| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 774,358 | T→A | 7.2% | L17Q (CTG→CAG) | ybgE → | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 774,358 | 0 | T | A | 7.2% | 423.3 / 19.2 | 125 | L17Q (CTG→CAG) | ybgE | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/66); new base A (5/4); total (55/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACGGC > NC_000913/774214‑774503 | aTTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCg < 2:498969/148‑1 (MQ=255) tCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGgc < 4:148588/149‑1 (MQ=255) gggAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGgcgc > 1:257313/1‑148 (MQ=255) ggAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCGCAGGGGGCGCt < 1:789316/148‑1 (MQ=255) gAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCtt > 1:881816/1‑148 (MQ=255) cGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGAAAAGCG‑CCCGCAGGGGGCGCttgtcc < 4:79141/149‑5 (MQ=255) cttcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCtt > 1:254013/1‑148 (MQ=255) cttcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCtt < 2:617435/148‑1 (MQ=255) tcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCg < 1:149624/148‑1 (MQ=255) tcttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGt < 4:73180/149‑1 (MQ=255) ttGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTg < 1:837641/148‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGAt < 2:490493/148‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGAt < 1:911135/148‑1 (MQ=255) tCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCtt < 3:922852/149‑1 (MQ=255) cACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGatg > 4:883743/1‑149 (MQ=255) cACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGatg > 4:846342/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTGGCGCTTGACCACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATATGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGatgt > 2:271299/1‑148 (MQ=255) ggCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTg < 3:932378/149‑1 (MQ=255) cgcTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTgg > 1:119582/1‑148 (MQ=255) gcTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCGCAGGGGGCGCtt > 4:102454/1‑105 (MQ=255) gcTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCGCAGGGGGCGCtt < 3:102454/105‑1 (MQ=255) gcTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGa < 3:844483/149‑1 (MQ=255) gcTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGa < 3:104611/149‑1 (MQ=255) acacGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑Tcc > 3:603176/1‑102 (MQ=255) acacGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCAtc < 4:303379/149‑1 (MQ=255) acacGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGACTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑Tcc < 4:603176/102‑1 (MQ=255) acacGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTAATGAGTGAGAGTATCGCGGCTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCAt < 1:496836/148‑1 (MQ=255) gTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGt > 3:76754/1‑149 (MQ=255) gTCGAATCAGGCAAAGCCGGCCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGt < 3:528705/149‑1 (MQ=255) tCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGtt > 4:40399/1‑149 (MQ=255) tCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGt > 2:501326/1‑148 (MQ=255) tCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGt < 2:338588/148‑1 (MQ=255) tCGAATCAGCCAAATCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATGGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGAACCCATGTCGtt > 4:519079/1‑149 (MQ=255) gAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGTCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGtttt < 4:259380/149‑1 (MQ=255) gAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGtttt < 4:367004/149‑1 (MQ=255) gAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGttt < 1:736016/148‑1 (MQ=255) tCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGc < 4:519765/149‑1 (MQ=255) aGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCcgc > 4:862208/1‑149 (MQ=255) gaaaaGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAACCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTAGTGCTGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTGTGCCGCGa > 4:703760/3‑149 (MQ=255) gCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCgg < 4:742245/79‑1 (MQ=255) gCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCgg > 3:742245/1‑79 (MQ=255) cAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGttt < 2:62995/140‑1 (MQ=255) cAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGttt > 1:62995/1‑140 (MQ=255) cAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGa < 1:447731/148‑1 (MQ=255) cAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGa < 2:194227/148‑1 (MQ=255) aaaGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGaa > 1:952662/1‑148 (MQ=255) aGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGa < 1:600344/148‑1 (MQ=255) aGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGAc > 3:205776/1‑149 (MQ=255) ggTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAg < 2:633955/148‑1 (MQ=255) tCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGtttt > 2:195978/1‑115 (MQ=255) tCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGtttt < 1:195978/115‑1 (MQ=255) cAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTAACGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATCGCGCTTCTGTTAGCACGATGTATGTTTTGGGACACATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGaa < 3:569325/149‑1 (MQ=255) agaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACt > 4:598982/1‑149 (MQ=255) gaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTg > 4:524328/1‑149 (MQ=255) gaagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTg > 3:246263/1‑149 (MQ=255) aagaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTg > 1:539788/1‑148 (MQ=255) aCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGaaa < 3:574306/149‑1 (MQ=255) aTCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATc > 3:246924/1‑149 (MQ=255) aTCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATc > 4:741940/1‑149 (MQ=255) tCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCt < 3:883743/149‑1 (MQ=255) cTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCt < 2:760661/148‑1 (MQ=255) tgatgaGTAAGA‑TATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTga > 1:437357/1‑147 (MQ=255) gatgaGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTgg < 1:150723/148‑1 (MQ=255) atgaGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGTACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCa < 4:438764/149‑1 (MQ=255) aGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATgg < 3:628971/149‑1 (MQ=255) gTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATgg < 2:881816/148‑1 (MQ=255) tAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGt > 3:895888/1‑127 (MQ=255) aaGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGtt > 1:264017/1‑148 (MQ=255) aaGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGtt > 1:117028/1‑148 (MQ=255) aaGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGtt < 2:301409/148‑1 (MQ=255) aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGttt < 1:573165/148‑1 (MQ=255) aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTa < 4:339717/149‑1 (MQ=255) ttATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTAt > 1:453109/1‑147 (MQ=255) ttATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTAt < 2:453109/147‑1 (MQ=255) ttATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTg < 4:246263/149‑1 (MQ=255) tATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTg < 1:504591/148‑1 (MQ=255) aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGc < 1:399182/148‑1 (MQ=255) aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCt < 4:156781/149‑1 (MQ=255) aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCt < 3:131896/149‑1 (MQ=255) cgACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCcg > 2:856228/1‑105 (MQ=255) gACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGAtgt < 3:862208/149‑1 (MQ=255) cTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTgg > 4:129163/1‑149 (MQ=255) ttGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTggg > 1:959703/1‑148 (MQ=255) ttGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGc < 3:755734/149‑1 (MQ=255) atacGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGt > 1:515677/4‑148 (MQ=255) tGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCt > 4:451180/1‑149 (MQ=255) gTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCtgtg < 2:662440/148‑1 (MQ=255) gTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGc < 4:381289/149‑1 (MQ=255) gTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGc > 4:184000/1‑149 (MQ=255) aaTGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCt > 1:576637/1‑148 (MQ=255) tGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTgg < 2:264017/148‑1 (MQ=255) tGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTgg < 2:119582/148‑1 (MQ=255) tGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTgg < 2:117028/148‑1 (MQ=255) aggaaaGCG‑CCCGCAGGGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtg > 3:162565/5‑149 (MQ=255) aggaaaGCG‑CCCGCAGGGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtg > 4:221522/5‑149 (MQ=255) ggaaaGCG‑CCCGCAGGGGGCGCTTGTCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgt > 1:675489/4‑148 (MQ=255) aCAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGgtgt > 2:675164/1‑148 (MQ=255) aaGCG‑CCCGCAGGGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTgg < 3:135514/108‑1 (MQ=255) cccccTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACg > 4:620502/1‑149 (MQ=255) cccTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACGGc > 4:17595/1‑149 (MQ=255) | ATTCTGGGAACGCTTCTTGCCTGTTCGTTTGGGGTAATCACCGCGCTGGCGCTTGAACACGTCGAATCAGGCAAAGCCGGTCAAGAAGACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCG‑CCCCCTGCGGGCGCTT‑TCCTTCGTGATGGCGCTTCTGTTAGCAGGATGTATGTTTTGGGACCCATCTCGTTTTGCCGCGAAGACCAGTGAACTGGAAATCTGGCATGGTTTATTGCTGATGTGGGCCGTCTGTGCTGGTGTGATTCACGGC > NC_000913/774214‑774503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |