| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,876,015 | 0 | A | G | 27.7% | 259.5 / 29.4 | 114 | I115V (ATT→GTT) | yeaN | putative MFS transporter, inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/65); new base G (31/0); total (49/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.63e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCG‑CTGGCTTTGAAC‑GGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTCAACAACATGC > NC_000913/1875783‑1876253 | tgttACGATTCGTTCCGCTTACTGGAGAACGACAGCGCAAACCGGTTTATTGACCACCATGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGACATTGGC‑GGTGGGATTGCAt < 2:1145586/236‑1 (MQ=255)ggATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCAt < 1:1533831/239‑1 (MQ=255) tACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTCGGGTTGCAtttg > 1:1699568/1‑237 (MQ=255) aCGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAgg < 1:2329755/239‑1 (MQ=255) gATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCa < 1:46424/239‑1 (MQ=255) gATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCa < 1:1930060/239‑1 (MQ=255) gATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCCAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGCAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGGTCAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGGTTGGCTTAGTCa > 2:1190522/1‑239 (MQ=255) ttCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCaa < 1:104116/238‑1 (MQ=255) tCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATg < 1:763891/239‑1 (MQ=255) gTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGGTTGGTTTAgg > 1:278633/1‑232 (MQ=255) gTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTc < 1:1266401/239‑1 (MQ=255) gCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCtt > 1:847999/1‑236 (MQ=255) ttACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGc < 2:956050/239‑1 (MQ=255) ttACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGc < 1:943406/239‑1 (MQ=255) taccccattgcgacAGCGCAAACCGGCTTATTGACCCCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGcc < 2:2080028/229‑1 (MQ=255) tACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCGCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGcc < 1:1750333/239‑1 (MQ=255) tACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGcc < 1:204161/239‑1 (MQ=255) cgcAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTTGGATTTCGTTCGTCAATGTTTTTATGCCACGGTTTAATTaaagc > 2:2463111/1‑237 (MQ=255) cgcAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGa > 2:1545307/1‑198 (MQ=255) gcAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTACCCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAAc < 2:2516695/236‑1 (MQ=255) tGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAg > 1:2020934/1‑238 (MQ=255) ccATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTg < 1:1676038/195‑1 (MQ=255) ttattGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑At < 2:2408472/213‑1 (MQ=255) attGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAAACTTATCg > 1:2529386/1‑239 (MQ=255) ttGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCgg < 1:765555/239‑1 (MQ=255) ccTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGGTTAATTaaa > 1:86770/1‑200 (MQ=255) ccTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTaaa < 2:86770/200‑1 (MQ=255) 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tcACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAAt < 1:1084398/239‑1 (MQ=255) aCCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGa > 1:288935/1‑146 (MQ=255) aCCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGa < 2:288935/146‑1 (MQ=255) gCCCCGGTGGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGc < 2:1309253/239‑1 (MQ=255) gCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGAATGGAACGTAGCCTGTTTGCCCCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGGTGGGGTTGCTTTGGGTAATGTTTTACGCCCG‑GGATT‑ATTAAAAGCG‑ATTTTGCCCATTCCGTTGCCCTGCCTATCGGCCCAATATTCCTTCACATGGGGAGCTggt > 2:1164219/1‑236 (MQ=255) gcgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTggg < 1:475539/237‑1 (MQ=255) gcgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGa < 1:2322819/238‑1 (MQ=255) gcgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGa < 1:1889928/238‑1 (MQ=255) ttttGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTaaa < 1:969085/157‑1 (MQ=255) gAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGGTTGCATTATGCAATGTCTTTCTGCCA‑GGGTTTATTAAACGCG‑GTTTcc > 2:969085/1‑157 (MQ=255) aCGTAGCCTGTTTGCCGTGTTGCGTTTGAGCTGGGCTGGTATAGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCTGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCG‑c < 2:2425435/239‑1 (MQ=255) 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GGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGC‑GGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCA‑GGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGC‑ATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCG‑CTGGCTTTGAAC‑GGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTCAACAACATGC > NC_000913/1875783‑1876253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |