| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,202,957 | G→T | 5.1% | intergenic (‑24/‑67) | cohE ← / → croE | e14 prophage; repressor protein phage e14/e14 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,202,957 | 0 | G | T | 5.1% | 471.6 / 12.2 | 139 | intergenic (‑24/‑67) | cohE/croE | e14 prophage; repressor protein phage e14/e14 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (64/66); new base T (3/4); total (67/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CTCCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACT > NC_000913/1202810‑1203102 | tcCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGtt < 4:523114/149‑1 (MQ=255) tcCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGtt < 3:380621/149‑1 (MQ=255) ccATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTaa > 2:435878/1‑149 (MQ=255) aTAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑gg > 3:167041/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAATGAAGAATTCCCGACAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGAGTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 2:692342/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACaa < 2:92393/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 2:145053/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 1:57023/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 1:303668/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCCACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTATAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAg > 2:105878/1‑149 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAgg < 1:122427/149‑2 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAgg < 2:522962/149‑2 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCTTAAC‑GGTACAAgg < 1:368950/149‑2 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGt > 2:10085/1‑149 (MQ=255) tgctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACC‑TTAACGGTACAAgg < 1:346094/149‑2 (MQ=255) ctgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTAt > 1:119767/1‑149 (MQ=255) tgGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATc > 1:632665/1‑149 (MQ=255) gTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa > 2:164176/1‑142 (MQ=255) gTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACaa < 1:164176/142‑1 (MQ=255) gTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCtt > 3:473975/1‑149 (MQ=255) gTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCtt < 4:116848/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGaa < 1:263140/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGaa < 4:89523/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGaa < 4:565561/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGaa < 4:467917/149‑1 (MQ=255) ttGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGtt < 1:677884/149‑1 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 2:654960/1‑149 (MQ=255) tCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCAttt > 4:81142/1‑149 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 2:877104/149‑1 (MQ=255) cgATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCaa < 1:125893/149‑1 (MQ=255) gATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAAt > 2:849387/1‑149 (MQ=255) tcaatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCa > 2:68022/1‑149 (MQ=255) tcaatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCa > 4:92348/1‑149 (MQ=255) caatcaTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCAt < 1:849387/149‑1 (MQ=255) caTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTaa < 4:348699/149‑1 (MQ=255) aTAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAat < 3:402023/149‑1 (MQ=255) aGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAatat > 3:674696/1‑149 (MQ=255) ggCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTa > 4:407396/1‑149 (MQ=255) gCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGAGCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTac > 2:264418/1‑149 (MQ=255) gCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTaa < 1:19928/142‑1 (MQ=255) aaGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTCGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACAcc > 1:97460/1‑149 (MQ=255) gaagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGa > 2:486198/1‑149 (MQ=255) gaagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGa > 3:152078/1‑149 (MQ=255) gaagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGa > 1:587632/1‑149 (MQ=255) aagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAg > 3:508166/1‑149 (MQ=255) aagaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAg < 4:152078/149‑1 (MQ=255) agaaTTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAgg > 1:761792/1‑149 (MQ=255) ttCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACa > 3:647560/1‑149 (MQ=255) ttCCCGCCAACACCATCTCTCAGTGTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACAGGAGGTACa > 3:744797/1‑149 (MQ=255) cccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACata < 1:736592/149‑1 (MQ=255) ccGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACatat > 1:375809/1‑149 (MQ=255) cGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATAtt < 2:528949/149‑1 (MQ=255) cAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTa < 1:654960/149‑1 (MQ=255) acCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAAGCATGTAATATGTACACCGGAGGTACGTATTGTATGaa > 3:574105/1‑149 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 1:105878/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 2:587632/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 4:281149/149‑1 (MQ=255) ccATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGaaa < 3:571194/149‑1 (MQ=255) aTCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGc < 1:486198/149‑1 (MQ=255) tctcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTa < 4:840911/149‑1 (MQ=255) tcAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCTTAtt > 1:642595/1‑149 (MQ=255) cAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTg < 1:518196/149‑1 (MQ=255) aGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAGAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTgg < 1:739195/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCtt > 2:811144/1‑149 (MQ=255) ttAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAAcc > 2:774567/1‑149 (MQ=255) gACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa > 4:214912/1‑149 (MQ=255) gccgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCTTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAAGCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAc < 4:574105/149‑1 (MQ=255) gccgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAc < 4:370138/149‑1 (MQ=255) gccgGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAc < 1:435878/149‑1 (MQ=255) gATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAAcagca > 2:843465/1‑149 (MQ=255) tGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAgg < 2:703967/149‑1 (MQ=255) aTGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGa > 3:769893/1‑149 (MQ=255) gATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGtt > 3:356497/1‑149 (MQ=255) gATTGTTCTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGtt > 1:439715/1‑149 (MQ=255) ttGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTgg > 1:617286/1‑149 (MQ=255) cATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGaaa > 3:100547/1‑149 (MQ=255) aCGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGtt < 4:769893/149‑1 (MQ=255) gAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTgg > 1:408172/1‑149 (MQ=255) aaaTTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGc < 3:751786/149‑1 (MQ=255) aaaTTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGc < 4:490546/149‑1 (MQ=255) gaTTGAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGGATCTTGAAGGTTGATTTCAATCATGTAATATGTACAGCGGAGGTACATATTCTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAAACAGAGAACAGCAGGGGGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCt < 4:508166/148‑1 (MQ=255) aTTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCt > 1:738392/1‑148 (MQ=255) aTTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCt < 2:738392/148‑1 (MQ=255) aTTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTc > 2:553769/1‑149 (MQ=255) tAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCaa < 4:167041/149‑1 (MQ=255) aaaaCCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGTGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAac > 1:264315/1‑149 (MQ=255) aaaaCCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAac > 3:287839/1‑149 (MQ=255) aaCCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAacac > 1:559241/1‑149 (MQ=255) aCCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACAcc > 3:635466/1‑149 (MQ=255) aCCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACAcc < 2:559241/149‑1 (MQ=255) cccTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCt > 1:307894/1‑149 (MQ=255) cccTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCt < 2:439715/149‑1 (MQ=255) ccTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGaa > 3:879174/1‑109 (MQ=255) ccTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTg > 4:190448/1‑149 (MQ=255) ccTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTg > 4:711664/1‑149 (MQ=255) acTTGTACCTTAAC‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTg > 2:245023/2‑149 (MQ=255) cTTGTACCTTAAC‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTgg > 4:683583/1‑149 (MQ=255) cTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACAGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTACCCAAAGAACAGCGGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTgg < 4:280147/149‑1 (MQ=255) ttGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCaaa > 4:430692/1‑104 (MQ=255) aCCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTGAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATAGTGTATGAAGGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCAGGAAAAGTTGGCTCTACACCTTGCTACt > 2:256233/1‑149 (MQ=255) | CTCCCATAAACCTGCTGGTCTGGGTTGGCTCGCGATCAATCATAGTGGCAAAGGAAGAATTCCCGCCAACACCATCTCTCAGTTTTCTGGCGTTAGACCGCCGGATGTCATGGATTGTTTTCATAACGAAATTAAAACCCTTGTACCGTTAA‑GGTACAAGTATCTTGAAGGTTCATTTCAATCATGTAATATGTACACCGGAGGTACATATTGTATGAAAGCGTATTGGGACTCTTTAACCAAAGAACAGCAGGGCGAGTTGGCCGGAAAAGTTGGCTCAACACCTGGCTACT > NC_000913/1202810‑1203102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |