| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1697335 | 185 (1.060) | 22 (0.130) | 15/186 | 19.1 | 11.2% | coding (706/768 nt) | hdhA | 7‑alpha‑hydroxysteroid dehydrogenase, NAD‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 1697340 | 174 (1.060) | coding (701/768 nt) | hdhA | 7‑alpha‑hydroxysteroid dehydrogenase, NAD‑dependent | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGGTAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1697231‑1697335‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctcgcCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTGCGT < NC_000913/1697340‑1697242 CGGTAAACAACACGCACGGGTGTTTACCGGGCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGGGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AG > 2:2829804/1‑100 GGTAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGC < 1:630302/100‑1 GGTAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGGGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGC > 2:1139072/1‑100 GTAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCT > 1:4072350/1‑100 TAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTC < 2:3914214/100‑1 TAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTC < 1:735602/100‑1 ACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCC > 2:2807717/1‑100 GCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCG < 1:2748971/100‑1 GTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTG < 1:522267/100‑1 TTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TCCCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGG < 1:2654869/100‑1 TTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGG < 2:2868583/100‑1 TGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑TGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGG < 2:1854303/100‑1 TGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGG < 2:1385120/100‑1 TGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGG < 1:2847339/100‑1 TGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGG < 1:956529/100‑1 TGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGG < 1:3729143/100‑1 TTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTA < 2:4114888/100‑1 TTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGCTAA < 2:3976121/100‑1 ACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATCTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGC < 1:3821704/100‑1 CCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCG < 2:3083227/100‑1 CCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCG < 1:3898627/100‑1 CCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCG < 1:2878058/100‑1 TTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCC < 1:3642024/100‑1 CTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGG < 1:1593590/100‑1 TGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGG < 1:873664/100‑1 ACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCTGTTCCTTTGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGG < 2:2003578/100‑1 CACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCTGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTTAGCGGACAATTTCTCACCGTCTCCCGTGGTGGGGTACAGG < 1:3831991/100‑1 ACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCT < 1:150083/100‑1 GCTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCG > 1:1277849/1‑100 CTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGT > 1:1972373/1‑100 CTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGT > 1:949416/1‑100 CTCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGT > 1:1291418/1‑100 TCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTG < 2:119700/100‑1 TCGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTG < 1:3672745/100‑1 CGCCTGCTGCGGGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGCCCGGTAAACAACCGTGC < 2:2548582/100‑1 CGCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTGC < 1:1171132/100‑1 GCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGGTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTGCG < 1:3003342/100‑1 GCCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTGCG < 2:1718318/100‑1 CCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTGCGT < 1:2372341/100‑1 CGGTAAACAACACGCACGGTTGTTTACCGGTCCGTTAGTGTATTAATTGAGCTCCTGTACCCCACCACCGGAGACGGTGAGAATTTGTCCGCT‑TACCC‑AGCTCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1697231‑1697335‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctcgcCTGCTGCGAGCTGGGTAAGCGGACAAATTCTCACCGTCTCCGGTGGTGGGGTACAGGAGCTCAATTAATACACTAACGGACCGGTAAACAACCGTGCGT < NC_000913/1697340‑1697242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |