| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,240,984 | (G)7→8 | coding (1041/1245 nt) | sstT → | sodium:serine/threonine symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,240,977 | 1 | . | G | 94.6% | 563.3 / 24.8 | 166 | coding (1034/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/5); new base G (84/73); total (88/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATC > NC_000913/3240879‑3241071 | ctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑g > 1:4243577/1‑100 (MQ=255) ctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑g < 2:2239906/100‑1 (MQ=255) gCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑ggg < 1:3090702/100‑1 (MQ=255) gCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑ggg > 1:2812876/1‑100 (MQ=255) gTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑ggg‑ggg < 1:3777922/100‑2 (MQ=255) tAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑ggg‑gggtc < 2:1700193/100‑4 (MQ=255) aaTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑ggg‑gggtct > 1:444565/1‑96 (MQ=255) aTACGCTTGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑gg‑ggg‑gggtctc < 1:4627987/100‑6 (MQ=255) tACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑GG‑GGGAGGTctct < 2:1630598/100‑1 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTctgctgc < 2:3785984/100‑1 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGGTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTctgctgc > 2:5358058/1‑100 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGCGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTctgctgct < 2:5001966/100‑1 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTctgctgct < 1:333527/100‑1 (MQ=255) ggTATTGCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTctgctgctg < 2:2984836/100‑1 (MQ=255) aTTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATc < 1:175568/100‑1 (MQ=255) aTTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATc < 2:494455/100‑1 (MQ=255) aTTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATc > 2:266962/1‑100 (MQ=255) aTTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATc > 1:4764630/1‑100 (MQ=255) ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATcc > 1:5128718/1‑100 (MQ=255) tCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATccc < 1:5408985/100‑1 (MQ=255) tCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATccc < 2:296919/100‑1 (MQ=255) tCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATccc < 2:5221767/100‑1 (MQ=255) ccGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:1601612/1‑100 (MQ=255) ccGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:1375556/1‑100 (MQ=255) ccGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 2:4119997/1‑100 (MQ=255) tgTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACt < 2:4819199/99‑1 (MQ=255) ggTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACt < 1:2504865/100‑1 (MQ=255) taTCTCCCCACGGTGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTACCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑GG‑GGGCGGTCTCTGCTGTTGAGCCCACTGGcc < 2:5126451/99‑1 (MQ=255) gATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc < 1:1587861/100‑1 (MQ=255) gATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc < 1:1799614/100‑1 (MQ=255) aTCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:4291532/1‑100 (MQ=255) aTCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCATGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:4187896/1‑100 (MQ=255) aTCCGCCCACGGCGCTGGTGTTGGGGGTGGGGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGG‑GTGGCGGGG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc < 1:2985457/100‑1 (MQ=255) cTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGt > 2:4141494/1‑100 (MQ=255) tGCCCACGGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTa < 1:1541526/100‑1 (MQ=255) tGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTa < 1:561125/100‑1 (MQ=255) cACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAatat > 1:22214/1‑100 (MQ=255) cGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGt > 2:1475039/1‑100 (MQ=255) gcgcTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTc < 1:2279085/100‑1 (MQ=255) ctgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTTCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCGCTGGCCTGTTATATGTTCggc > 1:2190684/1‑99 (MQ=255) gctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCAGCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAt > 1:4823272/1‑100 (MQ=255) tgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGCTCGGTAttt < 1:5431037/100‑1 (MQ=255) gTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTc < 1:2438241/100‑1 (MQ=255) gTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTc < 1:2005263/100‑1 (MQ=255) gTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTc < 2:488403/100‑1 (MQ=255) aGCGTGGTGGCTGCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGCCACCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaag < 2:2390508/100‑2 (MQ=255) gCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACg > 2:1975311/1‑100 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGat > 1:744229/1‑100 (MQ=255) tggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGGCTGTAATATGTTCGGTATTTCTAACGATATCg > 1:4726475/1‑100 (MQ=255) tggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCg > 2:1792890/1‑100 (MQ=255) ggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc > 1:4570347/1‑100 (MQ=255) ggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GGGGC‑‑GGAGGG‑GGTCACTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCCGTATTTCGAACGATATCGc > 1:4953732/1‑100 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTTTTTCGAACGATATTGCCa > 1:3554746/1‑100 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCa < 2:1314867/100‑1 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCa > 2:1469716/1‑100 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCa > 2:3172824/1‑100 (MQ=255) tctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCa < 1:4538260/100‑1 (MQ=255) ctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 2:3998003/1‑100 (MQ=255) ctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 2:2002787/1‑100 (MQ=255) tgtgtgCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAgg < 2:423194/100‑1 (MQ=255) gtgtgCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAggt > 1:5155356/1‑100 (MQ=255) ctgtgCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTATGCTGTTGGTCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAGTTGGAACGATATCGCCATGCGggt > 2:2787677/2‑100 (MQ=255) 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tgtgGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATACGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGcc > 1:4918121/1‑100 (MQ=255) gtgGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 2:3302135/100‑1 (MQ=255) gtgGCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg > 2:4875562/1‑100 (MQ=255) ggCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATCTATTCGGTATTTCGAACGATCTCGCCATGCAGGCCGTTGCCGTc > 1:4853421/1‑100 (MQ=255) ggCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTc > 1:3457186/1‑100 (MQ=255) ggCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTc > 2:2279626/1‑100 (MQ=255) ggCGCATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCGCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTc < 1:1494074/100‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCg < 2:655170/100‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCg > 2:4297449/1‑100 (MQ=255) cgcATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCgg < 1:1142262/100‑1 (MQ=255) cgcATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCgg < 1:3712088/100‑1 (MQ=255) cgcATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCgg < 1:4378822/100‑1 (MQ=255) gcATCCGGG‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGc < 2:2020442/100‑1 (MQ=255) gcATCCGGC‑GGGTCG‑GG‑GGG‑GGCCTCTGGTGCTGAACCCACTGGCCGGTAATATGTTCGGTATTTCCAACGATGGCGCCGGGGAGGTGGTTGCCATCGGc > 2:3642060/1‑100 (MQ=255) cATCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCt > 2:420062/1‑100 (MQ=255) aTCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCtt < 1:1476288/100‑1 (MQ=255) tCCGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCttt > 2:2939077/1‑100 (MQ=255) ccGGC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTa > 1:3651039/1‑100 (MQ=255) cgtc‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTTCCGTCGGCTTTat > 2:2493203/4‑100 (MQ=255) ggC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatc > 1:3950094/1‑100 (MQ=255) ggC‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatc < 2:58034/100‑1 (MQ=255) c‑GTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 2:442031/100‑1 (MQ=255) gTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCCTGCAGGTGGTTGCCGTCGGCCTTatcctc > 2:3061374/1‑100 (MQ=255) gTGGCG‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcatc < 2:5084504/100‑1 (MQ=255) | GGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGC‑GTGGC‑‑GG‑GGG‑GGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATC > NC_000913/3240879‑3241071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |