| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,753,986 | A→T | 5.8% | intergenic (+40/+22) | bamE → / ← ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,753,986 | 0 | A | T | 5.8% | 478.6 / 14.0 | 138 | intergenic (+40/+22) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/62); new base T (4/4); total (72/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTA > NC_000913/2753839‑2754133 | cAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAAt < 4:873503/149‑1 (MQ=255)cAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAAt < 3:280557/149‑1 (MQ=255)cAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAAt < 4:859805/149‑1 (MQ=255) aGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATg < 1:124590/149‑1 (MQ=255) gCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGa < 1:427618/149‑1 (MQ=255) cAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAg < 2:678992/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCa < 1:521313/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCAc < 1:151454/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCAc < 2:467192/149‑1 (MQ=255) aGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTt‑ct‑gt < 1:330706/149‑1 (MQ=255) gtAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑ct‑gtctgt > 1:499814/1‑149 (MQ=255) aaCTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGtta < 3:364027/149‑1 (MQ=255) gCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTTCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTtatttatt < 1:32317/149‑1 (MQ=255) aaaCGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCg > 1:131633/1‑149 (MQ=255) ctgacCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCt > 2:286645/1‑149 (MQ=255) tgacCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTg > 1:592271/1‑149 (MQ=255) tgacCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTg > 3:444599/1‑149 (MQ=255) cTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCg > 3:136517/1‑149 (MQ=255) tttAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGt > 2:154288/1‑149 (MQ=255) tttAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGt > 4:344058/1‑149 (MQ=255) tttAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGAGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGt < 2:769657/149‑1 (MQ=255) ttAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGtt > 4:375497/1‑149 (MQ=255) ttAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGtt < 4:151646/149‑1 (MQ=255) aaaCAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTg < 2:553371/148‑1 (MQ=255) aaCAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGc < 4:444599/149‑1 (MQ=255) gTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGc > 1:212795/1‑149 (MQ=255) gCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGaa > 4:477266/1‑149 (MQ=255) gtTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCttt < 4:826186/149‑1 (MQ=255) ttGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTCAATAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTc < 2:147312/149‑1 (MQ=255) ttGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTc < 1:264832/149‑1 (MQ=255) ttGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTc > 2:889688/1‑149 (MQ=255) ttGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTc > 4:193535/1‑149 (MQ=255) gACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTg < 3:201809/131‑1 (MQ=255) gACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTg > 4:201809/1‑131 (MQ=255) ccAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGAt < 2:592271/149‑1 (MQ=255) aaTATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTACTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCg > 2:291282/1‑149 (MQ=255) atatTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCGCTCAAAGACGTTATAAAAAGTACTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCCGATCgg > 1:127071/1‑149 (MQ=255) ttGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCaa < 3:876598/149‑1 (MQ=255) acgATAACAACCCTGCGCTGAGTGGTAACGAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTGAAAAAAGGGGCTCAAGGAGCACCTTTGTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCaa < 2:142153/147‑1 (MQ=255) tGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAAt < 2:530309/149‑1 (MQ=255) aaCAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCATTGAGCACCttt > 4:785521/1‑78 (MQ=255) aaCAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCATTGAGCACCttt < 3:785521/78‑1 (MQ=255) aaCAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATgaga > 1:555321/1‑149 (MQ=255) aaCAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATgaga < 1:704998/149‑1 (MQ=255) aCAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGagag > 2:322025/1‑149 (MQ=255) cAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAgg > 2:6661/1‑149 (MQ=255) cAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAgg < 3:322911/149‑1 (MQ=255) aaaCCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAggg > 3:758007/1‑149 (MQ=255) aaaCCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAggg < 1:264163/149‑1 (MQ=255) aaaCCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAggg > 1:673373/1‑149 (MQ=255) cTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTc > 3:568206/1‑127 (MQ=255) cTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTc < 4:568206/127‑1 (MQ=255) cTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGAt > 4:511848/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGaa < 4:53294/118‑1 (MQ=255) tGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGaa > 3:53294/1‑118 (MQ=255) gcTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAAt > 1:653936/1‑149 (MQ=255) gcTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAAt < 3:375497/149‑1 (MQ=255) tGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAAtct < 2:670068/149‑1 (MQ=255) aCTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTcc < 1:413185/142‑1 (MQ=255) aCTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTcc > 2:413185/1‑142 (MQ=255) aCTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGAt > 4:772657/1‑149 (MQ=255) cTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATc > 3:866858/1‑149 (MQ=255) cTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATc > 3:341364/1‑149 (MQ=255) taataataaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCg > 1:603659/1‑149 (MQ=255) taataataaAGTTGCTCTCAAAGACGTT‑AAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGc > 2:360030/1‑149 (MQ=255) taataaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCca > 1:599693/1‑149 (MQ=255) aataaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcat > 2:116925/1‑149 (MQ=255) taaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcatca < 1:154288/149‑1 (MQ=255) taaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcatca > 1:898150/1‑149 (MQ=255) taaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcatca > 1:228282/1‑149 (MQ=255) aaaGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcatcat > 3:227705/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGca < 3:344058/149‑1 (MQ=255) ttGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGcac > 4:323261/1‑149 (MQ=255) gCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCacac < 3:511848/149‑1 (MQ=255) tctcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTa > 3:441459/1‑149 (MQ=255) tctcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTa > 2:332472/1‑149 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGAt < 1:400635/97‑1 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGAt > 2:400635/1‑97 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATgaga < 4:820555/108‑1 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATgaga > 3:820555/1‑108 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGcc > 4:150791/1‑134 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGcc < 3:150791/134‑1 (MQ=255) tcAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATc > 2:63047/1‑149 (MQ=255) aaaGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATc > 1:666565/1‑96 (MQ=255) aaaGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGc > 1:434629/1‑149 (MQ=255) aaGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCt < 3:51051/149‑1 (MQ=255) gACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGca > 3:579081/1‑137 (MQ=255) gACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGca < 4:579081/137‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGc < 2:702243/149‑1 (MQ=255) aaaaGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGcc < 1:311691/149‑1 (MQ=255) aaaGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCg > 2:205484/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATTAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCg > 4:644547/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCg > 1:371889/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTACTTTTGCCg > 3:301960/1‑149 (MQ=255) aaGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCgg > 4:138407/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTTAAC‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGtttt > 3:357881/1‑144 (MQ=255) aGGTGCTCATTGAGCACCTTTTTT‑AACGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGtttt < 4:357881/144‑1 (MQ=255) gTGCTCATTGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACg < 1:205484/149‑1 (MQ=255) gCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGc < 4:227705/149‑1 (MQ=255) cTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCt < 3:193535/149‑1 (MQ=255) | CAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTT‑CT‑GTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTA > NC_000913/2753839‑2754133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |