| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,206,436 | G→A | 18.0% | intergenic (‑182/‑25) | ttdR ← / → ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,206,436 | 0 | G | A | 18.0% | 198.9 / 15.9 | 104 | intergenic (‑182/‑25) | ttdR/ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/57); new base A (8/10); total (37/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_000913/3206200‑3206668 | aCGATTTCTACCCGTACCTGCAAGGCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCCGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACa < 2:579473/238‑1 (MQ=255) tttCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAc < 1:363728/239‑1 (MQ=255) ttCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑a < 1:962804/239‑1 (MQ=255) cTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTTAAACAaaaaa‑aaa > 2:835962/1‑239 (MQ=255) aCCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGCGATTTTTCAGACAaaaaa‑aaaaa > 1:83696/1‑239 (MQ=255) aCCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCATAAAAATAa‑aaaaa > 1:236611/1‑239 (MQ=255) ccAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAAc < 1:337233/239‑1 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCTTTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGCATTTTTTTAGAGAAATAC‑AAAAACAGG‑a > 1:136725/1‑239 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCATAAAAATAC‑AAAAAcatga > 1:1019870/1‑235 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCTCAAAAAAAC‑aaaaaaatga > 2:7648/1‑234 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑g < 1:552802/239‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑g < 1:1280385/239‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑g < 1:65743/239‑1 (MQ=255) tGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGTAATTTTTTAGAAAAATAA‑AAAAACAGG‑A‑gat > 1:128041/1‑236 (MQ=255) gCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTAGCCGCAGTTGTGATAAGCGCATTTTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTTCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTAGACTCACGAACTGTTAATTTC‑ATAGTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTGTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAATCTGT‑A‑g < 2:288299/224‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑Ga < 1:589127/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑Ga < 1:52430/238‑1 (MQ=255) cAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGtaat < 1:894721/238‑1 (MQ=255) aGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAATACAAAAAAATGG‑G‑GTTG‑CACG‑TT‑GAGC‑GGAAGaaataa > 1:875258/1‑239 (MQ=255) gCTATTCAGCAGCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCACAGTGTATTCCGCAACACATTGCCAGTCCCTGCTCTGGCGCAAGATTCATTCTTATGTGCTCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGGAAAAAATATAGAACCGCATTTGTAGTGGTAGATTGTGGC‑GGTGAAGTTTTCCAGACAAATAC‑AATAACTAG‑A‑GGTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGtaataa < 2:930485/238‑1 (MQ=255) tATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGc < 2:282520/238‑1 (MQ=255) caTTCAGCATCGGTAAGTATTCGCAGTTGTGGTAAGCGCGCTGTATTTCGCATAACAATGGCATTCTCTGCTCTGGCGCAATATTCTTTCTTATTGTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCGGGGTCGGAAGAAATATAAAACCACATCGTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCTAGTCAAATAC‑ACAAGCTGG‑A‑GTTGCTATC‑AT‑GAGC‑TAAAGtaacgagc < 2:1312143/237‑6 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:835962/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:719283/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:132617/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:356970/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:57842/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:738001/237‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAATAA‑AAAAAATGG‑A‑GTTGCCATG‑GT‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCaaacgacaggg > 1:740417/1‑230 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAAC‑AAAAAATGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGG‑GCAAGGAAAAAACAAAAAGCaagg > 1:772923/1‑236 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGAGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTTAGACAAAAAC‑AAAAACAGG‑A‑GTTGCCATG‑GC‑GAGG‑GAAAGAAATAAACAACAGAAAGTg > 1:251238/1‑239 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑aa < 2:1119944/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑aa < 2:688796/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑aa < 1:722731/238‑1 (MQ=255) aaTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCGCATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGT‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAAAAGGCAGTG‑aaga < 2:151113/239‑3 (MQ=255) ttATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAg < 1:76192/239‑1 (MQ=255) tATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGt < 1:1011294/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACa < 2:193477/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑gag‑a < 1:1030916/238‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCt < 2:237923/239‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGAAAAATAA‑AAAAAAATG‑G‑GGTGGCATG‑AT‑TAGC‑GAAAGGAATAAACAAAAAGAAGGG‑AATAAAATGACA‑GAG‑Atttttgccaa > 1:983174/1‑231 (MQ=255) aGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGAAAAAAAC‑AAAAACTTG‑A‑GTTGCCCTG‑AT‑GAGG‑GGAAGTAATAAACAAAAGGCAGTG‑AATAAATTGACA‑GAG‑ATTGttggttaatt > 1:503738/1‑230 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAAAAA‑AAAAAATGG‑A‑GTTGGCACG‑AT‑GAGC‑GGGAGGAATAAGTAACAAGGAGAG‑AAAAAATTGGCA‑GAG‑ATTTTCTCTTAA‑TTTa > 1:1225525/1‑239 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTAcc < 1:824393/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACTTTGCCATTCCCTGCCTTGGCGCAATTTTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTATTTAC‑ATATTCAGGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑TTTGTCGCTAAT‑TTTACCGCCa < 2:1225525/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCATCCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTGTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGGGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACGGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCa < 2:1128342/239‑1 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGC‑ATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGTACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAGTTTTTCCGTGAAATAC‑AAAAACCAG‑A‑GCTGGTATG‑GT‑GATA‑GGGCGTAATAAGCAACAAGGAGAG‑GGTAAAATGAAA‑GGG‑GTTGTGCCTAAG‑TTTACCGCCATGAtgta > 2:779950/1‑236 (MQ=255) cATTGCCATCCCTTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGGGGGAGTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACGGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCt < 1:696702/239‑1 (MQ=255) cacccctttctctGGCGCATTATATATTCTGATTACCGAGTTGAACAACGAACTGTTAAATGC‑ATATGCCGGGGGGAAAAAAATATAAATCAACATTTGTAGTGGGATGTTGGGGG‑GGTGATTTTAACAAAAAAAAAAA‑AAAAACAGG‑A‑GTTTCCATA‑AG‑GCGC‑TAAAAAAATAAGCAACAGACGGAA‑AAAAAGTATACA‑GAG‑TTTGCCGTTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑a < 2:318866/230‑1 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGTTTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAAACAAATAC‑AAAAATTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑AAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTGGAAA‑GAG‑ATTGTCCCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑a < 1:95797/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACAAATAC‑AAAAACAGG‑A‑GGTGCCCTG‑AT‑GAGA‑GAAAAAAAAAAACAAAACACAGGG‑GAAAAATTTAAA‑AGG‑AATTTAGCTCAC‑TTTACCGCCCACATTTTTTCCCG‑aaag > 2:634911/1‑236 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGCGAAATTTTTCAGAAAAAAAC‑CAAAAACGG‑A‑GGTGCCATG‑GA‑GCGCGGAAAATAA‑AAGCAAAAGACAGAG‑GAAAAAATTACA‑GCG‑AATGTGTATAAC‑ATTACCGccctcaattttatccagaaca > 2:811517/1‑220 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGGAAAAAAC‑AAAAACTTG‑C‑GTTGCCACT‑CT‑TTGT‑GCAAGGAATAAGCAACAGGCCGAG‑GATAAGATGGCA‑GAG‑ATTTTCGGCAAA‑TTTACCGCCATGATTTTTACCCG‑AAAGCCtgtt > 1:156371/1‑237 (MQ=255) ggCGAAATATTATTACTTATTACGGGGTTGATACACGAAATTTAAATTCA‑ATATTCTGGGTGGAAAAAAAGATAAAACCATTTTTTAATTGGGAGTTTG‑GGG‑GGGGAATTTTTACGAAAAAAAGC‑AACAAGTGGAA‑GTTTCCAAG‑AG‑GAGA‑GAAGTTAAAAGGCAACAGGTAGGA‑AAAAGGTAGACG‑GAA‑GTTGTCGTAATC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGAc < 2:1329746/238‑1 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCCGACAAATAC‑AAAAAATGG‑A‑GGTGGCCTG‑AT‑GAGA‑GAAAGTAATAAAAAAAAAGCAGGG‑AATAAATTTAAA‑GAG‑AATTTCGCCAAA‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCCGATGAAgtg > 1:507303/1‑239 (MQ=255) cgaaaTATTCATTCTTATTTTCGGTTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACgt < 1:1272623/235‑1 (MQ=255) gaaaTATTCATCTTTATTTCGTCGTTGATACACGAA‑TTTTAAATACAATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCCCATTTTAAGTGGTAGTTCGCGGC‑GGTAATTTTTCCCAAACAAATAC‑AAAAACGGG‑A‑GTTCCCCTG‑AT‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCACCAGGCAGTG‑AATAAGTTGCCA‑GAA‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACgtg < 2:561957/236‑1 (MQ=255) ttttcattcTTATTTTCGCTTTTATACACGAACTTTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAAACAAATAC‑AAAAACGGG‑A‑GTGGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGCGGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:28948/237‑1 (MQ=255) tatgtattcTTATTGCCTCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCGCATTTTTAGGGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAA‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCTTG‑AG‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTGACA‑GGG‑ATGGCCGTTACC‑TTTTCCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1342860/234‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTATTTTCGCGTTGATTCACGAATTGTTAATTAC‑ATATTCAGGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTGGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:7648/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATT‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTAcc < 1:735171/201‑1 (MQ=255) cattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCGACAAATAC‑AAAAAATGG‑A‑GTTGCCCTG‑AT‑GAGC‑GGAAGGAATAAAGAACAAGCAGTG‑AAAAAGATGACA‑GAG‑AATGTCGCCAAA‑TTTAACGCCATGATTTTTAACCG‑AATGCCTGATGACGTGGGGGGTaaa > 1:561957/1‑239 (MQ=255) attcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAAAAC‑AAAAAATGG‑A‑GGTTCCCTG‑AT‑GAGG‑GAAAATAATAAGCAAAAAGCAAGG‑AATAAATTGTCA‑GAG‑AATGTCGCTAAC‑TTTAACCCCATGCTTTTTACCCG‑AAAGCCCGGTGACGggggggggaaa > 2:1272623/1‑233 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:871887/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTGC‑ATACTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAAACAAATAC‑AAAAAGTGG‑A‑GTTGCCTTG‑AG‑GAGC‑AAAAGTAAAAAGCAACGGGCATTA‑AAAAAGTGAACA‑GAG‑TTTTTCTCTAAT‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:992903/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAATTTTTCAGACAAAAAA‑AAAAAATAG‑A‑GGTGTCAAT‑AT‑GTGC‑GGAAGTAATAAAAAACACGCAGTG‑AATAAAGTTACA‑GAG‑ATTGTGGCTAAC‑ATTACCGCCCATATTTTTATCCC‑CATACCTGATAAGAGGGGGGGTAAACAaaaa > 1:883698/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAAATTTTTCAAACAAAAAA‑AAAAAAAGG‑A‑GTTTGCATT‑GT‑TGGC‑GGAAAGAATAAACAAAACGCAATGAAAAAAATTGA‑A‑GAG‑AATGTTGGTAAA‑CTTACCCCCCTAGTTTTTTCCCG‑AATTCCCGTTCAAGAGGGGGAGAAACAaaaa > 2:1293926/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTCCAAACAAATAA‑AAAAAATGG‑A‑GGTGCCCTG‑AT‑GAGC‑GCAAAGAAAAAGCAAAAAGCAGTG‑AATAAGATGAGA‑GAG‑ATTGTCGGTAAC‑TTTTCCGCCCAGAATTCTTCCCC‑AATGACTCAAGAAGAGGGGGGtaaaataaaaaa > 1:1028344/1‑237 (MQ=255) tGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAA‑AAAAAATGG‑A‑GGTGCCATG‑AT‑TAGG‑GAAAGGAATAAGCAAAAAGCAGGG‑AATTAATTGACA‑GAG‑ATTGTTTCTAAC‑TTTTCCGCCCTGATTTTTACCCC‑CATGCCTGATGAAGTGGGGGGTAAACTTAAAAAGCT‑AAAGGATGCCGGAAcac > 1:1194302/1‑236 (MQ=255) ttAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGGAATTTTTCAAAACAAAAAA‑AAAAATGGG‑G‑GTTG‑CATG‑ATGGGGG‑GAAGGAAAAAAAAAAAAGGCAG‑G‑AATAAATTGAAA‑GAGAATTTTGGTTAAT‑TTTACCACAATATTTTTTACTGA‑AATG‑CTGATAGAGTGGGGGGTAAAACAAAAAAGAT‑AAAGGATTCCGaaaaagag > 2:273912/1‑233 (MQ=255) ttAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:303499/214‑1 (MQ=255) aTTAC‑ATATCCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAATAA‑AAAAACGGG‑A‑GTTGCCATG‑AG‑GGGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGAAGTG‑AATAAGTTGAAA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGa < 1:674231/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAATAC‑AAAAACTTG‑G‑GTTTCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGAAATAAAAAAAAGGCATTG‑AGTTAAATGACA‑GCA‑ATTATCGCTTAC‑TTTACCCCCATGATTTTTACCCG‑AATGCCCTCTGACGTGGTGGGTAAAATAAAAAAGAT‑AAAGGATGCCGAAAAGTAGTCGATgggg > 1:707493/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACCAAAAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGG‑GAAAAGAATAAACAAAAGGCAGTG‑AAAAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTATCGCCACGCTTTCTACCCC‑AAAGCCTGATGACGTGGGGGGTAAAATAAAAAAGCT‑AAAAGATGCCCAAACATCGTCCGTgggg > 2:774665/1‑239 (MQ=255) tatTCACGTGTGCAAAAAATATAAAACCTATTTTTTAGTGGGAGTTTGTGGC‑GTTGAATTTTCCCAGACAAAAAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTT‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCTCTACC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:480142/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGTTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1166729/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACGGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:772923/239‑1 (MQ=255) atTGACGGTGGCAAAAAATACAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAA‑AAAAGCTGG‑A‑GTTGCTAGG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAAGAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGaa < 2:86550/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAC‑AAAAACTGG‑A‑GGTGCCATG‑AT‑GAGC‑GGAAGTAAAAAACAAAAAGCAGGG‑AATAAATTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCCTGATTTCTACCCG‑AATGCCCGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAAAAACT‑AAAAGATGGCGAAACGTCGTCGGTggggga > 2:896696/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAC‑AAAAAATGG‑A‑GTTTTCCTG‑GT‑GAGC‑GAAAAGAATAAAAAAAAAGCAGAG‑AATAAGATGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTTTCGCCCAGATTTCTACCCGCAATG‑CTGATGGCGTGGGTGATTAAATAAAACAGATAAAAGGATgtctcttttacaaatatgtc > 2:303499/1‑218 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAATAC‑AAAAAATGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAATTAAAAGCAAAAAGCAGTG‑AATAAGATGAGA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑ATTTACGCCATGCTTTTTAACCG‑GATACCTGATGAAGGGGGGGGTAAAAAAAAACAGCT‑AAAGGAGGCCGAAACGGCGTCGCTggggga > 1:48406/1‑237 (MQ=255) tgcagggTGGAAAAAAATATAAAACCACTTGGTTGGGGGTAGTTGGTGGC‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAAAAA‑AAAAACGGG‑A‑GTGGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAAGAGGAAGGA‑AGTAGGTTGAAG‑GAG‑ATTGTCGATAAT‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:127005/232‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAAATTTTTCAAACAAAAAA‑AAAAAAAGG‑AGGTTGCC‑TG‑AT‑GAGG‑GGAAAAAATAAACAACAAGAAAGG‑AATAAGATGATC‑GAG‑ATTGTCGCCAAC‑ATTTCCGCCCCAATTTTTACCCG‑AAAGGCTGATGACGTTGGGGGGAAAATCAAACCGCT‑AAAAGAAGCCGAAAAATCGGCGGTTGGGaaaa > 2:191838/1‑239 (MQ=255) tgggTGGAAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGGAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCAAGACAAATAA‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑GT‑GAGA‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAATTTGACA‑GAA‑ATTGGCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:301350/237‑1 (MQ=255) gggggCAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GATGATTTTTTCCAGAAAAACAC‑AAAAGCTGG‑G‑TTTGCGATG‑AT‑GGGC‑CAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTGGACA‑GAG‑ATTGGCGCTAAC‑TTGACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:779950/236‑1 (MQ=255) gggacAAAAAATAAAAAACCCTCTTTTTAGTGGTATTTTGTGGG‑GGTGAAATTTTACAGAAAAATCA‑AAAAGCGTG‑A‑TGTGCAATG‑AT‑GGGC‑AAAAATAATAAACATTAGGCAGTT‑AAGAAGTTGACG‑GAT‑ATTGTCTTTAAC‑TCTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1046192/234‑1 (MQ=255) ggagaaaaaaaTATAAAACCAAATTTTTAGTGTTATTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCAAGACAAATAA‑AAAAACTGG‑A‑GTGGCCATG‑AG‑GAGC‑AAAAGTAAAAACCAAGAGGAATTA‑AATAAGTTGAAG‑GAG‑ATTGCCG‑TAACTTTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1028344/233‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCCAGAAAAAT‑AAAAAATTG‑A‑GGTGCAACG‑AT‑AAGG‑GAAAGAAATAATTCACAGGCAGGG‑ACTAAGTTGTTA‑GAG‑AATGTTGCTAAC‑CTTACCGACATTGTTTATACCCG‑AAAGCCTTATTACGTGGTGGAAAAACTAAAAAACCT‑AAACGAAGTCCAAACGTGGTCGGTGGGGAAAATTATc > 1:1298972/1‑238 (MQ=255) cAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGAAAAATAA‑AAAAAATGG‑A‑GGTGTCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAAAAAAAAAAAAGCAGGG‑AATAAGATGACA‑GAG‑ATTGGCGCTAAA‑TTTACCGCCATGATTTTTACCCG‑AATGGCTGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAGCT‑AAAAGGAGCCCAAAAGTCGTCGATGGGGGAAAATATCTAcc > 1:949350/1‑239 (MQ=255) aaTAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCAGG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTAACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1194302/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaacaaattttttGGTGGTGTTTGGGGGC‑GGTAAATTTTTCCAAAAAAAAAA‑AAAAAGGGG‑A‑GTGGAAAGG‑AT‑G‑GC‑AAAAAGAAAAAGGAAAAGGGAATT‑AAAAAAGTGAAAGGAG‑ATTGTGGCAAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGa < 2:875258/226‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAAACAAAAAC‑AAAAAATTG‑G‑GGTTTCATG‑GT‑GAGG‑GGAAGTAAAAAACAAAAGGCAGAG‑AAAAAATTGAAA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCCTGATTTTTTCCCC‑CAAGCCTGATGACGGGGGGGGTAAAATAAAAAAACT‑AAAAGAAGACGAAAAGGCGTCGGTGGGGGAAAATATTTACCACACGATGTTTGacaac > 2:531321/1‑239 (MQ=255) gtttgggggC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAGCTGG‑A‑GTGGCCATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AAAAAGTGGCAA‑AAG‑TTTGTCCTTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTTCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:88424/232‑1 (MQ=255) atttggtgGC‑GGTGAATTTTTCCAAAAAAATAC‑AAAACCTGG‑A‑GTATCCATG‑AT‑GGAC‑GAAATAAAAAACAAACAGGCATTG‑AATAAGTTATCA‑TAT‑ATTTTCGCTAAT‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:707493/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGG‑GGTAAATTTTCCAAAAAAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTG‑CATGAAG‑GAGC‑AAAATTAAAAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTGAACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTGACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:1019870/239‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACCAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GGTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAACAAAAGGCAGTG‑AATAAGATGACA‑GAG‑ATTGTTGCTAAC‑TTTACCCCCATGCTTTCTACCCG‑AAAGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAAAGCT‑AAAGGATGCCGAAAAGTCGTCGGTGGGGAAAAATATCTACCATAAAATGTTTGACAACATACAAAAAACGa > 1:1000310/1‑239 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑TTTGCAAGG‑AG‑GAGC‑GAAAGTAAGAAGCAACAGGCGGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:117489/239‑1 (MQ=255) ttGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGAtt < 1:284448/238‑1 (MQ=255) tgGC‑GGTAAATTTTCCCAGACAAATAA‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑AAGC‑GAAAGAAAAAACCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:272301/238‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTTCCAAAAAAATAA‑AAAAACGGG‑A‑GTTGCAATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGa < 1:531321/238‑1 (MQ=255) | GAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGG‑A‑GTTGCCATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATGATTTCTACCCG‑AATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCT‑AAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_000913/3206200‑3206668 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |