| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3762282 | 289 (2.200) | 5 (0.040) | 5/492 | 11.5 | 2.7% | coding (100/4134 nt) | rhsA | Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3762441 | 81 (0.650) | coding (259/4134 nt) | rhsA | Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATAAAACAAGGATGAGAAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCA > NC_000913/3762165‑3762537 | aTAAAACAAGGATGAGAAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGCTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCCGTTACCGGACAACAACGCCcgc > 2:503179/1‑278 (MQ=255) tAAAGCAAGGAGGGGAAATGGGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCcgcg < 2:331006/278‑1 (MQ=255) cAAGGATGAGAAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCCCCTACAGCAGTTACCGGACCAAAACCCCCGCCCCg‑gc > 4:230900/1‑277 (MQ=255) gggtggaaaaggggCGGAAACCCGGCGCGGCGTCAGGGCGAAATGACGCGGTATGGCGGTAGCATTGTGCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGGGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑Gt < 3:260454/262‑1 (MQ=11) ggATGAGAAATGAGCGGAAAGCCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑Gt < 1:597889/275‑1 (MQ=38) ggATGAGAAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCC‑GTgg > 2:630929/1‑277 (MQ=38) aatggggatgaaGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATTACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGT‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGACTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCAGTGAAACCGACATCGCCCTTCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTg < 1:354812/264‑1 (MQ=255) tGAGAAGTGGGCGGACACCGCGGAGCGCGTCAGGGCGGCATGACGCAGTATGGCGGGAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCCTTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCTATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTggggg < 4:258301/277‑2 (MQ=11) tgaaagcgAGCGGAACAGCCGCGGCGCGTCAGGCAGACAATAGGCAGCATGGGGGGAGGATTGTCAAGGCTTCAGCGGG‑GGTGCACTGTTGAGC‑CCCATCCGGAGTGGCCTGTTCGATGGGCCCCAGCGAAGAGACGTCCGACCATCCGGTCAATCCCCTGCACAGTGCTAAGCACCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCTCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCAACTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTgggg < 3:268463/268‑1 (MQ=2) agaAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAAAGCCGGGCCCG‑GTgggg > 1:208917/1‑274 (MQ=255) agaAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTAACGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGc > 2:195259/1‑277 (MQ=25) agaAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGGCCTTCCCGGTGAAACCGAAATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCACACCTACAGCAGTCACCCGACAAAAACGCCCGCGCCGTGTgggcgg > 2:385614/1‑274 (MQ=255) agaAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCACTCGGTCACTACCCTGCTCGGCTCAAAGGTCCTTCCCGGTGCAACCGACCTTCCCCTCCCCGGCGCGCACCCGTCCATCCCCCCCCCCACCTCCCGCCGTTACCGGACACAACCCCCCccgccgcgccggcgc > 4:189072/1‑268 (MQ=11) aGCGGAAACCCGGCAGCGCGGCAGGGCGACCGTGCGCAGTGTGGCGGTGGCATTGGTCAGGGGGCAGCCGG‑GGTGCGCCTTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGGCCCGTCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCACTCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTgggggcaccaatgc < 4:422626/277‑11 (MQ=11) aGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCCCCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGcac > 2:215469/1‑276 (MQ=21) aGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCgg > 1:539451/1‑275 (MQ=34) gacaaCCGGCCGGGGGGCAGGGCGGCAGGGCGGGGTATGGCGGAAGGATTGTTCAGGGTTCGGCCGG‑GGGGGGCATTGGGGC‑CCCCACCGGCGGGGCCTGTTCGGGGGGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCGGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAATTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCgg < 4:193108/274‑1 (MQ=11) gAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGGGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCgg < 2:527617/277‑1 (MQ=21) aaaaCCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCCCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGCCCCCg > 1:430030/1‑275 (MQ=21) cccGGCAGCGCTTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAACCCCCTGCTCGGGGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGc < 1:146595/273‑1 (MQ=21) aCCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑TGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCgg < 1:354794/273‑1 (MQ=21) ccGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGCCGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCAGTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGGGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGaa < 2:188969/278‑1 (MQ=21) gCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGAAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATAGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGaa < 1:415768/275‑1 (MQ=21) aGCGCGTCAGGGCGACAGGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCAGTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATAGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGaa < 1:135888/273‑1 (MQ=18) ggcctttaGGGGGACATGACCAAGTATGGCCGTAGCGTTGTCCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGTTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGc < 2:359302/270‑1 (MQ=11) cgTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCCGCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAACGcc > 1:470443/1‑275 (MQ=18) gggggctgggcGCAGTATGGCGGGGGCAGTGTTCAGGGTGCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGGGC‑CCCCCCCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat < 4:477079/268‑1 (MQ=11) gCGACCTGGCGCAGTATGGCTGTAGCATTGGTCAGGGTGCCGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat < 2:535626/277‑1 (MQ=12) gCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat < 2:624882/277‑1 (MQ=32) gaaacgatgCAGTATTGCGGTTGGATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCCTGGGTGC‑GCCCACCGGCGTGGCCGCTTCGGTGTGCCACGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGACACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGata < 3:34084/266‑1 (MQ=11) aCATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCGCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat > 1:571974/1‑274 (MQ=17) cATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCCTCCTCCCCCGCACCTACCGCAGTTACCGGCCACACACGCCCGCCCCG‑GTGGGGAGCCTCCGCCCCGTCGGGAACATGCGTGCGGATATct > 3:82066/1‑274 (MQ=11) gaaggatgggtgTAGCATTGTTCAGGGTTCAGACAG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACGTGCGGTGGCTGTTCGGTGTGCACCGGCGGAGTGACGTCCGTCCAGCCGGGCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTa < 1:335098/263‑1 (MQ=11) cAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTAc < 1:375931/274‑1 (MQ=32) ggcaTGGCAGTAGGGTTGTTCCGGGTTCCCCCGG‑GGGTCGCATTGCTGC‑CCCCGCCGGCGTGGCCGGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACTGACATCGCCCTGCCGGGCCCGCTGCCGTGCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAGAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTg < 4:259789/275‑1 (MQ=11) tATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGCTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCACTTCCCGGACAACAACGCCCGCGCCG‑GCGGGGACCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATCTCCGCTTACac > 3:474991/1‑272 (MQ=255) gactgCGGTAGCTTCGTGCAGTGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGGGC‑CCCCACTCGCGTTGCCTGTTCGGTGGGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATACGTTCAATCCCATGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCAGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGGACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGc < 3:133720/270‑1 (MQ=11) aTGGCGGTAGCGTTGTTCCTGGGTC‑GCCGGCGGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGGCGCCTGGTCCGTGTGCCCCGGCGTGGTGCCGTCCGGCCATCCGGTCCATCCCCTGCTCGGTCCAAAGGTCCTTCCCGGTAAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTgcg < 4:503179/277‑1 (MQ=11) 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cGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGCCAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCCTCGGATACCCGCTTACcgccgccc > 1:476358/1‑272 (MQ=12) cGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTgcgc > 1:450714/1‑274 (MQ=32) gttAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATaa < 2:619707/276‑1 (MQ=17) 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ggTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGGTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATAc < 1:522614/274‑1 (MQ=17) tCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCCCCCGCACCTACAGCCGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCCGCTGGAAAATGCCTGCGGCTATCCGCTTACAGCTGCCCGCTAacacccggcaacccc > 3:598659/1‑263 (MQ=11) aGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCCTCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCTGCTGGACAAGGCCTGCGGATTTCCGCCTACATCTGCGCGCAAAAACATTGaaaatacg > 3:377656/1‑266 (MQ=11) 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cgcATTGGTGC‑CGCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGGGTGCCCCGGCGGAGGGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAAcgg < 1:195495/272‑1 (MQ=14) cATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGACACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACCCAGTGATAACGGCGGCa > 1:380936/1‑275 (MQ=11) cATTCGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGTCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAGGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACAGCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGAGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCa < 1:493958/275‑1 (MQ=2) | ATAAAACAAGGATGAGAAATGAGCGGAAAACCGGCAGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGG‑GGTGCGCATTGGTGC‑CCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCG‑GTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCA > NC_000913/3762165‑3762537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |