| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 192,579 | A→T | 5.8% | *242L (TAA→TTA) | pyrH → | uridylate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 192,579 | 0 | A | T | 5.8% | 497.6 / 15.4 | 137 | *242L (TAA→TTA) | pyrH | uridylate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/68); new base T (4/4); total (65/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAC‑GGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGG > NC_000913/192433‑192721 | ggAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAC‑GGaataat > 4:1100140/1‑149 (MQ=255) aaaaaGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAC‑GGAATAATTc < 4:609221/149‑1 (MQ=255) aaaaaGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAC‑GGAATAATTc > 1:1466686/1‑149 (MQ=255) 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acgggAATTATT‑CCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATg < 1:1065660/146‑1 (MQ=255) aC‑GGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGa < 4:647137/126‑1 (MQ=255) aC‑GGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGa > 3:647137/1‑126 (MQ=255) aC‑GGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATg < 3:1270773/149‑1 (MQ=255) c‑GGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATgg > 3:1327468/1‑149 (MQ=255) ggAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCgggg > 2:527796/1‑56 (MQ=255) ggAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCgggg < 1:527796/56‑1 (MQ=255) | GGAAAAAGAGCTGAAAGTCATGGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAC‑GGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTATTGTTGCAGGCAGTTTGGTCACGGCCAGCGCGCAGCAACCGGAGCGTACAAAAGTACGTGAGGATGG > NC_000913/192433‑192721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |