| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4295832 = | NA (NA) | 9 (0.050) | 5/438 | 15.8 | NA | intergenic (+38/+604) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| ? | NC_000913 | = 4296394 | NA (NA) | noncoding (560/600 nt) | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑A‑‑CCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGAAATACCAGGTTGCCTTGTCATCGTCGGCCTTAATGCCCACGCCGTTGGCGTA > NC_000913/4296165‑4296672 | gACAACAACGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCGGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCGGATTTCGCGTGATTTTGTAGTTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCTCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCACCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg < 2:188349/280‑1 (MQ=11) aTGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTc > 2:167707/1‑280 (MQ=16) aCGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 1:732675/1‑274 (MQ=16) cttgccgcgTCTGATCAGGCCTACGCAAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGGAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 1:883399/270‑1 (MQ=255) ggtttgaTCAGGCATAAGCCAGACTGCGCAATAGCCCGATTTAGCGTGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCACACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑ccc < 2:259300/274‑1 (MQ=14) taaaagaccgaCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGCTAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑cc < 1:1043618/264‑1 (MQ=255) ggCCTACGCCAGACAGCGAAATAGCCTGATTTAGCGTGATTGTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCaaa < 2:328417/279‑1 (MQ=255) cTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTcac > 3:913095/1‑263 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCaaa < 1:947544/274‑1 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCaaa < 1:813144/274‑1 (MQ=255) cGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGt > 3:867639/1‑267 (MQ=255) gCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑ccc < 1:913095/263‑1 (MQ=255) ccgACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCtt < 1:1120338/273‑1 (MQ=255) cAGACAGCGACAGAGCCTGTTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCtt < 1:33284/275‑1 (MQ=255) aGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCa < 1:867639/267‑1 (MQ=255) gACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCTTCTTATCAGTCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAACCCCTTc > 1:1019437/1‑274 (MQ=255) aggtaaaTAGCCTGATTTAGCGGGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATTCCGCATCTGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATa < 1:246759/270‑1 (MQ=255) aGCGCAATAGCCTGATTTAGCTTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCACCGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCt < 2:559506/280‑1 (MQ=255) aGCGAAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTTGAGGTTGGATAAGGCG‑TTTATGCCTCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATa < 1:393427/275‑1 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGCTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACCTCAATGCCTGATGCGATGCTTGCCGCTTCTCATCCGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACCTTTCACC‑CCCGGTATCAAAcctggcctt > 3:1043618/1‑265 (MQ=14) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGCATTAGCGTGATTTCGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGTCGCTTGCCGCGTCTTTTCAGGCCTATCTTACCCGTTGGTTAATTTTTCAAAGTCTTCACA‑CCCGTTATCACACTCTTCCCTAc > 3:866279/1‑274 (MQ=14) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACa > 1:335257/1‑275 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTATTAACA‑cc > 4:356643/1‑253 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACCCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACC‑CCCGGTCTCAACCCCTTCCATAc > 3:618633/1‑274 (MQ=255) aaTGGCCTGAGTCGGCGGCATTTTGTTGGTTGGAGAAGGTG‑TTGTGGCCGCATCGCACATCAGCGACTGGTGCTACGGTTAAGGCGTTGTATCAGGCCGACGACAGCCAGCGGTATAGACTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTGCG‑‑CCGCCTCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCGTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACT‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCt < 3:323171/275‑1 (MQ=12) aaTAGCTTGATTTAGACGGTTTTTGTCGGT‑GGAATAGGCGATTTATGCCGCGTACCACATCAACGCCTGTTGCGACGCTTGCTGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGAAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTGGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCt < 3:776446/275‑1 (MQ=17) tAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTca > 1:432563/1‑244 (MQ=255) cTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑cc < 3:432563/244‑1 (MQ=255) tgctttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGtt > 1:12684/4‑274 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAAcc > 2:593975/1‑279 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGGTAATTTTTAAACACCTTCACA‑CCCGGTACCAAACCCTTCCATTAAGCCCAGGtt > 1:489725/1‑274 (MQ=14) tttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 3:159896/1‑225 (MQ=255) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 1:159896/225‑1 (MQ=255) gCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCCTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTca > 1:32318/1‑232 (MQ=255) 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atttttgaagTCGGATAAGGCG‑TATCTGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTACCGCTTCTTATCAGGCATACGCCATACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAAGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCt < 2:505152/270‑1 (MQ=18) agtttGTAGGGCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAGCGCCTGATGCGACGCTGAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAAGGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCt < 2:589027/277‑1 (MQ=255) tGTAGGTCCGATAAGGCG‑TTTATGCCGCAGCCGACATCAACCCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCt < 1:574240/275‑1 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTACTTTTTCAAACTTTTTACA‑CCCGCGATCCAACCCTTCCATACATCTCCGGTTCAACCCGTACAGCGCCtttttcc > 4:624900/1‑276 (MQ=17) cGGATAAGGCG‑TTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATTAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCtt > 1:172015/1‑275 (MQ=255) g‑TTTATGCCGAATCGGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATaaa < 2:702332/280‑1 (MQ=255) 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tATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGAGGCGACGCTTCACGCCTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTCAGCGTGATTTTGTAGGTCGGCTAAGGCGTCT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACTGTTGGTTAATTTTTCAAA‑TCTTCACA‑ACGGGTCACAAACCCTTCAATACACCTCCGGTTCACCCATTGCAGCGCCTTTTGCTTGttctgcccggtct > 3:544145/1‑266 (MQ=17) aTGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACA‑CCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATaa > 3:754111/1‑275 (MQ=255) aCATCAACGCCTGATACGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCCATACACTGATTTAGCGTGATTTTTTAGGGCGGATAAGGCGTTT‑‑ACGCCGCATGCGAAATCAATCCCGTATGCGACGCCTGCCGCGTCTTCTCCGGCCTATCTTAACCGTCGTTTAATTTTTCAAACTCTTCACT‑CCCGTTATCCAACCCTTCCATCCAGCCACGGTTCAACCATTGCCGCGCCTTTTGCTTTTTCTTCTTGATAATCCCtttttcc > 3:711689/1‑273 (MQ=17) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |