| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 756,568 | A→C | 5.0% | D221A (GAC→GCC) | sdhA → | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 756,568 | 0 | A | C | 5.0% | 370.3 / 7.4 | 109 | D221A (GAC→GCC) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/55); new base C (3/3); total (51/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
AACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGC > NC_000913/756420‑756713 | aaCCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGa > 4:202301/1‑149 (MQ=255)aaCCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGa > 4:665817/1‑149 (MQ=255) aCCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGAc < 4:821255/149‑1 (MQ=255) ccAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACg > 3:377235/1‑149 (MQ=255) aGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGgt < 2:986670/149‑1 (MQ=255) gATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGTCGCCGgtgt > 2:649868/1‑149 (MQ=255) gATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGgtgt > 3:659902/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGTCGCCGgtgttaa < 3:644678/149‑4 (MQ=255) ggCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGTCGCCGgtgttaa < 1:649868/149‑4 (MQ=255) ggCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCgg > 3:806128/1‑149 (MQ=255) gcgGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCAt < 1:41180/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCAt < 1:868990/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCAt < 2:289169/149‑1 (MQ=255) gTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCACGGATAGCCATGcc < 1:3378/149‑1 (MQ=255) ccGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCAt > 2:196420/1‑133 (MQ=255) ccGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCAt < 1:196420/133‑1 (MQ=255) ccGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGc > 1:955266/1‑149 (MQ=255) aCTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTAc > 3:327549/1‑149 (MQ=255) tgCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGt < 2:972742/149‑1 (MQ=255) aTCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTATCGGTGCa < 1:245845/149‑1 (MQ=255) aaCCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGata > 2:687482/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGatat < 1:737805/149‑1 (MQ=255) aGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAAtgt < 4:166905/149‑1 (MQ=255) tGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTgg > 3:231535/1‑149 (MQ=255) tGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTgg < 4:82074/149‑1 (MQ=255) tGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTgg < 2:651935/149‑1 (MQ=255) gTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCa > 4:706516/1‑149 (MQ=255) tttATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATg > 1:65997/1‑137 (MQ=255) tttATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATg < 2:65997/137‑1 (MQ=255) tttATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAg > 3:413611/1‑149 (MQ=255) tttCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTcc < 3:665817/149‑1 (MQ=255) tCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGt < 3:201923/121‑1 (MQ=255) tCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGt > 4:201923/1‑121 (MQ=255) aaaGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGTCGCCGgtgtta < 3:331936/91‑3 (MQ=255) aaaGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGTCGCCGgtgtta > 4:331936/1‑89 (MQ=255) aaGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCAc > 1:496224/1‑146 (MQ=255) aaGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCAc < 2:496224/146‑1 (MQ=255) cccGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑Acc > 3:269304/1‑149 (MQ=255) cgcTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCa < 3:88531/149‑1 (MQ=255) cgcTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCa < 3:1007475/149‑1 (MQ=255) cTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGc < 4:976764/149‑1 (MQ=255) cTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGc < 4:391588/149‑1 (MQ=255) tGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCg > 1:448508/1‑149 (MQ=255) tGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCg > 4:342089/1‑149 (MQ=255) ggCGACTGGCGGAGTAGGGCGTATTTATCAGTTCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGCACCGGCAATGCCGGtcgg < 4:647711/149‑4 (MQ=255) gCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCggg > 3:755371/1‑149 (MQ=255) cGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGCACCGGCAATGCCGGtcgggt < 2:446005/149‑6 (MQ=255) cGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGc < 3:342089/149‑1 (MQ=255) gACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCg > 2:292888/1‑149 (MQ=255) gACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCg > 4:472774/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTa < 1:687482/149‑1 (MQ=255) ggAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGt > 2:151659/1‑149 (MQ=255) gggCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTgg > 2:46980/1‑102 (MQ=255) gggCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTgg < 1:46980/102‑1 (MQ=255) gggCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGa > 1:922465/1‑149 (MQ=255) gCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACCCCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAg < 4:257268/149‑1 (MQ=255) gTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGt > 4:483648/1‑149 (MQ=255) tATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTg > 4:925133/1‑136 (MQ=255) aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACTCCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgt > 2:38971/1‑149 (MQ=255) aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgt > 1:82925/1‑149 (MQ=255) aTCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgt < 3:578570/149‑1 (MQ=255) tCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCAGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtg > 2:410000/1‑149 (MQ=255) cAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtgg < 2:715468/149‑1 (MQ=255) gTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCgtggtg > 3:52966/1‑149 (MQ=255) tCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGa > 2:151447/1‑149 (MQ=255) tCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGa > 1:309699/1‑149 (MQ=255) tCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCAGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGa > 2:871900/1‑149 (MQ=255) ccaccaccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGaa < 1:292888/149‑1 (MQ=255) ccaccaccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGaa < 4:796475/149‑1 (MQ=255) accaccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAgg < 1:612510/149‑1 (MQ=255) caccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCg < 1:826610/149‑1 (MQ=255) ccaACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCTGTGCAGGATATGGAAATGTCGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGCGCGGGCGTACTGGTCACAGAAGGTTGCCGTGGTAAAggacgt < 2:409170/149‑5 (MQ=255) 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gCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATct < 4:269304/149‑1 (MQ=255) ccACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGTGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgc < 1:831928/149‑1 (MQ=255) acaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAg > 1:915862/1‑120 (MQ=255) acaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAg < 2:915862/120‑1 (MQ=255) acaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgctg > 3:166377/1‑149 (MQ=255) acaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgctg < 2:82925/149‑1 (MQ=255) acaTTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgctg > 1:107089/1‑149 (MQ=255) tAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaaca > 2:232308/1‑149 (MQ=255) gacacCGTCGCCGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaacaa > 1:213752/2‑149 (MQ=255) aaCACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaacaa > 3:453689/1‑149 (MQ=255) cacCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGtt > 4:490061/1‑116 (MQ=255) cacCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGtt < 3:490061/116‑1 (MQ=255) cacCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaacaaac < 4:40594/149‑1 (MQ=255) acCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCTGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGaacaaaca > 4:167495/1‑149 (MQ=255) acCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGc > 2:1005503/1‑117 (MQ=255) acCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGc < 1:1005503/117‑1 (MQ=255) cGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCgg < 3:103453/129‑1 (MQ=255) cGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCgg > 4:103453/1‑129 (MQ=255) cGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgct > 4:533346/1‑138 (MQ=255) cGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATctgct < 3:533346/138‑1 (MQ=255) cGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATg < 4:453689/149‑1 (MQ=255) ggCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCATCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATgg < 2:863467/149‑1 (MQ=255) gCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGc < 4:529254/149‑1 (MQ=255) | AACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCG‑ACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGC > NC_000913/756420‑756713 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |