| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,276,886 | C→A | 7.3% | intergenic (+33/‑116) | garD → / → prlF | D‑galactarate dehydrogenase/antitoxin of the SohA(PrlF)‑YhaV toxin‑antitoxin system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,276,886 | 0 | C | A | 7.3% | 476.1 / 21.1 | 137 | intergenic (+33/‑116) | garD/prlF | D‑galactarate dehydrogenase/antitoxin of the SohA(PrlF)‑YhaV toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (66/61); new base A (7/3); total (73/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GGAAGTTGTTCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCACGCTG > NC_000913/3276741‑3277029 | gAAGTTGTTCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAg > 1:220003/1‑149 (MQ=255) gttgttCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGc > 3:254007/1‑149 (MQ=255) ccACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑ACTAAGGCCATGtt < 3:847541/149‑1 (MQ=255) cACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGc > 1:1031289/1‑142 (MQ=255) cACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGc < 2:1031289/142‑1 (MQ=255) cACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGttt > 2:628123/1‑149 (MQ=255) aCTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAATCCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACGTGGC‑CTTAGTGCCATGtttt < 1:376750/149‑1 (MQ=255) cTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGttttt > 4:177021/1‑149 (MQ=255) cTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑ACTAAGGCCATGttt > 3:802837/1‑147 (MQ=255) ttATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTAt < 1:849423/149‑1 (MQ=255) tcGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTa < 1:926331/149‑1 (MQ=255) gACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTaaa > 4:622187/1‑149 (MQ=255) aCGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAg > 4:592709/1‑149 (MQ=255) cGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGc < 1:628123/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGc < 1:930926/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGccccc < 4:511205/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGccccc > 2:243004/1‑149 (MQ=255) gaagaagaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTaaa < 2:671080/135‑1 (MQ=255) gaagaagaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTaaa > 1:671080/1‑135 (MQ=255) gaagaagaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCAt < 2:894537/149‑1 (MQ=255) aagaagaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCAtt > 4:272486/1‑149 (MQ=255) agaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTCCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAATCCCCCACGTCCATtaata > 3:730404/1‑149 (MQ=255) gcaacccTTCTCGCATCAATGTGTGCTGCATGACCAGCGGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTTGAACGTCCCTCGCAAAACATGGA‑CTTAGTCCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCGACGTCCATtaataa < 3:261976/144‑1 (MQ=255) gaaAACCTTCTCGGTTCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATtaataa > 3:81019/1‑149 (MQ=255) gaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATtaataa > 3:494823/1‑149 (MQ=255) gaaAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATtaataa > 3:503003/1‑149 (MQ=255) aaaaCCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTaataat > 3:621345/1‑149 (MQ=255) aaCCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCAc < 3:1024579/134‑1 (MQ=255) aaCCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCAc > 4:1024579/1‑134 (MQ=255) aaCCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgc < 4:52990/149‑1 (MQ=255) aCCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgca > 3:541372/1‑149 (MQ=255) cTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATGACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcatt > 4:696688/1‑149 (MQ=255) cTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcatt < 4:689593/149‑1 (MQ=255) ctcGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcatttgc < 1:1127185/149‑1 (MQ=255) gATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGttt > 3:21173/1‑104 (MQ=255) gATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTa > 2:429391/1‑149 (MQ=255) gATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTa > 4:1101604/1‑149 (MQ=255) aTCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTAc > 3:898680/1‑149 (MQ=255) aTCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTAc < 3:177021/149‑1 (MQ=255) ggggCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGtt > 2:1040546/1‑149 (MQ=255) aTAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTta > 4:453017/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcattt < 1:964945/125‑1 (MQ=255) aaCCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcattt > 2:964945/1‑125 (MQ=255) aaCCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgca > 1:1140225/1‑122 (MQ=255) aaCCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGt > 4:178333/1‑138 (MQ=255) aaCCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTtata < 4:621345/149‑1 (MQ=255) aaCCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACACGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgca < 2:1140225/122‑1 (MQ=255) ccAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAAt < 4:730404/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAAt < 3:619440/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGa < 1:351808/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGCCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGa < 2:373811/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCAc > 1:754981/1‑97 (MQ=255) gCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCAc < 2:754981/97‑1 (MQ=255) gCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCa < 4:254007/149‑1 (MQ=255) ggTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑ACTAAGGCCATGttttgcga > 4:427812/1‑76 (MQ=25) ggTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑ACTAAGGCCATGttttgcga < 3:427812/80‑5 (MQ=25) tttAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTa < 3:592139/121‑1 (MQ=255) tttAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAAc > 4:562636/1‑149 (MQ=255) tttAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAAc > 4:927627/1‑149 (MQ=255) aaCCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTtat > 2:1049888/1‑130 (MQ=255) aaCCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAgg < 3:453017/149‑1 (MQ=255) aaCCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAgg < 4:584089/149‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCa > 3:1127276/1‑137 (MQ=255) ccGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTg < 2:1148570/149‑1 (MQ=255) gCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAAt > 2:54044/1‑127 (MQ=255) gCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAAt < 1:54044/127‑1 (MQ=255) aCCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTaaaa < 3:927627/149‑1 (MQ=255) ccGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAg < 1:1040546/149‑1 (MQ=255) tGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACa < 3:1101604/149‑1 (MQ=255) cTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGa > 2:132978/1‑149 (MQ=255) cTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGa > 2:371713/1‑149 (MQ=255) tGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcattt < 1:186714/89‑1 (MQ=255) tGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAtgcattt > 2:186714/1‑89 (MQ=255) tGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTg > 2:208522/1‑134 (MQ=255) tGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTg < 1:208522/134‑1 (MQ=255) aTTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATc > 4:398971/1‑149 (MQ=255) cTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCt > 3:226281/1‑92 (MQ=255) cTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCt < 4:226281/92‑1 (MQ=255) ttttGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAAttt < 3:358997/110‑1 (MQ=255) aaCGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTaa > 4:299439/1‑149 (MQ=255) aCGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAAGGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATACTTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAAt < 3:634024/149‑1 (MQ=255) cccTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctc < 4:1093736/149‑1 (MQ=255) cccTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctc < 3:696688/149‑1 (MQ=255) ccTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctcg > 4:515084/1‑149 (MQ=255) cTCGCAAAATATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctcgc > 3:1073413/1‑149 (MQ=255) tCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctcgct > 1:900462/1‑149 (MQ=255) tCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctcgct > 4:1136031/1‑149 (MQ=255) tCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctcg > 2:880067/1‑147 (MQ=255) cGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATgctcgctc < 4:898680/149‑1 (MQ=255) taaaaaCATGGCACTAAG‑GCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGctct > 3:643001/3‑149 (MQ=255) taaaaaCATGGC‑ACTAAGGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGctct > 1:832420/3‑149 (MQ=255) taaaaaCATGGC‑ACTAAGGACATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGctct > 1:1013563/3‑149 (MQ=255) gCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGctct < 2:905485/149‑1 (MQ=255) aaaaCATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAg < 1:88716/115‑1 (MQ=255) aaaaCATGGC‑ACTAAGGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCa > 2:802036/1‑149 (MQ=255) aaaCATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGACCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCAc < 3:986753/149‑1 (MQ=255) aaaCATGGC‑ACTAAGGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCAc > 2:649728/1‑149 (MQ=255) aaCATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCACg > 1:1078140/1‑149 (MQ=255) aaCATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCACg > 3:188043/1‑149 (MQ=255) aaCATGGC‑ACTAAGGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCACg > 4:223765/1‑149 (MQ=255) | GGAAGTTGTTCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGGGCTGCATAACCAGCTGGCGGTGTTTAACCCGGCACCGGTGACCTGATTTCTTTTGGAACGTCCCTCGCAAAACATGGC‑CTTAGTGCCATGTTTTTATTGTTTAAAGCCCCCACGTCCATTAATAATGCATTTGCATTACCTTAGTTCAAGCTTATAATTTGAGCAGAAAACAGGCTGTAAAAGGACAGTGAATCATGCCCGCTAATGCTCGCTCTCACGCTG > NC_000913/3276741‑3277029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |