| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,552,837 | Δ1 bp | 5.2% | intergenic (+17/‑64) | uxuA → / → uxuB | mannonate hydrolase/D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,552,837 | 0 | T | . | 5.2% | 603.9 / 23.9 | 172 | intergenic (+17/‑64) | uxuA/uxuB | mannonate hydrolase/D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/73); new base . (4/5); total (94/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GGTCATCAGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCG > NC_000913/4552692‑4552985 | ggTCATCAGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTgcg > 3:214503/1‑149 (MQ=255)ggTCATCAGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTgcg > 4:156354/1‑149 (MQ=255) gTCATCAGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTgcgc > 1:96056/1‑149 (MQ=255) catcaGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTgcgc‑gc > 3:1221587/1‑149 (MQ=255) tcaGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCg > 4:915107/1‑149 (MQ=255) tcaGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCg > 1:1447990/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGc < 3:966315/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGACGACCTGAAGAAGACAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGcc > 4:1429997/1‑149 (MQ=255) cTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGt < 3:817621/149‑1 (MQ=255) tGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGtg < 2:1001326/149‑2 (MQ=255) ggACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTc < 3:733991/149‑1 (MQ=255) gacgacCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTcc > 4:1109144/1‑149 (MQ=255) gacgacCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTcc < 1:295234/149‑1 (MQ=255) gacgacCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTcc < 1:23337/149‑1 (MQ=255) cTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCttcttc < 4:514915/149‑1 (MQ=255) cTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCttcttc > 3:652370/1‑149 (MQ=255) cTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGt < 4:574735/140‑1 (MQ=255) cTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGt > 3:574735/1‑140 (MQ=255) aagaagaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCtt < 3:636840/149‑1 (MQ=255) agaagaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTg > 3:360117/1‑149 (MQ=255) gaagaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGc > 1:443860/1‑149 (MQ=255) gaagaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGc > 1:1179729/1‑149 (MQ=255) gaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGt > 2:38970/1‑149 (MQ=255) aaccaaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGTCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCAc > 3:917930/1‑149 (MQ=255) aaccaaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCAc > 3:1183330/1‑149 (MQ=255) aaccaaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCAc > 1:651291/1‑149 (MQ=255) ccaaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCActc > 1:247792/1‑149 (MQ=255) caaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCActct > 4:1029243/1‑149 (MQ=255) aaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCtt > 1:454257/1‑149 (MQ=255) aaccCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCtt < 2:984868/149‑1 (MQ=255) accCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCttt < 4:652370/149‑1 (MQ=255) accCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCttt < 2:1447990/149‑1 (MQ=255) ccAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGa < 1:747513/149‑1 (MQ=255) aGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAg > 1:355985/1‑149 (MQ=255) tCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGAtt > 4:364909/1‑149 (MQ=255) tCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGAtt < 1:1026075/149‑1 (MQ=255) tCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGAtt > 4:1142662/1‑149 (MQ=255) tCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGAtt > 3:1029462/1‑149 (MQ=255) tCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGAGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGTCGTCACTCTTTGAAGACGGAtt > 4:1222233/1‑149 (MQ=255) aaTTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGa < 2:862538/149‑1 (MQ=255) tGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGCCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGGTAATATCAACCGGCATGGCTGCGT‑GCCATGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCGTTGAAGACGGATTCTGGACtt < 4:921345/149‑1 (MQ=255) gtcTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGa > 3:299670/1‑149 (MQ=255) gtcTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGa < 4:440417/149‑1 (MQ=255) gtcTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGa < 4:741323/149‑1 (MQ=255) tcTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTGAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGAt < 1:1399718/149‑1 (MQ=255) cTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGt > 4:776690/1‑92 (MQ=255) tGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTg > 3:1430700/1‑136 (MQ=255) tGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGa > 4:662908/1‑149 (MQ=255) gAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGac > 2:149563/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGTTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGacta < 4:23397/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGactac < 4:482935/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGActacta < 2:1210233/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAtt < 1:1094956/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAttgtt < 2:247792/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAttgtt < 2:1456395/149‑1 (MQ=255) cGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGa < 1:1370431/149‑1 (MQ=255) gAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAttgtt > 2:932828/1‑146 (MQ=255) gAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGAc > 1:856467/1‑149 (MQ=255) aGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAg < 4:286235/149‑1 (MQ=255) tCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCaa < 2:982019/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAAt < 2:359764/149‑1 (MQ=255) tgtCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGcc < 4:768944/149‑1 (MQ=255) gAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGtt > 4:725278/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTg > 2:1255592/1‑149 (MQ=255) gCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgcccgc > 3:931339/1‑149 (MQ=255) gATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCa > 1:627055/1‑130 (MQ=255) gATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCa < 2:627055/130‑1 (MQ=255) gATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTgcccgccc > 4:339245/1‑149 (MQ=255) gATCCAGCGCGCGTTCTTTAGGCGTGAAGATCGACGGGGATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGCTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGGTGACAGCAATCTGCCGGTTgcccgccc < 2:923737/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCAt < 1:898629/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATg > 2:171949/1‑149 (MQ=255) tttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCa > 1:53466/1‑149 (MQ=255) tttctttAGCCGTCAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa < 1:1035662/115‑1 (MQ=255) tttctttAGCCGTCAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa > 2:1035662/1‑115 (MQ=255) ttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCAt < 3:683389/149‑1 (MQ=255) tttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATtct > 2:172974/1‑149 (MQ=255) tttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATtct > 3:456484/1‑149 (MQ=255) tttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATtct > 1:761818/1‑149 (MQ=255) ccGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCt < 2:85573/149‑1 (MQ=255) ccGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCt > 3:370319/1‑149 (MQ=255) cGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTg > 2:845070/1‑149 (MQ=255) ttAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGa > 3:1083704/1‑149 (MQ=255) atatCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAGTc < 3:496468/149‑1 (MQ=255) atCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGa > 1:1494772/1‑96 (MQ=255) atCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCAc > 1:18835/1‑149 (MQ=255) tCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACg > 2:1433375/1‑149 (MQ=255) ccACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGc < 3:148058/149‑1 (MQ=255) aaCCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCTCTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCa > 2:1281481/2‑149 (MQ=255) aCCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAt > 2:1378327/1‑149 (MQ=255) aCCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAt > 2:1350507/1‑149 (MQ=255) aCCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCAt > 1:1316262/1‑121 (MQ=255) aCCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAt > 1:596372/1‑149 (MQ=255) ccGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAtt < 2:454257/149‑1 (MQ=255) ccGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAtt < 1:1213575/149‑1 (MQ=255) gCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATtgtg < 3:7491/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCa > 1:819425/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCa < 4:1029462/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCACCCGTCATgg > 4:1324785/1‑116 (MQ=255) tGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCACCCGTCATgg < 3:1324785/116‑1 (MQ=255) tGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCg > 3:906438/1‑149 (MQ=255) | GGTCATCAGATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCATCTCG > NC_000913/4552692‑4552985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |