| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,159,421 | A→T | 15.7% | I346F (ATT→TTT) | mdtC → | multidrug efflux system, subunit C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,159,421 | 0 | A | T | 15.7% | 128.1 / 2.7 | 69 | I346F (ATT→TTT) | mdtC | multidrug efflux system, subunit C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/31); new base T (9/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.26e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTTGACAGCATCCGGGCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACCAT > NC_000913/2159273‑2159566 | ggTTGACAGCACACGGGTAAACCGACCGGCGTTGCAGCAAACCACCCCGGCGGCGATTGCGCTGCAAATTGCCCAGGCTCGCTCCC‑CCTCC‑ACATGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGa < 2:1684971/149‑1 (MQ=255) agccGGGGAAAATGACCGGAGTCGCAGGATACCATTCCGGCGGGGATTGATCCGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCCCC‑TTTCGCGCTTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTggtggt < 2:74214/147‑1 (MQ=255) tCCGGGCAAAATTACCGGAGTTGCCGGACACCATTCCGGCGGCTATTGATCTGCAAAATGCCCAGGATCGATCGC‑CGCCC‑ACTAGCGCCTCGGTGGAAGTAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATACTGggggtg > 1:1356120/1‑149 (MQ=255) tCCGGGCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAGGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCCCGGTGTTACtgatagag > 2:901589/1‑143 (MQ=255) tCCGGGCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGgtggtg > 2:1671947/1‑149 (MQ=255) tCCGGGCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGggggtg > 1:1344946/1‑149 (MQ=255) ggggCAGAA‑TACCGCAGTTGCAGGACACCATTCCGGCGGCTCTTGATCTGCAAATTGCCCAGGAGAGCGCCC‑CCCCC‑CTCCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGttt < 2:36593/148‑1 (MQ=255) cGGGCAAGATTACCGGAGTGGCAGGACTCGTTTCCGGGGGCGGTTGAGCTGCCAGTGGCCCAGGGTCGCCCCC‑CCACC‑TTGTGCGCCTCGCTGGATGGAGTCGTGCAGGCGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGtt < 2:842293/149‑1 (MQ=255) gggCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGGGgcgtct > 1:728359/1‑147 (MQ=255) ggCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGCTTCTGGTGGTGtttt > 1:29641/1‑149 (MQ=255) cAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCGCC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTCTCTCGGTGG‑CGCGGCTGATTCGGGTGGTGgttttg > 1:979783/1‑148 (MQ=255) cAAAATTACCGGAGGTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTa < 1:795371/149‑1 (MQ=255) aaaTTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCCCC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTAtt < 2:100291/149‑1 (MQ=255) caTTACCGGAGTCGCAGGAATCCATCCCGGCGGCGATTGCTGTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCGT‑CCACC‑ATTCGCGGCTCGCTGGAATAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTc < 2:594901/148‑1 (MQ=255) aagtACCGGAGTTGCTGGAAACCAGTCCGGCGGCGGTTGATGTGCAAATTGCCCGGGATCGCTGCC‑CCACC‑TTTCGGGCGTCGCTGGAAGGAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTc < 2:584892/146‑1 (MQ=255) aaTTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCCGGTGTCTCTGAAGGAGATTATATTc > 2:790400/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGTTGCATGATACCATTCCGGCGGCTATCGATCCGCAAATTGCACAGGAGCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAGCGCTGGTTATCTCGGTGG‑CGCTGGTCATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTgc < 2:966578/149‑1 (MQ=255) gAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCCTCCACC‑‑TGCGCGCGTCCCTGGCAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTTTGGCGGTGGTTTTCTTCTTGCACTc > 2:655619/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACA‑ATTCGCGCCTCGCTGGACGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGAATCTGGTGGTGTTTGTATTCCTGCGCTCggg > 1:509570/1‑149 (MQ=255) tGCACGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATGCGCGCCTCGCTGGAAGAAGGCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGt < 1:328015/149‑1 (MQ=255) aGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTcgc > 2:1196212/1‑149 (MQ=255) aGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCCGGTGATCCTGGTGGAGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTcgc > 2:1232258/1‑149 (MQ=255) gAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCGTGGTGTCTTTGGTGGTGTTTTTATTCCTGGGCTCGGGTCgcgc > 2:725575/1‑149 (MQ=255) gAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTAGCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTGTTCCGGCGCTCGGGTggcgg > 1:285456/1‑148 (MQ=255) caaCCATCCCGGCGGCGACTGCTCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCGCC‑GTTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGcc < 1:1758958/148‑1 (MQ=255) cggcggCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCAACTattatt > 1:131462/1‑149 (MQ=255) aTTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGC‑CCC‑CCACCGATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCCCGTGACTCTGGAAGTGAATTTATTCCTGCCCTCGGGTCGCGACACTAGTATTCCCGCCGt > 2:1748762/1‑149 (MQ=255) aTCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGTTGG‑TGCTGGTGAAAATATAGCAAAGCACATCCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCg > 2:1737934/1‑149 (MQ=255) cTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCCCTATTATTCCCGCGGTTTCGGt > 1:4215/1‑149 (MQ=255) gCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑TGGCGGTGATATTAAAGGAGAATTTATACCTGCGCTAGAGTCGCGCCACTATTATTGCCGACGTTTAGGTGc > 2:1413297/1‑149 (MQ=255) gCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGGCGGTGTCTCTGGTGATGATATTCTTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACCATTATTTCCGCCGTTTCGGTga > 2:938298/1‑148 (MQ=255) ttGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCCTCGTATCTCTGGAAGAGATATTATTACTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGtt > 2:750472/1‑149 (MQ=255) tGCCCAGGATCGCCCCC‑CCACC‑TTTCGCGCCCCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGttt < 1:1431671/149‑1 (MQ=255) tGCCCAGGATCGCCCCC‑CCACC‑AGTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGttt < 1:1058515/149‑1 (MQ=255) ccgggctCGCTCCC‑CCACC‑ATGCGCGCCGCGCTGGAAGAAGTCGAGCAACCGCTGATGATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTTGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGc < 2:754711/143‑1 (MQ=255) aGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑TCCCGGTGTCATTGGAGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTACTCCCGCCGTGTCGGTGCCGGTTTCGccg > 2:1789564/1‑147 (MQ=255) gATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCGTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTGCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGAt > 1:376444/1‑149 (MQ=255) accGCCCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCCCGCTGGAAGAAGTCCAGCAAACCCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTCGTGATTCTGGTGGGGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGAtt < 2:1446818/147‑1 (MQ=255) aTCGCTCCC‑CCAAC‑CTTCGCCCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGAtt < 1:838549/149‑1 (MQ=255) tCCC‑CCGCC‑ACTCGCGCCTCGCGGGAAGGAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTAc < 1:680943/149‑1 (MQ=255) cccc‑ccACC‑ATTCGCCCCTCGCTGGACGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTAc < 1:1383487/148‑1 (MQ=255) c‑ccACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGGCCGCCGTAGCTT‑TTGAAGAAAAATTATTCCTGCCCTCGGGTCTCGCCACTATTATGCACGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCGGATTGGTACGtt > 2:831621/1‑149 (MQ=255) aTTCGCGCCTGGCCGGAAGAAGCCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTgcggc < 1:981108/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTgcggcg > 1:1116997/1‑149 (MQ=255) ttCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCGCCGTATCATTAAAAAAGAAATTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGGTTCGGTGCCGGTTTAGCTGAATGGTACCTTTgcggcg > 2:598652/1‑149 (MQ=255) ccTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTAc < 1:1671947/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCGCCGTATCACTGAAAAAAAAATTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTCTTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTCGGTTTGCGGCGACGGAcc > 2:670162/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCGCCGTAACACTAAAAAAGAAATTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGATTCGCAGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTAcc > 2:670366/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CCCCCGTGACTCTGGAGGAGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGAGCCACTATTATCACCGCCGTTTCGCTGCCGGGTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTAct > 2:374977/1‑148 (MQ=255) gaagaaGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGGGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGGACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCgg > 1:756167/1‑149 (MQ=255) aagaagTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGa > 1:1174960/1‑149 (MQ=255) gatgTCGGGCCAGCGCTGGTTACCTCGGTGG‑CGCTGGTGCTTCGGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGAtt < 2:1613362/146‑1 (MQ=255) tCGGGCAAACGCTGATTATCTGGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTCTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATCCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGt < 1:655619/149‑1 (MQ=255) 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cgtggATTATCTCGGTGG‑CCCTGGGGATTCTGGCGGTGTTTTGACTCCTGCGCTCGGGTTGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTCCCCGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAAc < 2:1577444/145‑1 (MQ=255) cGCTGATTATCTCGGTCG‑CGCTCGTGTTTCTGGTGGTGTCTTCATTCCTCCGCTCGGGTCGCGCCACCATGTTTCCCGCCGTTTCGGTCCCGGTTTCGCCGATCGGTACGCTCGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAAc < 2:885322/149‑1 (MQ=255) gCTGATTGACCCGGGGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATCCCTGCGCCCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAAcc < 2:44879/149‑1 (MQ=255) gCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAAcc < 1:1196212/149‑1 (MQ=255) tgctttgctcGGGGG‑CGTTGGTGATTCTGGGGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGGGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAACCtt < 2:736280/142‑1 (MQ=255) 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acgcgGGTGTTTCTGGTGGTGTTTTTCTTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTGTTCCCGCCGGTTCGGTGCCGGTTTCGCTGTTTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCt < 2:1208128/148‑1 (MQ=255) gTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACGAt > 1:1554807/1‑149 (MQ=255) | GGTTGACAGCATCCGGGCAAAATTACCGGAGTTGCAGGAAACCATTCCGGCGGCGATTGATCTGCAAATTGCCCAGGATCGCTCCC‑CCACC‑ATTCGCGCCTCGCTGGAAGAAGTCGAGCAAACGCTGATTATCTCGGTGG‑CGCTGGTGATTCTGGTGGTGTTTTTATTCCTGCGCTCGGGTCGCGCCACTATTATTCCCGCCGTTTCGGTGCCGGTTTCGCTGATTGGTACGTTTGCGGCGATGTACCTGTGCGGATTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACCAT > NC_000913/2159273‑2159566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |