| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,413,542 | A→T | Y67N (TAT→AAT) | ydaC ← | DUF1187 family protein, Rac prophage; putative double‑strand break reduction protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,413,542 | 0 | A | T | 99.2% | 406.6 / NA | 121 | Y67N (TAT→AAT) | ydaC | DUF1187 family protein, Rac prophage; putative double‑strand break reduction protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (54/66); minor base G (1/0); total (55/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CGAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGT > NC_000913/1413397‑1413686 | cGAAGTATCAGGCGTTAGTCAACCCTCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCCCCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCaa < 2:1263935/149‑1 (MQ=255)cGAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTCGACTGACATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCaa > 2:1743693/1‑149 (MQ=255) gAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAAt > 2:1894719/1‑149 (MQ=255) aaGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATg > 1:1259156/1‑149 (MQ=255) cATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCaa < 2:1367656/149‑1 (MQ=255) cATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGACGCCAATGTTACACTGAAGTTGCCTCCCCATGTTGACTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTAAATTCAATGCaa > 2:738987/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATtct > 2:665577/1‑149 (MQ=255) ggCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATtctc > 1:1008697/1‑149 (MQ=255) ccctATTCAACCATCCCCTCTTCTTTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGa < 2:625872/146‑1 (MQ=255) ccGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGTCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGa < 2:1736585/149‑1 (MQ=255) ccGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGa < 1:1005465/149‑1 (MQ=255) ttCAACCCCCCCCTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACt < 1:1782918/149‑1 (MQ=255) cAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGa > 2:1752734/1‑149 (MQ=255) aaCCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGCGG‑ACTGaa > 2:347999/1‑149 (MQ=255) ccATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAGGGTTACACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGt > 1:399693/1‑149 (MQ=255) ccATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACACCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGt > 2:736525/1‑149 (MQ=255) cATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGCAGtt > 2:634814/1‑149 (MQ=255) cACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTtctc < 2:297453/149‑1 (MQ=255) aCTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCg > 2:1844479/1‑149 (MQ=255) ttAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTaaa > 2:1071811/1‑149 (MQ=255) ttAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTaaa > 1:1440372/1‑149 (MQ=255) tAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCTCCAATCTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATCATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTaaaa < 1:178404/149‑1 (MQ=255) aTTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAt < 1:1894719/149‑1 (MQ=255) ttgcTTGTGCCAGCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATc < 2:1881213/146‑1 (MQ=255) cTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCCATTAAAATTTATCAGt > 2:1520809/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGt < 1:1734815/149‑1 (MQ=255) ttGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGtt > 2:1208990/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGtt > 1:1513003/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGtt > 1:302571/1‑149 (MQ=255) tgCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTa < 1:1544815/149‑1 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGCACTCAATGCCATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACttt < 1:1088453/149‑1 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAAt > 2:828998/1‑133 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAAt < 1:828998/133‑1 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACttt < 1:312059/149‑1 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACttt < 2:1863892/149‑1 (MQ=255) tCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGCTGATTATTAATAATCAGCGATGAAGTTTTAATTTGAAGTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTc < 2:2011580/149‑1 (MQ=255) gcGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTc < 1:581160/148‑1 (MQ=255) cccttCACCCCTGGCAGGCACCAATGTTAGAATGAAATTGACCCCCGATGTTGATTATTTATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCTATTCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCt < 2:1736673/145‑1 (MQ=255) gCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTg > 1:1171002/1‑149 (MQ=255) tCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGctc > 1:822746/1‑149 (MQ=255) ctctGGCAGGTGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGTCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTg < 2:2028521/149‑1 (MQ=255) ctctGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTg > 2:1853898/1‑149 (MQ=255) tctGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTgg > 2:1279841/1‑149 (MQ=255) agCAGTCGCCAATGTGCGACGGAAATTGACGCCCGATTTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTGTACTTTCTGCTCTCTGGaaa < 2:1911595/148‑1 (MQ=255) gCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAAc > 2:489280/1‑149 (MQ=255) aGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGc > 2:1298045/1‑149 (MQ=255) gcgcCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCt > 1:331531/1‑149 (MQ=255) gcgcCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCt > 1:1718586/1‑149 (MQ=255) cgcCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTg < 1:1043705/149‑1 (MQ=255) cgcCAATGTTAGACTGAAATTGACGCACGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTg > 2:745195/1‑149 (MQ=255) gtcAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGGGGTACGGATG‑ATCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGc > 1:2000792/3‑149 (MQ=255) gcCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGc < 1:1016040/149‑1 (MQ=255) cAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGctt < 2:408548/149‑1 (MQ=255) cAACGTTACACTGAAATTGACGCCCGATGCTTATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATGCTCGAGC‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGctt < 2:1084906/149‑1 (MQ=255) gTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCttt > 1:1659032/1‑149 (MQ=255) ttAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCtttt > 2:1565992/1‑149 (MQ=255) ttAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACCGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCtttt < 1:1594300/149‑1 (MQ=255) caGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAAGCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCttttt < 1:1197918/148‑1 (MQ=255) aCTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTAc < 1:200649/149‑1 (MQ=255) tGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCt > 2:957070/1‑149 (MQ=255) tGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCt < 1:1662007/149‑1 (MQ=255) tGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCt < 2:1513003/149‑1 (MQ=255) aaaTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTga < 1:1634793/149‑1 (MQ=255) aaaTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTga > 1:1416206/1‑149 (MQ=255) aaaTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTga < 1:347999/149‑1 (MQ=255) aaTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTgag < 2:220891/149‑1 (MQ=255) ttGACTCCCTATGTTGATCATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGagag < 1:856433/149‑1 (MQ=255) tGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCGATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGc > 1:189836/1‑149 (MQ=255) cGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAGCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCAtt < 2:1307103/149‑1 (MQ=255) ccGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAGACGCCTGCTTCTTTTTTAGCTGAGAGCAttttt > 1:548812/1‑149 (MQ=255) gATGTTGATTCTTAATAATAATCGATGAAGTTTTAATTTGTATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCGTCTTTTTTACCTGAAATGATTTTTTc > 2:19463/1‑149 (MQ=255) gATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTc < 1:1208990/149‑1 (MQ=255) gATGTTGATTATGAATACTCAGCTATGAAGTTTTAATGTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTGCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTc < 1:140415/149‑1 (MQ=255) gTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCa < 2:439009/149‑1 (MQ=255) gATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTc < 1:1956159/149‑1 (MQ=255) attaATAATCAGTTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGAt < 2:1983301/149‑1 (MQ=255) ttaATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCTAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGAtt < 2:70573/149‑1 (MQ=255) taataaTCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGAttt > 1:1832788/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGCGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAg > 2:724285/1‑149 (MQ=255) cAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATGCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGt > 1:1520992/1‑149 (MQ=255) cAGCCAAGAAGTTTTTATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACCTAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTTTTTTTTACCTGAGAGCA‑TTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGtt < 2:1486883/149‑1 (MQ=255) ctattcaGTTTTAATTTGAATTCCTCTGAATTCTCGAGG‑TCTGGGGTGTCTGGCAAGTAAAATTTATCTGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGTGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTa < 2:839057/143‑1 (MQ=255) cTATGAAGTTTGAGTTTGCATTCAACGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGCTTTCGTTAGTTTa > 2:1975084/1‑149 (MQ=255) tATGAAGTTTTAATTGGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAg < 2:642781/149‑1 (MQ=255) aTGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGATG‑ACTGAAGTTTCTTGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGa < 1:665577/149‑1 (MQ=255) aTGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGa < 1:473858/149‑1 (MQ=255) aTGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGa > 2:1677109/1‑149 (MQ=255) tGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGAt > 2:2032910/1‑149 (MQ=255) gAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGAtt > 2:692174/1‑149 (MQ=255) aaGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGAttt < 1:813026/149‑1 (MQ=255) aGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGAtttt < 1:904894/149‑1 (MQ=255) aGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCCAGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGAtttt < 1:1399438/149‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTg < 1:1329872/149‑1 (MQ=255) tttAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGaa < 1:813227/149‑1 (MQ=255) ttAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAat > 1:590429/1‑149 (MQ=255) ttAATTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAat < 1:1258441/149‑1 (MQ=255) aaTTTGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAatat < 2:2005398/149‑1 (MQ=255) tGAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTg < 1:1752734/149‑1 (MQ=255) gAATTCAATGCAATTCTCGATG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATCTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGt < 2:827113/149‑1 (MQ=255) gAATTCAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGt < 1:1565992/149‑1 (MQ=255) | CGAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCTCGAGG‑ACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGT > NC_000913/1413397‑1413686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |