGATTTTTTTCGCGGCTATTTTTTTCGCCTGCGTGAAATTTAAATCCAGTTCATCAAAGGGGTGAAGC‑GTTgg > 2:899596/1‑238 (MQ=255) 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NC_000913/4069561‑4070035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |