| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,927 | A→G | 5.3% | intergenic (+71/‑58) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,927 | 0 | A | G | 5.3% | 350.8 / 6.1 | 110 | intergenic (+71/‑58) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/55); new base G (3/3); total (52/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCC > NC_000913/2758779‑2759072 | aTGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATa < 4:678889/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCgg > 3:818670/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑a < 4:559573/149‑1 (MQ=255) cGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AAt < 2:334976/148‑1 (MQ=255) aaaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagc < 1:471219/148‑6 (MQ=255) aaaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGG‑aaatagc < 1:324843/148‑6 (MQ=255) tCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCata > 2:323116/1‑148 (MQ=255) ggatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTa > 3:508726/1‑149 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTa > 1:120005/1‑148 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTa > 2:290704/1‑148 (MQ=255) tggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaaa < 2:929547/148‑1 (MQ=255) gCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtt < 1:323116/148‑1 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaaa > 3:535220/1‑137 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTaaa < 4:535220/137‑1 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 1:712401/148‑1 (MQ=255) cGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 1:570072/148‑1 (MQ=255) gagaTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatt > 3:18647/1‑149 (MQ=255) gagaTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaat < 1:75367/148‑1 (MQ=255) gaTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattta > 3:500849/1‑149 (MQ=255) aTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa < 3:895685/149‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaat < 3:47992/149‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaa < 1:195170/148‑1 (MQ=255) tGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGc > 3:519920/1‑120 (MQ=255) tGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGc < 4:519920/120‑1 (MQ=255) tGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 1:739017/1‑148 (MQ=255) ggTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga < 3:70574/149‑1 (MQ=255) ggTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAag < 1:697843/148‑1 (MQ=255) gTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAagag > 4:676941/1‑149 (MQ=255) gTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAagag < 3:924665/149‑1 (MQ=255) cacaACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAt < 2:823567/148‑1 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAt > 1:685606/1‑146 (MQ=255) caACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAt < 2:685606/146‑1 (MQ=255) aaCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGc > 1:242255/1‑148 (MQ=255) aaCGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCa > 4:718796/1‑149 (MQ=255) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGt > 4:41485/1‑149 (MQ=255) cTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGtt < 4:500849/149‑1 (MQ=255) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTc > 3:605611/1‑149 (MQ=255) gTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 3:208079/1‑149 (MQ=255) tAAACTTATGTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCTCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa < 2:196054/148‑1 (MQ=255) aaaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt < 3:460817/149‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAg > 4:296913/1‑81 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAg < 3:296913/81‑1 (MQ=255) ttATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgt < 1:85502/148‑1 (MQ=255) ttGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTGAATGgtcgtc < 1:506038/148‑1 (MQ=255) ttGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTcc < 4:545404/149‑1 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCt < 3:360220/149‑1 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTAAATGGTCGTCCt < 4:713685/149‑1 (MQ=255) ggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc < 3:62158/149‑1 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc < 3:208180/142‑1 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTcc > 4:208180/1‑142 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg < 2:657841/148‑1 (MQ=255) aTGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGGATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt > 3:776937/1‑149 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt > 1:107138/1‑148 (MQ=255) gAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATg > 2:842836/1‑148 (MQ=255) aTACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATTCTGCTATTTCCACCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATCTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTcc < 3:103633/149‑1 (MQ=255) aTACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTcc < 4:618014/149‑1 (MQ=255) aCTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTa > 3:536376/1‑149 (MQ=255) cTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaa < 3:914367/149‑1 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAtt < 4:804886/78‑1 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAAtt > 3:804886/1‑78 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAAGTTAATTAAGTAAGAGGCCTTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaaa > 4:775011/1‑149 (MQ=255) cAATTGTTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaaa > 1:839621/1‑148 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaaa > 1:836953/1‑148 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaaa > 1:553798/1‑148 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTaaa > 3:2318/1‑92 (MQ=255) aTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTACTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTGTTAATTTAATTAAATAAGAGGCCTTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCAGTTCCTAAAAtt > 4:910020/1‑149 (MQ=255) gCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATc < 3:676941/149‑1 (MQ=255) cTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATc < 1:207265/148‑1 (MQ=255) cTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCACTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATc > 1:295805/1‑148 (MQ=255) tGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAg < 3:775011/149‑1 (MQ=255) gTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAgg > 3:806545/1‑149 (MQ=255) cATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGa > 2:560886/1‑148 (MQ=255) tCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAAt > 1:239698/1‑148 (MQ=255) tCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATg > 3:613070/1‑149 (MQ=255) tCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATg > 3:122850/1‑149 (MQ=255) gAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCa < 2:911504/148‑1 (MQ=255) aGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAt < 3:695807/149‑1 (MQ=255) tAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTAt < 4:613070/149‑1 (MQ=255) aaaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTCCCCGGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGAAATTTAt > 1:452170/1‑148 (MQ=255) aaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATg < 2:474943/115‑1 (MQ=255) aaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATg > 1:474943/1‑115 (MQ=255) aCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGa < 2:744402/148‑1 (MQ=255) aCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGa < 2:502925/148‑1 (MQ=255) cATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAg < 3:941911/149‑1 (MQ=255) cTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa > 4:78963/1‑149 (MQ=255) tGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt < 1:61398/86‑1 (MQ=255) tGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt > 2:61398/1‑86 (MQ=255) tGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGaa < 3:853075/149‑1 (MQ=255) gctattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAAc > 3:359249/5‑149 (MQ=255) tATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCa > 2:343859/1‑123 (MQ=255) tattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa < 4:7194/80‑1 (MQ=37) tattCCGCTATTAATGGCGGAAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 3:7194/3‑82 (MQ=37) aTTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAg < 2:49193/148‑1 (MQ=255) aTTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAg > 2:88351/1‑148 (MQ=255) tCCGCTATTAATGGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCAt > 1:384202/1‑148 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc > 1:307295/1‑148 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCACTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc < 2:295805/148‑1 (MQ=255) ccATTAATAGCGG‑AATAGCCATATATGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc < 1:842836/148‑1 (MQ=255) cATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCa > 2:821980/1‑148 (MQ=255) tAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCGTACGCAGGc > 1:4797/1‑148 (MQ=255) | ATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGG‑AATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCC > NC_000913/2758779‑2759072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |