| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4112782 = | 47 (1.050) | 4 (0.100) | 3/258 | NT | 8.3% | intergenic (+28/‑184) | yiiR/yiiS | DUF805 family putative inner membrane protein/UPF0381 family protein |
| ? | NC_000913 | 4112830 = | 44 (1.050) | intergenic (+76/‑136) | yiiR/yiiS | DUF805 family putative inner membrane protein/UPF0381 family protein | |||||
TTCTGGTGATGATGCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACGGCGCATTATTCTTAAGTC > NC_000913/4112639‑4112929 | ctttcatagggcacctctgtatattcgcctctctgtcgattacgacttaagaataatgcgccgttaagggaagaacaaacaagtaatgatcttatggattaccattttttttgatattgcttaaggtgaagagttcagaaggaTTTTcc > 1:333836‑M1/144‑149 (MQ=255) tcgggTGATGATGCTTATCGACCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGTATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCg < 1:292918/146‑1 (MQ=255) ttcatagggcacctctgtatattcgcctctctgtcgattacgacttaagaataatgcgccgttaagggaagaacaaacaagtaatgatcttatggattaccattttttttgatattgcttaaggtgaagagttcagaaggaTTTTCCgg > 2:561616‑M1/142‑149 (MQ=255) ggTGATGGTGCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑a < 2:511263/149‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCTTAACGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGTTACGATGTGCGTTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑a < 1:224528/149‑1 (MQ=255) tgatgaTGCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑Att < 1:111375/149‑1 (MQ=255) tgatgaTGCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑Att < 1:131377/149‑1 (MQ=255) gatgCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATATCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑Attatta > 2:594154/1‑149 (MQ=255) atgCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAAGTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTAt > 2:669207/1‑149 (MQ=255) gCTTATCGATCTTGGTACGATTGGGGGCACACAAAGAGATAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAAAATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑AATGTTAtgt > 2:734765/1‑147 (MQ=255) cTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTc < 2:314743/149‑1 (MQ=255) cTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTc < 1:510842/149‑1 (MQ=255) ttATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTcc > 2:637806/1‑149 (MQ=255) 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aTACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTTTTTT‑TTTGTTATTTCCA‑AGATGCAATTGACAATACCCGGGAAATCCTGCTGAACTCTTCACCTTAAGCac > 2:726381/1‑148 (MQ=255) tCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATc > 1:753658/1‑149 (MQ=255) tCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACCCTTCACCTTAAGCAATATc > 1:146347/1‑149 (MQ=255) tCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCCATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCAA‑AGATGCAAATGACAATACCCTGAACCTCCTTCTATATTCTTCACCTTACGCAatatt > 2:522994/1‑148 (MQ=255) aGGATGTGTAGTATAAAGCCGACAAGCAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGATCTCTTCACCTTAAGCAATATCaa < 2:694445/149‑1 (MQ=255) 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cAATAAATCAAGAAAATAACCATAAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGTAATCCATAAGAt < 2:304852/149‑1 (MQ=255) aaaTCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCAtt < 1:476222/149‑1 (MQ=255) aaTCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTa < 1:760561/149‑1 (MQ=255) aaTCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTa > 1:63424/1‑149 (MQ=255) aTCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTAc > 1:119808/1‑149 (MQ=255) 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tATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACGGCGCATTATTCTTa > 1:783968/1‑149 (MQ=255) aTTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACGGCGCATTATTCTTaa < 1:637806/149‑1 (MQ=255) tttttttCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCGTAACGGCGCATTATTCTTAAg > 2:363858/1‑149 (MQ=255) ttattttCCGGG‑CTGGTTATTTCCA‑CGATGAAAATGACACTACCCGGAAAATCGTTCCGACCGCTGCACCTTAAACAATATCAAAAAAAAGCGTACTCCATGAGCGCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACAGGGCGTTATTCATAAg > 2:356116/4‑149 (MQ=255) gaTTTTCCGGGTATTGTCATTTGCATCG‑TGGAAATAACAAT‑CCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACGGCGCATTATTCTTAAGt < 2:642153‑M1/147‑1 (MQ=255) tttttCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACGGCGCATTATTCTTAAGTc < 1:669207/149‑1 (MQ=255) | TTCTGGTGATGATGCTTATCGATCTTGGTGCGTTTGTTGGCACACAAGGCGAAAATAAATATGGTAAAGATACTCAGGATGTGAAGTATAAAGCCGACAATAAATCAAGTAATTAACCTTTAATATATCTCTTACTGCTATTTTTTTCCGGG‑ATTGTTATTTCCA‑CGATGCAAATGACAATACCCGGAAAATCCTTCTGAACTCTTCACCTTAAGCAATATCAAAAAAAATGGTAATCCATAAGATCATTACTTGTTTGTTCTTCCCTTAACGGCGCATTATTCTTAAGTC > NC_000913/4112639‑4112929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |