| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,120,281 | 0 | T | C | 9.3% | 309.3 / 2.0 | 113 | E425G (GAG→GGG) | wcaJ | colanic biosynthesis UDP‑glucose lipid carrier transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/45); new base C (2/11); total (56/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GTCGATAATCCGCGCCAGCACGGTCATCTGCACCAGCCCGAGGCCGATGATGATCACCGTGGCAATCGCCGACCACTTCGCGCCGCTGATGGTTTTTTCACGTAAGCTCATAT‑C‑AATATGCCGCTTTGTTAACGAAACCTTTGAACACCGTCAGGAAAACGATTTTGATATCGAACCAGACGCTCCATTCGCGGATGTACTCAAGGTCGAACTCGACGCGTTTTTCCATTTTCTCCAGCGTGTC‑GGTTT‑CGCCGCGCCAGCCGTTAATCTGCGCCCAGCCGGTAATGCCCGGTTTCACCTTATGGCGCAGCATGTAGCCTTCAATGAGCTGTCGATACTGTTCGTTATGCGCTACTGCGTGCGGACGTGGACCGACAATCGACATCCCCCCGGTCAGCACATTGATAAACTGCGGCAATTCATCCAGCGAGGTACGGCGCAGAAAGTTCCCCACTTTGGTGACGCGCGGATC > NC_000913/2120048‑2120519 | cACGGTCATCTGCACCAGCCCGAGGCCGATGATGATCACCGTGGCAATCGCCGACCACTTCGCGCCGCTGATGGTTTTTTCACGTAAGCTCATAT‑C‑AATATGCCGCTTTGTTAACGAAACCTTTGAACACCGTCAGGAAAACGCTTTTGTTATCGAACCAGACGCTCCATTCGCGGATGTACTCAAGGTCGAACTCGACGCGTTTTTCCATTTTCTCAACCGGTTC‑GGtttgcccccc > 1:361624/1‑231 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |