| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3726014 | 968 (4.020) | 6 (0.020) | 5/516 | 17.8 | 0.62% | coding (128/996 nt) | wecH | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA) |
| ? | NC_000913 | 3726018 = | 953 (3.960) | coding (132/996 nt) | wecH | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 973 total aligned reads displayed.
GAGTCTTATTATTTATATCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAGCGCAATCGCACTGCTCTACATTGCG‑CTGTTTACCTCCATCAATATGGAGTTAGCGCTGAAAAACCTGCTGCAAAAGCCAGTGTTTTACCACTTGTGGTTTTTCTTCGCGATTGCGGTGATTTATCTGGTTTCACCGCTGATTC > NC_000913/3725737‑3726289 | tattatTTATATCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGtt < 2:501753/279‑1 (MQ=255) ttatttatATCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTCCTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCTACTGtct > 2:243747/1‑276 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCCACCAACTGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTCTTGGATTGATCCCCTGCGCGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATTATTCACACAACTATCTGGTATGTGACTAATTCCCCTAGTGTTAGCGCCTTCACTT‑GGGTTATCTCTAATTTACTgctatc > 4:343422/1‑275 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCCCTACCTGGTATGTGAACAATGCTCATCGTGTTAGCCCCGTGACAT‑GGGATATCGCCAATGtttttactac > 4:904761/1‑272 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCCCTACCTGGTATGTAACCAATGCCCATATTTTTATCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCaagttttttcattc > 4:507962/1‑268 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGATCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCACTGTTCTg > 1:10149/1‑275 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTg > 1:1255963/1‑275 (MQ=255) tataTCGGTATAGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCGGGTATGTGACAAATGCTCATAGTGTTAGCCCTGTCACATGGGGATATCGCCAATGTTCTGaaac > 2:453518/1‑278 (MQ=255) tataGTGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCtctc > 2:1024334/1‑280 (MQ=255) tGGCTGATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATCGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCACTGTTCTGAATTCTGCctct > 1:475522/1‑274 (MQ=255) 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gATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATTTCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTc > 3:1051198/1‑275 (MQ=255) gATATCTTACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTc > 1:885447/1‑275 (MQ=255) tACGAATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGc > 1:147926/1‑275 (MQ=255) tataAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCATTGTTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCTCTTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTcc > 3:153405/1‑275 (MQ=255) tAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCCTTCGTGTCATCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTAtct > 3:842118/1‑274 (MQ=255) aGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCCGATACAGAGACACAGATGCAGCCCATAATTAACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGCTTTACACCCCTACCCGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCAAATTTTTTGAATTTGGCCCCTCGTGTACGCTGGTCGCTATTTTTCATGATTTCCggtttaccct > 3:384023/1‑267 (MQ=255) aGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTAtctc > 3:578741/1‑274 (MQ=255) aGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCCCGCGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGCTTTCCGGCTATCTCtttttt > 2:126274/1‑280 (MQ=255) gATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTTATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTTGCGAACGCAtcg > 4:938608/1‑279 (MQ=255) gttattGCAGGGCGACAACCAAATAAGTTATCGGTAAGACTTTTTTTAAGCAGATAAAGAGAAAAAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCTGGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGcc < 4:655028/279‑1 (MQ=255) attccaggtgtccaaccaaATTGATTATCGGTCAAAATTTTTTTAACCAGATACAGGGACAAAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAg < 4:192368/269‑1 (MQ=255) tGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACTT‑GGGATATCGCCCATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTTTCTGCGTGCCGCTATTTTTCATTATTTCAGGCTATCTCTTTTTTGGCGCACGCCGAGCCCAGCCGCGcc > 2:426174/1‑280 (MQ=255) tGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATCTACTGGATTGAGAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATACCGCCCAGGTTCTGAATTCTGCCCCTCGTGTCAGCGTGCACCTATTTTGCTTGTTTTCCGGCCATCCATTTTTTGTCGTAGCGAGCGCCCTGcctgcc > 4:744242/1‑275 (MQ=255) cgcCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGTCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGcctt > 2:858062/1‑278 (MQ=255) aTGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCCAGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGGATCGCCCAGCCGCGCCTTTGCtgtctga > 4:1028635/1‑274 (MQ=255) tGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGAGACAGATACACAGATTCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGATGGATTGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTAt < 4:286110/280‑1 (MQ=255) ttctCGGTCAGACTTTTGTGAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGc < 2:802516/277‑1 (MQ=255) tATCGGTCAGACTTTTTTTCACCAGATAAAGAGAAACAGATGCAGCCCAACATTTACTGGATTGATAACTGTCGAGGGATGGCGTGTTTACTGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACTAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTAt < 3:1150489/275‑1 (MQ=255) 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tttttttAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTc < 1:190445/274‑1 (MQ=255) aTACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGGCGAACGCAGCGCCCAGCCGCGCCATTTCTTGCGTATCGGCTTATGTCTGATTTTTTATAg > 1:960374/1‑274 (MQ=255) aTACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATCTACTGGACTGATAACCTGCGAGGGATCGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGCCACAT‑GGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTTGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCAGTATTTCCGGCTATCTCTTTTTTGCCGCACGCAGCGCCCAGCCGCGCCAGTTCTTGCGTCTCGGCTGCTGTCGGATTTTTcatac > 3:780856/1‑273 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |