| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 847,213 | A→T | 7.6% | intergenic (‑94/+45) | glnP ← / ← glnH | glutamine transporter subunit/glutamine transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 847,213 | 0 | A | T | 7.6% | 303.1 / 10.5 | 93 | intergenic (‑94/+45) | glnP/glnH | glutamine transporter subunit/glutamine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/41); new base T (2/5); total (46/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CACCTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCTCGTCGC > NC_000913/847065‑847361 | cACCTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCa > 1:467624/1‑149 (MQ=255) aCCTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCAt > 3:279335/1‑149 (MQ=255) cTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑g < 1:158446/149‑1 (MQ=255) cTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑g < 3:747926/149‑1 (MQ=255) ttCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑gg > 1:261667/1‑149 (MQ=255) ttCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑gg > 1:356017/1‑149 (MQ=255) aTCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGGGCCCTTCACCTTATTCCTCTCCCCAAT‑gggggg > 3:535439/1‑147 (MQ=255) tCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGgaga > 1:163063/1‑149 (MQ=255) cAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCC‑TATGGGGagag < 3:101621/149‑1 (MQ=255) aGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCTAT‑GGGGAGAgg < 3:19691/149‑1 (MQ=255) ggaGCGGAATGGCAGGGCAGATGGCACTCCAGTCAAACTTCATATGTTGTTCCTGTTACCGGGGTGTAAATAATCAAATTCAAGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCTAT‑GGGGAGAgga < 4:535439/147‑2 (MQ=255) gAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCTAT‑GGGGAGAgga < 1:290353/149‑2 (MQ=255) aGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGaa < 3:739869/149‑1 (MQ=255) cGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTTAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACt < 4:237935/149‑1 (MQ=255) ggAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTg > 4:301835/1‑149 (MQ=255) ggAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCTAT‑GGGGAGAggattagg < 3:582756/149‑7 (MQ=255) aTGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCa < 4:707905/149‑1 (MQ=255) aGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCg > 3:746161/1‑149 (MQ=255) ccAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGttt < 4:626122/149‑1 (MQ=255) aTGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACa < 2:168893/149‑1 (MQ=255) aTGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACa < 4:799394/149‑1 (MQ=255) cACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCa < 4:220840/133‑1 (MQ=255) cACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCa > 3:220840/1‑133 (MQ=255) cTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTa < 2:47862/149‑1 (MQ=255) aaCTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGttatta > 2:154372/1‑149 (MQ=255) aCTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTtattat > 2:681807/1‑149 (MQ=255) cTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTattatt > 2:268704/1‑149 (MQ=255) tGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTAttt < 4:127941/149‑1 (MQ=255) tGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGGAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTGGCACCCCTCACCATAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGTAGGAGCGTgagtatgt > 2:234300/1‑147 (MQ=255) gttgttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg > 2:513106/1‑144 (MQ=255) gttgttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg < 1:513106/144‑1 (MQ=255) gttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCTTA‑GGGGTGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGAGTAGCGTTATTATTTCg > 1:309025/1‑141 (MQ=255) gttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg > 3:161263/1‑141 (MQ=255) gttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg < 4:161263/141‑1 (MQ=255) gttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg < 2:309025/141‑1 (MQ=255) gttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTa < 3:301835/149‑1 (MQ=255) ttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATTGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg < 1:577107/140‑1 (MQ=255) ttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCg > 2:577107/1‑140 (MQ=255) ttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTAc > 1:639650/1‑149 (MQ=255) ttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTAc > 1:617450/1‑149 (MQ=255) ttCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTAc < 2:163063/149‑1 (MQ=255) cGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCAttt > 4:743857/1‑149 (MQ=255) gtgtAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGgt < 1:18158/109‑1 (MQ=255) gtgtAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGgt > 2:18158/1‑109 (MQ=255) gtgtAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTg < 4:746161/149‑1 (MQ=255) gtgtAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTg < 4:279335/149‑1 (MQ=255) gtAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTa > 1:496032/1‑149 (MQ=255) ataatCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑gg < 1:206308/72‑1 (MQ=255) ataatCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑gg > 2:206308/1‑72 (MQ=255) taatCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGgaga < 2:501388/76‑1 (MQ=255) taatCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGgaga > 1:501388/1‑76 (MQ=255) atCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCg > 1:607281/1‑149 (MQ=255) atCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCg < 3:743857/149‑1 (MQ=255) tCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGa < 3:638802/77‑1 (MQ=255) tCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGa > 4:638802/1‑77 (MQ=255) tCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTAc < 1:484287/125‑1 (MQ=255) tCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTAc > 2:484287/1‑125 (MQ=255) cAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGtt < 2:639650/149‑1 (MQ=255) cAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGtt < 2:617450/149‑1 (MQ=255) ttCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTaa < 1:268704/149‑1 (MQ=255) gggTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTc < 2:467624/149‑1 (MQ=255) ggTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTcc < 1:154372/149‑1 (MQ=255) 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tCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACt > 1:799168/1‑149 (MQ=255) tCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACt > 3:301786/1‑149 (MQ=255) aCCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACttt < 2:261667/149‑1 (MQ=255) ccTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGt > 4:133866/1‑149 (MQ=255) ccTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGt > 3:523148/1‑149 (MQ=255) ccTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGGTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGGTTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGt > 2:454073/1‑149 (MQ=255) cTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTc < 1:681807/149‑1 (MQ=255) tAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAAc > 3:719295/1‑131 (MQ=255) tAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAAc < 4:719295/131‑1 (MQ=255) ttcccTCTCCCCTAT‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTTAACGCGCCGTTGACTTTGTCAc < 1:492126/146‑1 (MQ=255) ttcccTCTCCCC‑TATGGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCAc > 2:492126/4‑149 (MQ=255) tCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGc > 3:732954/1‑149 (MQ=255) ctctCCCCTAT‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAg > 2:771299/1‑149 (MQ=255) cATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCtcgtcg > 2:804673/1‑149 (MQ=255) aTA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCTCGTCGc > 1:786314/1‑149 (MQ=255) | CACCTTCAATCAGAAGCGGAATGGCAGGCCAGATGGCACTCCAGTCAAACTGCATATGTTGTTCCTGTTACCGTGGTGTAAATAATCAAATTCAGGGTAATTAATGGCCCCGGAGCGGGTTTGCGCCCCTCACCCTAATCCTCTCCCCATA‑GGGGAGAGGGAACTGCCAGTGCGTTTTACAGGTGTAGCGTTATTATTTCGGTTCAGTACCGAACCATTTTTTGTAGATTTCGTTGTAAGTTCCGTTCTCGCGCAGGGTTTTCAACGCGCCGTTGACTTTGTCACGCAGCTCGTCGC > NC_000913/847065‑847361 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |