| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 25521 | 194 (0.920) | 7 (0.030) +GGC |
4/496 | 17.7 | 3.5% | coding (315/495 nt) | lspA | prolipoprotein signal peptidase (signal peptidase II) |
| ? | NC_000913 | 25522 = | 196 (0.910) | coding (316/495 nt) | lspA | prolipoprotein signal peptidase (signal peptidase II) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GGCTGGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACTGCCATCTGTGTCGGTGCGGCACTGATTGTGCTGGAAGGTTTTTTGCCTTCTAGAGCGAAAAAACAATAATAAACCCTGCCGGATGCGATGCTGACG‑CATCTTATCCGGCCTACAGATTGCTGCGAAATCGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAAA > NC_000913/25247‑25798 | ggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGGATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGCAGATGTATCGCTCGAAGGCCACGACGA‑GGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑ggcgg > 2:54627/1‑280 (MQ=255)ggctgGTGGTAGTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGCTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGTCGTGCTGATGTACCGCTCGACGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCTCTTACGCGCTGATTTTT‑‑‑ggctg > 4:271686/1‑278 (MQ=255) gTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATNTGCATTATGCGCGTAATTATGGCCCGGCGCTTCGTTTCTTTGCCGATAGCGGCAGCTTGCAGCGGTGGTTCTTTGCCTGTATTTCGATTGGGATTAGCGTGCTCCTGGCAGTGCTGACGTATCACTCGAAGGCCAAGCACA‑AACTAGACACATA‑CGCCTAAGCACTGATTATT‑‑‑gacgaggccaggggaa > 4:506364/1‑268 (MQ=255) gTCGTGCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATACCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCC‑CTGGGCa > 2:510090/1‑280 (MQ=255) gTCGTGCTGAGTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTGGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCGTACGCGCTGAATATT‑‑‑GGCGgcgcg‑c < 1:882051/274‑1 (MQ=255) ctggttggttATCGATCTGGGCATCAAATTCCTGAGCCTCCCGAACTGTGCGCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAAc < 4:142705/272‑1 (MQ=255) gCTGATTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGTGCTTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGCTGATGTATCGCCCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGTTTCCGCGCTGCTTATT‑‑‑GGCCGCGCG‑CTGGGc > 1:631598/1‑274 (MQ=255) aTTATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTACACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑TGGCGCGCG‑GTGGGGAACCTTTTCg > 4:462782/1‑280 (MQ=255) tATCGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTCTTGCGATTGGTATTCGCGTGATCCTGGCAGTGATGTTGTATCGCTCGGAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATAGCGCTTACGCGCGTCTGATT‑‑‑GTCGGCTCG‑TTCGGCCAACGGTTCgca > 4:637811/1‑278 (MQ=255) cGATCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑c > 2:93748/1‑280 (MQ=255) aTCTGGGCAGCAAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGAc < 1:701716/275‑1 (MQ=255) tGGGCAGCAAATACCTGATCCTCTAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTGTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGGTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGTTCCTGGCAGTTATGACGTTCCGCTCGAGGGCCAC‑CAGACAGGCAAACA‑ATATCCCTTTCGCGCCTATTATG‑‑‑TGCTGCTCC‑GTGGCGAACCTGtttcacc > 3:1201612/1‑268 (MQ=255) gcagcaAATACCTTATGCTCCCGAACTTTGGTCTGGGGGTTACGGTCCCGGTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCa < 4:695146/280‑1 (MQ=255) gcagcaAATACCTGATCCTCACGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCa < 2:271686/280‑1 (MQ=255) caAATACCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGCTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTGGACCG‑CCTGTGGc > 3:548005/1‑275 (MQ=255) tACCTGGTCCTGCCGGAGTGTGGTCTGGGGGAGTCGGTCCCGCGGTTCCCGTGTCTTAATCTGCATTATGCTCGTAGTTATGGCGCGTGTTTTAGTTTCCTGTCCGATTGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGCTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCg < 4:54627/280‑1 (MQ=255) aCCTGATCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTTGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑CTATCGCTTACGCGCTGCTTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACGG‑CCTGTGGCACGGc > 1:505097/1‑275 (MQ=255) aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCCGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCCCGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CGTGGCCACCTGTTCGACCG‑CCTGGGGCACGGCGTCGTTGCCg > 4:74818/1‑280 (MQ=255) aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTTCGATTGGTATTCGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCTCTGAGTATT‑‑‑GGCGGAGAG‑CTGGGCGACCTGTTACAACG‑CCTGTCGCCGGGCGTAGTTGGCg > 2:182826/1‑280 (MQ=255) aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGGTCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGATGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGAATATT‑‑‑GGCGG‑GCGCCTGGGCAATCTTTTCCACCGCCCGGTGGCA‑GGCTTCGt > 3:456550/1‑275 (MQ=255) aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCGACGCCGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGCTTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCGGTTGACCGGCTTCGTTGTCg > 2:857001/1‑280 (MQ=255) aTCCTCCAGAACTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCg > 2:650195/1‑280 (MQ=255) gaccTTTGCTCTGGGGGATACGGTCCCTCTGTTCCCGTCGCTTAATCTTCATTATGCGGGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGata < 1:766808/272‑1 (MQ=255) tGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTCGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGCTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGGTCCCAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCCCG‑CTGGGCAACCTTTTCGACCG‑CCGGTGGCACGGCCTCGTTTTCGATATGATCg > 3:425205/1‑275 (MQ=255) tGCTCTGGGGGATACGGTCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCTCC‑CTGGGCTACCTGTTCGACCG‑CCTTGTGCACTGCTTCGTTTTCGattttgtcg > 3:735615/1‑268 (MQ=255) tCCCGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑GTGGGCAACCTCTTCGACCG‑CCGGTGGCACGGCTTCGTTTTCGATAGGATCCACTTCTTCCT‑CGGctc > 3:1120132/1‑272 (MQ=255) cGCTGTTCCCGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATTTGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCCCt > 2:586769/1‑279 (MQ=255) cgtttgcctttgCTTAATGTGCATTTTGCGCGTTACGTTGGGTGGGCGTTTAGTTGCCTTGCCGATGTGGGCGGCTGTCAGCTTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGCTTGGTATTAGCTTGGTCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCATCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCg < 4:287567/269‑1 (MQ=255) cccGTCGCTTAATCTGCATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGAATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTTGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATAATGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACACGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTCTGTTGTCGCTATGATCGAATTCTACGT‑CGGCGAc > 1:246386/1‑265 (MQ=255) ccGTCGCTTAATCTCCATTATGGGCGGAGCTATGTCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGc < 3:236428/275‑1 (MQ=255) gCTTAATCTGCATTAGGCGGGTAATTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAAc < 2:472603/280‑1 (MQ=255) cATTATGCGCGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCTATATGAGAGACTTCTAAGT‑CGGCGACGGGCACTTCGCCACCTTCCACCTTGcccgta > 2:501009/1‑276 (MQ=255) gcgcGTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTTGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTAAACCTTTCCGTTACTGCCa > 2:361716/1‑280 (MQ=255) cgcgTTACTGTGCTGGGGCTTTTAGTTTCCTGGCCGGTAGCGGCGGCTGGCAGGTTTGGTTCTTTGGCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGCATCGCTCGAAGGCCACCCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTTGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACt < 3:177401/275‑1 (MQ=255) cgcgTAGCTATGGGGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACt < 1:1071097/275‑1 (MQ=255) cgcgTAAGTGTGGGGGGGGTTTTAGTTTCGTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCCGCGTTGGTTCTTTGTCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACTGCCAt < 4:229751/280‑1 (MQ=255) gcgTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTCCGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCCCTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACTg > 1:21145/1‑275 (MQ=255) 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gTAACTATGGCGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGATAGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACTGc > 3:582173/1‑274 (MQ=255) atctgtGGGGCGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGGTGGCGGCGGCTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGAGCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAGGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATT‑‑‑GGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACTGCCAt < 3:273946/270‑1 (MQ=255) cTATGGCGGGGCGTTTAGTTTCCTTGCCGGTAGCGGCGGCTGGCAGAGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATTGGTATTAGCGTGATCCTGGCAGTGATGATGTATCGCTCGAAGGCCACGCAGA‑AGCTAAACA‑ATATCGCTTACGCGCTGATTATTGGCGGCGGCGCG‑CTGGGCAACCTGTTCGACCG‑CCTGTGGCACGGCTTCGTTGTCGATATGATCGACTTCTACGT‑CGGCGACTGGCACTTCGCCACCTTCAACCTTGCCGATACTGcc < 3:1069163/274‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |