| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 541,102 | A→T | 14.5% | M180L (ATG→TTG) | ybbY → | putative uracil/xanthine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 541,102 | 0 | A | T | 14.5% | 114.4 / 3.9 | 54 | M180L (ATG→TTG) | ybbY | putative uracil/xanthine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/10); new base T (4/4); total (40/14) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
TCTCCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCAATACCTA > NC_000913/540890‑541334 | tctcCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGAGGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGAt < 1:158171/214‑1 (MQ=255) tcCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGGCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGGCCC‑CGCGGGCGGGGGTGTGCCCGGTatcggggaggatatact > 2:488804/1‑222 (MQ=255) cGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGAACTGGGGTTGTTTATCTTCCTg > 1:1072995/1‑238 (MQ=255) tGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCa > 1:17854/1‑238 (MQ=255) aCGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCTGCCTCT‑CGGGGGCGGGGTGGTGCCTGGGTCTGGGCATGATTATCTTCCTCCCGCAACg > 2:551813/1‑239 (MQ=255) ttAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGGGATTTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCCACCTTTTTCCCGtttgggc > 2:198878/1‑234 (MQ=255) aTTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGGGATGTGCCTGGTACTTGCGGTGATTATCTTCCTGCCGCCACGTTTTGCCCGTTATGGCCGGCTgg > 2:868530/1‑239 (MQ=255) ttAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGTACTGGCGATGGTTATCTTCCTGCCCCCACGTTTTGCCCGTTAAGGCCCGCTGGt > 2:840131/1‑239 (MQ=255) cGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGTCGCTGCTTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCCGCTGGTCGGCTCCAt > 1:397360/1‑239 (MQ=255) ttATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCCCCCTAACCggttggtt > 1:1084296/1‑239 (MQ=255) gCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGttgttggtgg > 1:127180/1‑235 (MQ=255) 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cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGTTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGGGAGGGGCCTGGTCCTGGCGGTGATTTTCTTCCTGCCGCACGGTTTTGTCCGTTATGGCCTCTTGGTGGGCCCCCTAACCgccggggcggttgggact > 2:1013575/1‑222 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCATTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGAGCCTTGTACTGGCGCTGATTAGCTTCCTGCGGCAACGTTTTGCCCGTTATGTCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGCTTGTTGTGGt > 1:1029973/1‑237 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGGCTGCTGGTAGGGACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGt > 1:275299/1‑237 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTACTTGGTAATGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACCTTTTGCCCGTTATGGCCCGCTGGCCGGCACCCTAACCGGGTGgttgtttgggt > 2:83946/1‑232 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGCGTTGTGCCTGGTACTGGCCATGATTACCTTCCTGCCGCCACGGTTTGCCCGTTATGTCCTGCTGGTCGGCACCATAACCCGCTGGTTGTTTTggg > 2:808499/1‑236 (MQ=255) tCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGGGGTACtt > 1:301946/1‑239 (MQ=255) ttgtgcgcgggggccgcAGCCGGACACTTTCTTTTTTAAAGGGTAGGCTGGGGTTGCGGTTGGGCATGGCCG‑CCCGAATTTTAAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc < 1:551813/225‑1 (MQ=255) gTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCggca > 1:351448/1‑235 (MQ=255) gTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc > 1:791179/1‑238 (MQ=255) gTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCC‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc > 1:784595/1‑238 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc > 1:59975/1‑238 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc > 1:112741/1‑238 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGGGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc > 1:1000667/1‑238 (MQ=255) tgtggggCGCGCAGTTGACCATTATCTTTTTCAAG‑GGTATGCTGGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGCCCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGct < 1:868530/234‑1 (MQ=255) tGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTCCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACCCGct > 1:636138/1‑238 (MQ=255) gggCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCg > 1:101651/1‑239 (MQ=255) ggCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCCACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTGCCACTCGCTCTCCgg > 1:11696/1‑239 (MQ=255) gcgcgcAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGACGATTATCTTCCTCCTGCAACGTTTTGCCCGGTTGGGGCTGCGGGTTGGCACCCTAACCGGGTGGTTGTTGTGGGGCTTTGGTTTTCCTTC‑TCTCACTCGcgccgccggg > 2:272589/1‑230 (MQ=255) 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tGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGGGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGTCGATGGTTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTGTTTTTGGGACTTTTTCTTTGCTTCTTTCCCATCCCTCCCCGGGGAGTTGGCCTGGcgtgggtgccggcctgtccgg > 2:499433/1‑219 (MQ=255) gCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCCGTGGCgggg > 1:176633/1‑237 (MQ=255) gCATAGCCGACCTAATTTTT‑AAAATGTGGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGGGGGGATGGGCCTGGTACTGGGGGTGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGcc < 1:957167/238‑1 (MQ=255) ccGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACAATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCCCTCTCCGGCGAGTGGCTCTGGCAGGGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCggggggtttgtggcccgtgct > 2:637765/1‑220 (MQ=255) aCCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGcc > 1:976385/1‑57 (MQ=255) aCCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGcc < 2:976385/57‑1 (MQ=255) cccGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTg > 1:787365/1‑132 (MQ=255) ccGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCCTAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCACTCCGGTGGGTTGCCCTGGCAGGGGTTCCCGCTCGGCGCGGGCGGGGGTTTTTTGCCgggggttttttt > 2:887316/1‑230 (MQ=255) taaaaaTTCGGTTCCCGCCGTTTCCGCTTT‑CGGTGGCGGGGTTGTGCCTGGTACGGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGAcggcg < 1:1013575/237‑1 (MQ=255) aaaaTTTGGTTCCCGCCGGTCCCG‑TCTCCGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGTTCTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGt < 1:401240/239‑1 (MQ=255) tcccggcgTTCGCTCTCG‑CGGGGGCGGTGTTGTGGCGGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGt < 1:272589/237‑1 (MQ=255) 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ccGGTGGGGGGAATGGTCCTGGTACTGGCGTTGATTACCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCaa < 1:808499/238‑1 (MQ=255) cGGTGATGGTCCTGGTGCGGGCGGTGATTCTCTTCCTGCCGCAGCGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGGTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCAATACCTa < 1:488804/238‑1 (MQ=255) | TCTCCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTT‑AAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCAATACCTA > NC_000913/540890‑541334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |