| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3773239 | 565 (4.110) | 3 (0.020) | 3/504 | 12.9 | 0.54% | coding (959/1914 nt) | mtlA | mannitol‑specific PTS enzyme: IIA, IIB and IIC components |
| ? | NC_000913 | = 3774141 | 565 (4.240) | coding (1861/1914 nt) | mtlA | mannitol‑specific PTS enzyme: IIA, IIB and IIC components | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 585 total aligned reads displayed.
GGAATACGTTCAGGCGATGCTGGATCGTGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACA‑CCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAACATTGATGAAGGTTA > NC_000913/3773867‑3774418 | ggAATACGTTCAGGGGATGCTGGATCGTGAAACACTGACCCCGACTTAGCGGGGTGAGTCGATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGca < 2:57179/277‑1 (MQ=255)ggAATACGTTCAGGCGATGCTGGATCGTGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGca < 2:93943/277‑1 (MQ=255) gAATACGTTCAGGCGATGCTGGATCGTGAAAACCTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGcaca < 2:639885/278‑1 (MQ=255) gAATACGTTCAGGCGATGCTGGATCGTGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTgg < 1:510489/274‑1 (MQ=255) tACGTTCAGGCGATGCTGGATCGTGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGcaca < 3:487977/275‑1 (MQ=255) ttCAGGCGATGCTGGATCGTGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTATGGTGAGTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCTCATCCAGGTTATCACCACCCTGACCAATCAACCGGATGCTGAGCACGTCATGCCTCGTTTCGCACACc‑ccacc > 4:618860/1‑278 (MQ=255) aGGCGATGCTGGAGCGTGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATGGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACAca‑ccac < 1:296493/274‑1 (MQ=255) 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tGAAAAACTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGACGGCGTGCGCTTCGGTGAAGATGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTTGTATTGCTGCCCGTCACAACGACCAAATTCAGGTTAACACCAGCCTGACCACTGCACTGGATGATGAGTCGGTCATCAGCCGTCTGGCACCGA‑CCACCAACGTGGCGGAAGTTCTga > 4:268504/1‑277 (MQ=255) aaaaaCTGACCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAGGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCCCCAGCCTCACAAATGCCCTGGATGATGCGTCCGTCATCGAGCGTCTGCCACCAC‑CCACCAGCGTGGCGGAAGTGCTggca > 4:467684/1‑276 (MQ=255) aCCCCGACTTATCTGGGTGAGTCTATCGCGGTGCCACACGGTACGGTTGAAGCGAAAGATCGCGTACTGAAAACGGGCGTCGTGTTCTGCCAGTACCCGGAAGGCGTGCGCTTCGGTGAAGAAGAAGATGACATTGCCCGTCTGGTGATTGGTATTGCTGCCCGTAACAACGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACA‑CCACCAGCGTGGCTGAAGTGCTGGAActgct > 3:284908/1‑275 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
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| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |