| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 81876 | 119 (0.900) | coding (83/1092 nt) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCTTTTTCGACTTCTGC > NC_000913/81728‑82023 | gccTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCAt > 2:467790/1‑149 (MQ=255) cAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCGGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTc < 2:559820/149‑1 (MQ=255) cAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCGGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTc > 1:559820/1‑149 (MQ=255) aaaCAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCa > 2:335099/1‑149 (MQ=255) aaCAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAg > 3:347623/1‑149 (MQ=255) aaCAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAg > 2:137536/1‑149 (MQ=255) cACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCt > 3:582428/1‑149 (MQ=255) cACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCt < 2:1030654/149‑1 (MQ=255) ggCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTggg > 4:1246479/1‑149 (MQ=255) tCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGtcat > 3:445437/1‑149 (MQ=255) ttGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACtt > 3:913816/1‑149 (MQ=255) cTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCg < 3:1246479/149‑1 (MQ=255) tCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCgg > 2:1446126/1‑149 (MQ=255) tCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCgg > 1:191210/1‑149 (MQ=255) tCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCgg > 2:1043475/1‑149 (MQ=255) cacaACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGa < 1:1043475/149‑1 (MQ=255) acaACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATcc < 1:74892‑M2/115‑3 (MQ=255) acaACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATcc > 2:74892‑M2/1‑113 (MQ=255) acaACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGAc < 1:467790/149‑1 (MQ=255) 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aaGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGa < 1:224857/134‑1 (MQ=255) cGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAActct < 3:600184/149‑1 (MQ=255) tGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCGCACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCttttt < 4:1015915/149‑1 (MQ=255) cgcA‑CGGCATccagccattacgatgtaggcggcgcagccattgataaccacgggcaaccactgccgcctgcgacggttgaaggttgtgagcaagccgatgccgtgctgtttggctcggtaggcggcccgaagtgggaacatttaccacc > 2:1042636‑M2/1‑10 (MQ=255) gcA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCTTTTTCGa > 3:1360469/1‑149 (MQ=255) ggCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCttgt > 3:1040523/1‑103 (MQ=255) ggCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAActct < 1:1075166/138‑1 (MQ=255) cATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCTTTTTCGACTTCTg > 3:133414/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCTTTTTCGACTTCTGc < 4:1360469/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCTTTTTCGACTTCTGc < 2:97839/149‑1 (MQ=255) | GCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCA‑CGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTGTGTTGAGCTTTGCGTTGCAACTCTTTTTCGACTTCTGC > NC_000913/81728‑82023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |