| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,206,475 | T→A | 15.9% | S5R (AGT→AGA) ‡ | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,206,475 | 0 | T | A | 15.9% | 159.4 / 7.5 | 103 | S5R (AGT→AGA) ‡ | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/56); new base A (7/9); total (34/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTT > NC_000913/3206241‑3206703 | cAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGtaat < 1:894721/238‑1 (MQ=255) aGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAATACAAAAAA‑ATGG‑G‑GTTG‑‑C‑ACG‑TT‑GAGC‑GGAAGaaataa > 1:875258/1‑239 (MQ=255) gCTATTCAGCAGCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCACAGTGTATTCCGCAACACATTGCCAGTCCCTGCTCTGGCGCAAGATTCATTCTTATGTGCTCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGGAAAAAATATAGAACCGCATTTGTAGTGGTAGATTGTGGC‑GGTGAAGTTTTCCAGACAAATAC‑AATAA‑CTAG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGtaataa < 2:930485/238‑1 (MQ=255) tATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGc < 2:282520/238‑1 (MQ=255) caTTCAGCATCGGTAAGTATTCGCAGTTGTGGTAAGCGCGCTGTATTTCGCATAACAATGGCATTCTCTGCTCTGGCGCAATATTCTTTCTTATTGTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCGGGGTCGGAAGAAATATAAAACCACATCGTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCTAGTCAAATAC‑ACAAG‑CTGG‑A‑GTTG‑CT‑ATC‑AT‑GAGC‑TAAAGtaacgagc < 2:1312143/237‑6 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:719283/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:356970/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:57842/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:835962/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:738001/237‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAATAA‑AAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑GT‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCaaacgacaggg > 1:740417/1‑230 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAAC‑AAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGG‑GCAAGGAAAAAACAAAAAGCaagg > 1:772923/1‑236 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGAGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTTAGACAAAAAC‑AAAAA‑CAGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑GC‑GAGG‑GAAAGAAATAAACAACAGAAAGTg > 1:251238/1‑239 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑aa < 2:1119944/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑aa < 2:688796/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑aa < 1:722731/238‑1 (MQ=255) aaTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCGCATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGT‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAAAAGGCAGTG‑aaga < 2:151113/239‑3 (MQ=255) ttATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAg < 1:76192/239‑1 (MQ=255) tATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGt < 1:1011294/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACa < 2:193477/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑gag‑a < 1:1030916/238‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCt < 2:237923/239‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGAAAAATAA‑AAAAA‑AATG‑G‑GGTG‑GC‑ATG‑AT‑TAGC‑GAAAGGAATAAACAAAAAGAAGGG‑AATAAAATGACA‑GAG‑Atttttgccaa > 1:983174/1‑231 (MQ=255) aGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGAAAAAAAC‑AAAAA‑CTTG‑A‑GTTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGG‑GGAAGTAATAAACAAAAGGCAGTG‑AATAAATTGACA‑GAG‑ATTGttggttaatt > 1:503738/1‑230 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAAAAA‑AAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑GC‑ACG‑AT‑GAGC‑GGGAGGAATAAGTAACAAGGAGAG‑AAAAAATTGGCA‑GAG‑ATTTTCTCTTAA‑TTT‑a > 1:1225525/1‑239 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑Acc < 1:824393/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACTTTGCCATTCCCTGCCTTGGCGCAATTTTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTATTTAC‑ATATTCAGGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑TTTGTCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCa < 2:1225525/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCATCCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTGTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGGGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCa < 2:1128342/239‑1 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGC‑ATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGTACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAGTTTTTCCGTGAAATAC‑AAAAA‑CCAG‑A‑GCTG‑GT‑ATG‑GT‑GATA‑GGGCGTAATAAGCAACAAGGAGAG‑GGTAAAATGAAA‑GGG‑GTTGTGCCTAAG‑TTT‑ACCGCCATGAtgta > 2:779950/1‑236 (MQ=255) cATTGCCATCCCTTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGGGGGAGTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCt < 1:696702/239‑1 (MQ=255) cacccctttctctGGCGCATTATATATTCTGATTACCGAGTTGAACAACGAACTGTTAAATGC‑ATATGCCGGGGGGAAAAAAATATAAATCAACATTTGTAGTGGGATGTTGGGGG‑GGTGATTTTAACAAAAAAAAAAA‑AAAAA‑CAGG‑A‑GTTT‑CC‑ATA‑AG‑GCGC‑TAAAAAAATAAGCAACAGACGGAA‑AAAAAGTATACA‑GAG‑TTTGCCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 2:318866/230‑1 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGTTTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAAACAAATAC‑AAAAA‑TTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑AAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTGGAAA‑GAG‑ATTGTCCCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:95797/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACAAATAC‑AAAAA‑CAGG‑A‑GGTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGA‑GAAAAAAAAAAACAAAACACAGGG‑GAAAAATTTAAA‑AGG‑AATTTAGCTCAC‑TTT‑ACCGCCCACATTTTTTCCCGaaag > 2:634911/1‑236 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGCGAAATTTTTCAGAAAAAAAC‑CAAAA‑ACGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑GA‑GCGCGGAAAATAA‑AAGCAAAAGACAGAG‑GAAAAAATTACA‑GCG‑AATGTGTATAAC‑ATT‑ACCGccctcaattttatccagaaca > 2:811517/1‑220 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGGAAAAAAC‑AAAAA‑CTTG‑C‑GTTG‑CC‑ACT‑CT‑TTGT‑GCAAGGAATAAGCAACAGGCCGAG‑GATAAGATGGCA‑GAG‑ATTTTCGGCAAA‑TTT‑ACCGCCATGATTTTTACCCGAAAGCCtgtt > 1:156371/1‑237 (MQ=255) ggCGAAATATTATTACTTATTACGGGGTTGATACACGAAATTTAAATTCA‑ATATTCTGGGTGGAAAAAAAGATAAAACCATTTTTTAATTGGGAGTTTG‑GGG‑GGGGAATTTTTACGAAAAAAAGC‑AACAA‑GTGGAA‑GTTT‑CC‑AAG‑AG‑GAGA‑GAAGTTAAAAGGCAACAGGTAGGA‑AAAAGGTAGACG‑GAA‑GTTGTCGTAATC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAc < 2:1329746/238‑1 (MQ=255) cgaaaTATTCATTCTTATTTTCGGTTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 1:1272623/235‑1 (MQ=255) gaaaTATTCATCTTTATTTCGTCGTTGATACACGAA‑TTTTAAATACAATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCCCATTTTAAGTGGTAGTTCGCGGC‑GGTAATTTTTCCCAAACAAATAC‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTC‑CC‑CTG‑AT‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCACCAGGCAGTG‑AATAAGTTGCCA‑GAA‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:561957/236‑1 (MQ=255) ttttcattcTTATTTTCGCTTTTATACACGAACTTTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAAACAAATAC‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGCGGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:28948/237‑1 (MQ=255) tatgtattcTTATTGCCTCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCGCATTTTTAGGGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAA‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑TTG‑AG‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTGACA‑GGG‑ATGGCCGTTACC‑TTT‑TCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1342860/234‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATT‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑Acc < 1:735171/201‑1 (MQ=255) cattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCGACAAATAC‑AAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGC‑GGAAGGAATAAAGAACAAGCAGTG‑AAAAAGATGACA‑GAG‑AATGTCGCCAAA‑TTT‑AACGCCATGATTTTTAACCGAATGCCTGATGACGTGGGGGGTaaa > 1:561957/1‑239 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:871887/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTGC‑ATACTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAAACAAATAC‑AAAAA‑GTGG‑A‑GTTG‑CC‑TTG‑AG‑GAGC‑AAAAGTAAAAAGCAACGGGCATTA‑AAAAAGTGAACA‑GAG‑TTTTTCTCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:992903/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAATTTTTCAGACAAAAAA‑AAAAA‑ATAG‑A‑GGTG‑TC‑AAT‑AT‑GTGC‑GGAAGTAATAAAAAACACGCAGTG‑AATAAAGTTACA‑GAG‑ATTGTGGCTAAC‑ATT‑ACCGCCCATATTTTTATCCCCATACCTGATAAGAGGGGGGGTAAACAaaaa > 1:883698/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAAATTTTTCAAACAAAAAA‑AAAAA‑AAGG‑A‑GTTT‑GC‑ATT‑GT‑TGGC‑GGAAAGAATAAACAAAACGCAATGAAAAAAATTGA‑A‑GAG‑AATGTTGGTAAA‑CTT‑ACCCCCCTAGTTTTTTCCCGAATTCCCGTTCAAGAGGGGGAGAAACAaaaa > 2:1293926/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTCCAAACAAATAA‑AAAAA‑ATGG‑A‑GGTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGC‑GCAAAGAAAAAGCAAAAAGCAGTG‑AATAAGATGAGA‑GAG‑ATTGTCGGTAAC‑TTT‑TCCGCCCAGAATTCTTCCCCAATGACTCAAGAAGAGGGGGGtaaaataaaaaa > 1:1028344/1‑237 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTTCCACAAAAAA‑AAAAA‑ATTG‑A‑GTGT‑CC‑ACT‑GT‑TAGC‑GGAAATAATAAGCAAAACGAAGCG‑AATAAAATGAGA‑GAG‑AATTTTGTTAAA‑CTT‑TCCGCCAAGATTTCTACCCCGAAACCTGAGGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAGCTaaaa > 1:86550/1‑238 (MQ=255) tGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAA‑AAAAA‑ATGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑TAGG‑GAAAGGAATAAGCAAAAAGCAGGG‑AATTAATTGACA‑GAG‑ATTGTTTCTAAC‑TTT‑TCCGCCCTGATTTTTACCCCCATGCCTGATGAAGTGGGGGGTAAACTTAAAAAGCTAAAGGATGCCGGAAcac > 1:1194302/1‑236 (MQ=255) ttAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGGAATTTTTCAAAACAAAAAA‑AAAAA‑TGGG‑G‑GTTG‑‑C‑ATG‑ATGGGGG‑GAAGGAAAAAAAAAAAAGGCAG‑G‑AATAAATTGAAA‑GAGAATTTTGGTTAAT‑TTT‑ACCACAATATTTTTTACTGAAATG‑CTGATAGAGTGGGGGGTAAAACAAAAAAGATAAAGGATTCCGaaaaagag > 2:273912/1‑233 (MQ=255) ttAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:303499/214‑1 (MQ=255) aTTAC‑ATATCCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAATAA‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AG‑GGGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGAAGTG‑AATAAGTTGAAA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGa < 1:674231/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTTG‑G‑GTTT‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGAAATAAAAAAAAGGCATTG‑AGTTAAATGACA‑GCA‑ATTATCGCTTAC‑TTT‑ACCCCCATGATTTTTACCCGAATGCCCTCTGACGTGGTGGGTAAAATAAAAAAGATAAAGGATGCCGAAAAGTAGTCGATgggg > 1:707493/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACCAAAAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGG‑GAAAAGAATAAACAAAAGGCAGTG‑AAAAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ATCGCCACGCTTTCTACCCCAAAGCCTGATGACGTGGGGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAAGATGCCCAAACATCGTCCGTgggg > 2:774665/1‑239 (MQ=255) tatTCACGTGTGCAAAAAATATAAAACCTATTTTTTAGTGGGAGTTTGTGGC‑GTTGAATTTTCCCAGACAAAAAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTT‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCTCTACC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:480142/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1166729/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:772923/239‑1 (MQ=255) atTGACGGTGGCAAAAAATACAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAA‑AAAAG‑CTGG‑A‑GTTG‑CT‑AGG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAAGAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGaa < 2:86550/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GGAAGTAAAAAACAAAAAGCAGGG‑AATAAATTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCCTGATTTCTACCCGAATGCCCGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAAAAACTAAAAGATGGCGAAACGTCGTCGGTggggga > 2:896696/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAATAC‑AAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAATTAAAAGCAAAAAGCAGTG‑AATAAGATGAGA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑ATT‑TACGCCATGCTTTTTAACCGGATACCTGATGAAGGGGGGGGTAAAAAAAAACAGCTAAAGGAGGCCGAAACGGCGTCGCTggggga > 1:48406/1‑237 (MQ=255) tgcagggTGGAAAAAAATATAAAACCACTTGGTTGGGGGTAGTTGGTGGC‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAAAAA‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAAGAGGAAGGA‑AGTAGGTTGAAG‑GAG‑ATTGTCGATAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:127005/232‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAAATTTTTCAAACAAAAAA‑AAAAA‑AAGG‑AGGTTG‑CC‑‑TG‑AT‑GAGG‑GGAAAAAATAAACAACAAGAAAGG‑AATAAGATGATC‑GAG‑ATTGTCGCCAAC‑ATT‑TCCGCCCCAATTTTTACCCGAAAGGCTGATGACGTTGGGGGGAAAATCAAACCGCTAAAAGAAGCCGAAAAATCGGCGGTTGGGaaaa > 2:191838/1‑239 (MQ=255) tgggTGGAAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGGAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCAAGACAAATAA‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑GT‑GAGA‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAATTTGACA‑GAA‑ATTGGCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:301350/237‑1 (MQ=255) gggggCAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GATGATTTTTTCCAGAAAAACAC‑AAAAG‑CTGG‑G‑TTTG‑CG‑ATG‑AT‑GGGC‑CAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTGGACA‑GAG‑ATTGGCGCTAAC‑TTG‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:779950/236‑1 (MQ=255) gggacAAAAAATAAAAAACCCTCTTTTTAGTGGTATTTTGTGGG‑GGTGAAATTTTACAGAAAAATCA‑AAAAG‑CGTG‑A‑TGTG‑CA‑ATG‑AT‑GGGC‑AAAAATAATAAACATTAGGCAGTT‑AAGAAGTTGACG‑GAT‑ATTGTCTTTAAC‑TCT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1046192/234‑1 (MQ=255) ggagaaaaaaaTATAAAACCAAATTTTTAGTGTTATTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCAAGACAAATAA‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AG‑GAGC‑AAAAGTAAAAACCAAGAGGAATTA‑AATAAGTTGAAG‑GAG‑ATTGCCG‑TAACTTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1028344/233‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCCAGAAAAAT‑AAAAA‑ATTG‑A‑GGTG‑CA‑ACG‑AT‑AAGG‑GAAAGAAATAATTCACAGGCAGGG‑ACTAAGTTGTTA‑GAG‑AATGTTGCTAAC‑CTT‑ACCGACATTGTTTATACCCGAAAGCCTTATTACGTGGTGGAAAAACTAAAAAACCTAAACGAAGTCCAAACGTGGTCGGTGGGGAAAATTATc > 1:1298972/1‑238 (MQ=255) aaaataAACCCAATTTTTTAGGGTTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTATCAAGAAAAAAAA‑AAAAA‑TTGG‑A‑GTGG‑CT‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTA‑AATAAGACGAGA‑GGA‑TTTGCCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:429396/236‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑AGG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTAACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1194302/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaacaaattttttGGTGGTGTTTGGGGGC‑GGTAAATTTTTCCAAAAAAAAAA‑AAAAA‑GGGG‑A‑GTGG‑AA‑AGG‑AT‑G‑GC‑AAAAAGAAAAAGGAAAAGGGAATT‑AAAAAAGTGAAAGGAG‑ATTGTGGCAAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGa < 2:875258/226‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAAACAAAAAC‑AAAAA‑ATTG‑G‑GGTT‑TC‑ATG‑GT‑GAGG‑GGAAGTAAAAAACAAAAGGCAGAG‑AAAAAATTGAAA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCCTGATTTTTTCCCCCAAGCCTGATGACGGGGGGGGTAAAATAAAAAAACTAAAAGAAGACGAAAAGGCGTCGGTGGGGGAAAATATTTACCACACGATGTTTGacaac > 2:531321/1‑239 (MQ=255) gtttgggggC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAG‑CTGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AAAAAGTGGCAA‑AAG‑TTTGTCCTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTTCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:88424/232‑1 (MQ=255) atttggtgGC‑GGTGAATTTTTCCAAAAAAATAC‑AAAAC‑CTGG‑A‑GTAT‑CC‑ATG‑AT‑GGAC‑GAAATAAAAAACAAACAGGCATTG‑AATAAGTTATCA‑TAT‑ATTTTCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:707493/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGG‑GGTAAATTTTCCAAAAAAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑‑C‑ATGAAG‑GAGC‑AAAATTAAAAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTGAACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTG‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:1019870/239‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACCAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAACAAAAGGCAGTG‑AATAAGATGACA‑GAG‑ATTGTTGCTAAC‑TTT‑ACCCCCATGCTTTCTACCCGAAAGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAAAGCTAAAGGATGCCGAAAAGTCGTCGGTGGGGAAAAATATCTACCATAAAATGTTTGACAACATACAAAAAACGa > 1:1000310/1‑239 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑TTTG‑CA‑AGG‑AG‑GAGC‑GAAAGTAAGAAGCAACAGGCGGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:117489/239‑1 (MQ=255) ttGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGAtt < 1:284448/238‑1 (MQ=255) tgGC‑GGTAAATTTTCCCAGACAAATAA‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑AAGC‑GAAAGAAAAAACCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:272301/238‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTTCCAAAAAAATAA‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CA‑ATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGa < 1:531321/238‑1 (MQ=255) tttCAAGAAAAAAAA‑AAAAA‑CTGG‑G‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑AAAAGAAATAAGCAACAGGAAGTG‑AATAAGTTGACA‑GGA‑ATTGCCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 2:945321/239‑1 (MQ=255) tttcaaaaaaaaAC‑AAAAAGCTGG‑A‑GTGC‑GA‑ATG‑AT‑GAGA‑GAAAGGAATAAAAAACAGGCGGTG‑AAAAAGTGGACA‑GAG‑TGTGTCGTTACC‑TTT‑CCCGCCAGGATTTCGACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 2:713947/231‑1 (MQ=255) acagaaCAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑‑‑GTTG‑CCAATA‑AG‑GAGC‑GAAAGAAATAAGCAACAGGCAGAA‑AATAAGTTAAAA‑GAG‑ATTGTCGC‑AAC‑TTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 2:251238/234‑1 (MQ=255) aaaaaTAA‑AAAAA‑CTAG‑‑‑GTTGCCC‑ATG‑AT‑GAGA‑AAAATGAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 2:527294/237‑1 (MQ=255) aaaaaAC‑AAAAA‑TGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AA‑GAGG‑AAAAGGAAAAAGCAACGGGAAGTA‑AAAAAGTGAACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTc < 2:59070/236‑1 (MQ=255) aaaTAC‑AAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATA‑AT‑GAGG‑AAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTA‑AATAAGTTGAAA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAgg < 1:1293926/239‑1 (MQ=255) aaaa‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑AGG‑AT‑GAGC‑AAAAATAATAAGCAAGAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTACT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:507303/239‑1 (MQ=255) aaaa‑CGGG‑A‑GTTT‑CC‑AGG‑AG‑GAGC‑AAAATTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AAAAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 1:509066/239‑1 (MQ=255) aa‑CTGG‑A‑TTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑AAAAGTAAAAAGCAAAAGGAAGTG‑AATAAGTTGAAA‑GGT‑ATGGCCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:981200/239‑1 (MQ=255) aa‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTA‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTACC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:792659/239‑1 (MQ=255) aa‑CGGG‑T‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGG‑AAAAATAATAAACAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGAAG‑GAG‑ATTGCCGTAAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:395858/239‑1 (MQ=255) a‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACGCCGGGga > 1:798271/1‑239 (MQ=255) g‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 2:204027/1‑239 (MQ=255) g‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1270539/1‑238 (MQ=255) g‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1009050/1‑238 (MQ=255) c‑ATG‑AT‑GAGG‑AAAAGTAATAAGAAACTGTCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATGGTCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 1:176245/238‑1 (MQ=255) c‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGCCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 1:896696/238‑1 (MQ=255) aatg‑ag‑gAGC‑AAAGATAAAAAGCAACGGGCAGGG‑AATAAGTTGCAA‑GAG‑ATTGCGGCAAAT‑TTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTGCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 2:740454/237‑1 (MQ=255) aagggt‑gaGC‑AAAAGAAATAAGAAACAGGCAGTG‑AAGAAGTTGAAA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 2:740417/233‑1 (MQ=255) at‑gaGC‑AAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:73660/96‑1 (MQ=255) gggggaaagaaaAAAACACAAGGCATTA‑AATATGTTGAAG‑GAG‑CTGGTCTATAAT‑TTT‑CCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTTGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTCCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGtt < 2:1260604/234‑1 (MQ=255) | CAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGC‑GAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTG‑AATAAGTTGACA‑GAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTT > NC_000913/3206241‑3206703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |