| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,245,024 | 0 | A | G | 3.4% | 427.5 / 2.2 | 117 | intergenic (‑285/‑198) | uxaC/exuT | uronate isomerase/hexuronate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/53); new base G (2/2); total (62/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CTCAACGAGTGAGCTAGCTTGCTTATGGTGCGATGCTGACAAAGTTATCACACCAATTTCCAGAGTCCGAAGATATTTTCGTGAGTTAGATCAATAAACGTAGTTAAAAAAATTACTCTCAAAGTGGTAAATCTCGCTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTA‑TGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATG‑CAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGCCGAATTAGCACGAAACTTTCATGGCAACGTTCGGGGCGTGCCGGTTTTTTTTCGGTTACCCGGTCGTAACTAACATCTTCAGCCTCTGGCGGGATGATGGCCGCGCTTCCTGCGGATATAACAAAACGATGAGGTTTTACATGCGTAAAATTAAAGGGTTACGTTGGTATATGATCGCACTGGTGACGCTCGGCACCGTGCTTGGTTACCTGACGCGTAACACTGTG > NC_000913/3244752‑3245308 | cttgcttATGGTGCGATGCTGACAAAGTTATCACACCAATTTCCAGAGTCCGAAGATATTTTCGTGAGTTAGATCAATAAACGTAGTTAAAAAAATTACTCTCAAAGTGGTAAATCTCGCTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTA‑TGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATG‑CAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATg > 2:651061/1‑289 (MQ=255) 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CTCAACGAGTGAGCTAGCTTGCTTATGGTGCGATGCTGACAAAGTTATCACACCAATTTCCAGAGTCCGAAGATATTTTCGTGAGTTAGATCAATAAACGTAGTTAAAAAAATTACTCTCAAAGTGGTAAATCTCGCTGCAGGCCGCGCCAGTACTGGCCTTGCTGTCGTCAGGTAATGTCCCTACAAATATTCCCACATTTGTGATGGCTCTCACCTTTTAAAGTTGTA‑TGACAAGTTATCTTTCTGCCGTCGCAAATCATAAGTCGACGGAATG‑CAAATTGCCGATTCATTCATTTGTTAGATGAATCGGGTTAACCGGTACGGAAGCCGAATTAGCACGAAACTTTCATGGCAACGTTCGGGGCGTGCCGGTTTTTTTTCGGTTACCCGGTCGTAACTAACATCTTCAGCCTCTGGCGGGATGATGGCCGCGCTTCCTGCGGATATAACAAAACGATGAGGTTTTACATGCGTAAAATTAAAGGGTTACGTTGGTATATGATCGCACTGGTGACGCTCGGCACCGTGCTTGGTTACCTGACGCGTAACACTGTG > NC_000913/3244752‑3245308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |