| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,264,148 | T→C | 7.1% | E28G (GAG→GGG) ‡ | qorA ← | quinone oxidoreductase, NADPH‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,264,148 | 0 | T | C | 7.1% | 341.4 / 4.2 | 122 | E28G (GAG→GGG) ‡ | qorA | quinone oxidoreductase, NADPH‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/66); new base C (4/7); total (47/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAACGCGATCCACAAGTTGCCGGGCTGAA > NC_000913/4263918‑4264386 | tATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAAGGCCCTGCGGGTAATAGTGGCCGTAAAATTGATGCCGGTGGCTTTTTTTTTTACCCTGGTTTCATTCTccccccgg > 2:89491/1‑236 (MQ=255) cccAATAATGTTTTGCACAGAGCTTTAAGCGCCTAACGCCTACGGCGCATAGACTTCACGATCGCCTGCTTTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCGCGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCgg < 2:943099/237‑1 (MQ=255) gCAATAATTTTATGACAAGCGGTGCAAGCCCCTACCCCCGGCTGCCCATAGACTACACGACCGCCTGCCTTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTCCTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGc < 2:566230/239‑1 (MQ=255) caaaatttttttggacaGGGCTTTAAGGGCCTAACGCCGACTGGGCATAGGCTACACGATTGCCTGGCTTAATTGGCTTTACACCCCTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCa < 2:1057570/225‑1 (MQ=255) cAAAAATGTTATGCCCAGTGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCCCTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCa < 1:218088/239‑1 (MQ=255) aataatGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCCGCGGAGATATGTGTCGATAAAATTGATGGCGCGGGCTTTTTTTTTGTCCCGGGTTTTCTTCTCCGCCgggacgggcg > 2:58182/1‑231 (MQ=255) atattttttccacatggCTGTAAGCCCCTACCCGCCACTGCTCCTAGCCTTCACGACCGCCTGCATTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTCCTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCGACTCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGTATCGGCAGGa < 2:771406/223‑1 (MQ=255) attttATGCACGGGGCTTTAAGCGCCTAACCCCGACTGGGCATAGACTACACGAACGCCTGCCTTAATAGGTGTTACACCACGGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCCCCGCCGGATCGGCAGGAGt < 2:820157/236‑1 (MQ=255) attttATGCACAGGGCTGTAAGCGCCTAACGCCGCCTGCGCATAGCCTACACGATCGCCTGCCTTAAGATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGt < 2:933490/236‑1 (MQ=255) ttATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGCGAGGTCCCTGCGGGTATATGTGTCGTGAAAAATGATGTCGGGTGGTTTTTTTTCGACCGGGGTTTTCTTTTCCCCCGGGTCGGCgggggggga > 2:159613/1‑233 (MQ=255) tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGGTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGGATTCATTCTCCGCCGGATCGGCTGGGGTGaaat > 1:185200/1‑236 (MQ=255) tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTTGACCTTGATTTCATTCCCCGCCGGATCggacgggggggac > 1:820157/1‑226 (MQ=255) tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGGTATATTTGTCGGTAAAATTGAAGACGATGGGTTTATTTTCGACCTGGGTTTTATTTTCCCCCGGATGGGCGGGGGGGaaaac > 2:713101/1‑236 (MQ=255) tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCGGGGGGTAAATGTTTCGATAAAATTGTGTCCGATGGGTTTTTTTTTTGCCTGGGTTTTATTTTCCCCCggggcggacggggggacact > 2:663359/1‑221 (MQ=255) cccaGAGCTGTAAGCGCCTAACGGCGACTGCGCATAGACCACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTa < 1:713101/237‑1 (MQ=255) agagCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAAGGCGCTGGCGATATATGTGTCGATAAAATTTATGCCGGTTGCTTTTTTTTTGACCTGGGTTTTATTTCCCGCCGGCACGGCAggggggagatacccgg > 2:725806/1‑225 (MQ=255) gagCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTCATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTTAAGCCCGCCGCGGGTATATGTGTCGATCAAATTGATGCCGAAGGGTTTATTTTCGACCTGGATTTCTTTCTCCGCCGGCTCGGCCGGGGGGAActccccggg > 2:619026/1‑233 (MQ=255) agCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGCAAGGCCGCTGCGGAAATATTTGTCGGTAAAATTTATGCCGAGGGCTTTCTTTCTGACCTGGCAGTCATTTTCCGCCCGATCGGGAgggggggaaaccacggcc > 2:323415/1‑223 (MQ=255) agCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGGTATATTTGTCGATAAAATTGATGCCGAGGGCGTTTTTTTTGACCCGGGTTTTTTTCTCCGCCGGACCGGGAGGGGGGGAGTCTACGGCt > 2:58918/1‑239 (MQ=255) agCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGGGATATGAGTTGCTAAAATTGATGCCGAGGGGGTTATTTTTGACCTGGGTTTCATTTTCCGCCGGATCGGCAggggggagaacaccg > 2:1082745/1‑223 (MQ=255) gCTGTAAGCGCCTAACGCCGACCGCGCATAGCCCACCCTGTCGGCTGCCTTAATATTCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCt < 1:58918/238‑1 (MQ=255) tGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCTTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTg < 1:1030270/238‑1 (MQ=255) aaGCCCCTAACCCCGACTGCCCATTGTCCACCCGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTGCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGt < 2:674677/239‑1 (MQ=255) aaCGCCGACTGCGCAGAGGCTACACGGTCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACGGCCGACTTTACTCACGATGCCGGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCgg < 1:43852/239‑1 (MQ=255) tCGCCTGCCTTAATAGGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAaa‑ttcaattc < 1:89491/238‑1 (MQ=255) gcctgcctTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgtg < 1:254704/239‑1 (MQ=255) gccctgctttattcgCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCCCGATGCCTGGTGCTTCGGTGCCTAACCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGGGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgtg < 1:210212/225‑1 (MQ=255) cctTAAGATGCTTTACACCCCTGCCGAGTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑Gc < 1:232709/215‑1 (MQ=255) ctTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCCCTGCGGGTATATGTGTCGGTAAAAATGGTGCCGCTGGCCTTATTTTTCACCTTGGTTTCATTTTCCCCCGGGTCGGCAGGAGGGGAACCTTCCGCTTT‑AAGTAC‑TTCCCGGGCCCCCGG‑GTGTGT‑GAAA‑TCAAATTGCTGtttc > 2:254704/1‑236 (MQ=255) ttAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTTCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCAt < 1:159613/239‑1 (MQ=255) atttGCTTTACACCCCTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAACCCGGTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCAtgtg < 1:485881/236‑1 (MQ=255) cTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGGTATATGTGTTGGTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTTTCCGCCGGGTCGGCAGGGGGGAAATCTAACGCTTG‑AAAGAG‑TT‑TCCGGCCCCCCC‑GGTTTT‑GAAATTTAAATTGGTGGTG‑CCagttgccc > 2:769170/1‑231 (MQ=255) ttACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGGTATATATGTCGGTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCTCCGGTTCGGCAGGCGTGAACTCTACGGCTTGTAGGAAC‑TC‑CCGGCCCCCCGC‑GTTTG‑‑GAaa‑ttcaaatactctgtcccatttgcccccc > 2:384681/1‑216 (MQ=255) tcccccccTGCCGTCTTTCCCCCCGGTGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGGGATGGGGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGGCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAg < 2:396126/232‑1 (MQ=255) tACCCCACTGCCGACTTTACTCCCGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATTGCTTTATTTTCGACCTGTATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAg < 1:573112/239‑1 (MQ=255) tACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGGTTTCATTTTCCGCCGGGTCGGCAGGGGGGAACTTCACGGCTTT‑TAATAC‑TTCCCGGGCCCCCG‑‑GCTTTTGGAAA‑TTAAATTGTTGTTG‑cactttggccccag > 2:32523/1‑226 (MQ=255) tACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGGAGGAACTCTACGGCTTT‑AAGGAC‑TT‑CCCGGCCACCGT‑GGTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGgcct‑cccg > 1:701053/1‑237 (MQ=255) caccacTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGCCCTGGGTTTCATTTTCCGCCGGATCGGCCGGGGGGGACCCTACAGCTTT‑AAATAA‑TT‑CCCGGCCCCCCT‑GCCTGTGGAAA‑TTAAATTC‑TGTTGTCCGAGTTTCCT‑CCaca > 2:481527/1‑237 (MQ=255) ccccTGCCGGCTTTACCCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACg < 1:619026/236‑1 (MQ=255) cccTGGCGACTTTACCCCCGATGCCTTGTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGt < 1:1087373/237‑1 (MQ=255) cTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGCTATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCCGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCCCGGGTGAACTCTAAGGCTTT‑GAGGAA‑TT‑CTCGGCCACCCTCGTTTGG‑GAAA‑TAAAATT‑GTGTTG‑cgcaacttcccccccaaagcat > 2:82139/1‑218 (MQ=255) cTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCCGCGGATATATGGTTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGCCCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCCGGGGGGTACTCTACCGCTTT‑GAGGACTTT‑CCGGCCCCCCGC‑GTTTTG‑CAAA‑TCAAATTCGTGTTC‑CCATGT‑TCCTCCCAGAActat > 2:1083747/1‑236 (MQ=255) tGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGGGTGAACTCTCCGCCTTT‑GAGGAC‑TT‑CCCGGCCCCCCG‑GCCTTT‑TGAA‑TTCAATTTGGTTTC‑GCACGTGtcct‑ccccgacgg > 1:1002876/1‑229 (MQ=255) cGACTTTACTCACGATGCCTGCTGGTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGt < 1:205782/238‑1 (MQ=255) tttACTCACGAGGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAgg < 1:771391/238‑1 (MQ=255) tttACTCAAGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTtgt‑g < 1:1081324/192‑1 (MQ=255) ttACCCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTATACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTTAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCTT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGt < 1:270071/239‑1 (MQ=255) tACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgtg < 1:757530/204‑1 (MQ=255) gaCTCCCGATGCCTGCGGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGGGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGGCGATAAAAGTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGGCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGt < 1:120326/237‑1 (MQ=255) cTCAGGAGGCCTGCTGGTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGGAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGTTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTg < 1:913937/239‑1 (MQ=255) gaCGATGCCTGCTGCTTCGGGTCCTAAGCCGATGGGTAGCGATGGGGGGGGGTAAAGGCCGGTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTTTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCt < 1:170881/238‑1 (MQ=255) cACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCt < 1:96078/239‑1 (MQ=255) tgctgcTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGAt < 1:58182/239‑1 (MQ=255) gCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGGGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGTATATATTTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACGCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGAcc < 1:652240/239‑1 (MQ=255) ctatatccccgggtgtcgcgtGGCGGCGTGTAAAGGCCGCTTCGGTGATATCGGCCGATAAAATTGATGCCGATTGCTTTATTTTCCACCTGTATTTCATTCTCCGCCTGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACTTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATTATAA‑AGTTTCGAcc < 1:337140/218‑1 (MQ=255) ccaaaTCCGGTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGGGGATATATGTGGCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGAcc < 1:907119/235‑1 (MQ=255) tGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATTTATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCCCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTAt < 1:323817/238‑1 (MQ=255) tGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATAGGGGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTAt < 1:289903/238‑1 (MQ=255) agggATGGCGGGGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGt < 1:1082745/236‑1 (MQ=255) ctgcggcgGGTAAAGGCAGCTGCGGATTTATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGGACTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGATCTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACt < 1:729974/236‑1 (MQ=255) cggcggGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCa < 1:725806/238‑1 (MQ=255) gTAAAGGCCTTTGCGGATTTATGTTGCGATAAACTTGATGCCGATGGCTTTATTTGCGACCTGGATTTCATTCCTCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCTCCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACt < 1:642256/238‑1 (MQ=255) aggtgaaggcgggttattggttCGATAAAATTGGTGACGATGGCGTTTTTTTCGACCTGGATTTCAGTCTCCGCCGGGTCGGCAGGAATGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGc < 2:285740/218‑1 (MQ=255) aGGCCGGTGGGGGTATATGTGGCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGGCCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGc < 1:884698/239‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGATATTGGTGTGGATAAAATTGACGCCGATGGATTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCGCCGTCGGAACGGAAGGAGTGAACTTTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCTGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑a < 2:193316/237‑1 (MQ=255) ggtttttttttttcaTAAAATTTATGCCGATGGTTTTTTTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATaaa < 2:306904/225‑1 (MQ=255) gaaatatGTGGCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCGCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATGCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑a < 1:573506/226‑1 (MQ=255) gATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACt < 1:20929/214‑1 (MQ=255) gATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATaaa > 1:352799/1‑238 (MQ=255) gATAGATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGGGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGt < 1:510454/168‑1 (MQ=255) tatGTGTCAATAGAATTGGTGCCGATGGATTTATTTTCGACCTGGATTTAAGTCCTCGCAGGATCGGCAGGAGTGAACTTCAAGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCCGCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGCACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCtt < 1:963162/239‑1 (MQ=255) tgtgTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGGTTCGACCCATTTTTTATCTGGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑GGG‑AAATAAAACCTTca > 1:787706/1‑239 (MQ=255) tgtCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGCTAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAAcatgtctct > 1:285740/1‑231 (MQ=255) tCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑TAGGAC‑TT‑CCGGGCCACCGG‑GCTTGT‑GAAA‑TTACATTCGTTTTG‑CCATGGTTCCT‑CCAGAACGGATCGTCAGGGGCTGCTTCATTAGATAACATTTTCAACCC‑TTCTTTATTTAGGTAACTCCTTT‑CCATATGGA‑GGG‑AAAAAAAacccgaccttt > 2:573506/1‑231 (MQ=255) tCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGCTAA‑AGCTTCGACACATTCTTTATCTCGGCAACTCCATT‑ACCCATGGC‑AGG‑AAATAAAccccttcacaa > 1:365539/1‑231 (MQ=255) tCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATTTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑CGG‑GAATAAACCCTTcaacaa > 1:92682/1‑239 (MQ=255) tCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAA‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTcaacaa > 1:77974/1‑239 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCCTATGATAA‑AGTTTCGACCCCTTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑TACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCcacaaa > 1:842049/1‑239 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑a > 1:335985/1‑218 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCaacaaa > 1:7466/1‑239 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGGATCGTCAGGGTCTGCTTCATTTGATAA‑AGTTTTGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTTTGGC‑AGG‑AAAAAAACCCTTCaacaaa > 2:300040/1‑239 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTCCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCCTGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGTTAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CCCTATGGC‑AGG‑ACATAAACCCTTaaacaa > 1:858850/1‑238 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCGGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑a < 2:335985/218‑1 (MQ=255) cGATAAAATTGATGCCGATGGATTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTTAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCaacaaa < 1:601567/239‑1 (MQ=255) gtaatttttgtgtcggtGGTTTTTTTTTCTATCTGGATTTCTTGCTTCGCCGGTGCGGGTGGGGTTAACTTTACGGTTTG‑CACTAC‑TT‑CCGGCCCTACGT‑CCTTGT‑TAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGCCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGTTCTGCTTCATATGATAT‑AGTTGCGTCCCATTCTTTAGCTCGGTAACTCAATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCaacaaaca < 2:305606/223‑1 (MQ=255) aTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCCATTCGTGTTT‑CCATGTGTCCT‑CCAAAACGCATCGTCAAGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCCTT‑TCCTTTTGC‑AGGAAAAAAAACCCTCCaaaaaaa > 2:512830/1‑238 (MQ=255) aTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgt < 2:353002/120‑1 (MQ=255) aTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgt > 1:353002/1‑120 (MQ=255) aTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATTTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGt > 2:1046534/1‑155 (MQ=255) aTAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGt < 1:1046534/155‑1 (MQ=255) gtGGCTTTTTTTTCGCCCTGGTTTTCCTTCTCCGCCGGATCGGCAGGATTTAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCcg < 2:974002/238‑1 (MQ=255) aTGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑GAGTAC‑TT‑CCCGGCCACCGT‑GCCTGG‑GAAA‑TTCAAATCGGGTTG‑TCATGTCACCT‑CCAGAACCTACAGTCAGGGTCTTCTTCATTTGTTAA‑AGTTTCGACCCATTCTCTTTCTCGGGAAACCCATTACCCTA‑GGC‑CGG‑AAATAAAACCTTCcccaaaaaaaagacataacccc > 2:208198/1‑222 (MQ=255) tGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGC‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGCATCGTCAGGGCCTGCTTCATATGCTAA‑AGTTTCGACCCATCTTTTATCTCGGTAACCTCATTCCACT‑TGGCGAGA‑AAACAAACCCCTCaaaaaaacaagcgtgaaccccc > 2:696274/1‑222 (MQ=255) ttATTTTCGTACTGGATTTCATTCCCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTTC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAAcg < 1:928375/239‑1 (MQ=255) ttATTTTCGACCTGGATTTCATTCCCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCAACGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAAcg < 1:696274/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑GTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑ACGTTCGACCCATTCTTTATCCCGGTAACTCCCTT‑CACTATTGC‑AGG‑AAATAAACCATTCACCACACAGCCGGCTGAAacccccagaccc > 1:607835/1‑231 (MQ=255) gACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATa > 1:294474/1‑194 (MQ=255) ggATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAACCCGATCCACAAGt > 1:394485/1‑238 (MQ=255) tttCATTTTCCGCCGGATCGGCAGGAGGTAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑ACAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAACGCGATCCACAAGTTGcc < 2:49900/239‑1 (MQ=255) tcCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACACCAGGCTGAACCCCCCGAACGCGATCCCCAAATTGCCggggctaa > 1:185772/1‑234 (MQ=255) | TATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATTGATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGCTTG‑AAGTAC‑TT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCT‑CCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAACGCGATCCACAAGTTGCCGGGCTGAA > NC_000913/4263918‑4264386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |