| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2069089 | NA (NA) | 4 (0.020) | 4/506 | 16.2 | NA | noncoding (1183/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2069093 = | NA (NA) | noncoding (1179/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GGTTATTGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGT > NC_000913/2068814‑2069204 | ggTTATTGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTtgc < 2:135944/276‑1 (MQ=255) tATTGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTCTATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGAACTTCCCGTGGCGAGCCATAACCCAGAGCACTCTGACGTGGCCATT‑CGTGCGAAGCCTCAGATGCCTCGGCTAGGTTCTTggccg > 4:570602/1‑273 (MQ=25) aTTGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATATTGCTCGAACTCCTCTTCAAGGTTCTTtgctgc > 1:672645/1‑275 (MQ=255) aTTGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTtgctgc > 3:138714/1‑275 (MQ=255) aTTGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCNTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTTCCGCAGCTATTCCCGTGGCGCGCGACACCCCAGCCCACTATGCGGATCCCATT‑CGTTATACTTACCGAACGCCCCCGCAAGGGTCCTttctcac > 4:533434/1‑273 (MQ=25) ttaCCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTTGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCAATT‑CGTGATAATGCTCGAACGCCGCTGAAAGCTACTTTTCTGCTGt > 2:265478/3‑276 (MQ=25) tGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACACGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACACAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGt > 2:549234/1‑276 (MQ=255) tGACCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTAGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAACCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCACGTGGCGAGCGATAATCTAGCGCACTAGGCGGATGCCAAT‑CGGTATAATGCTCGAACGCCTCTGTAAGGTTCATTGCTGCCg > 1:329528/1‑275 (MQ=25) aCCAACAAACATTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGtt > 3:864177/1‑275 (MQ=255) caaaaaACACGGCAGAACCCAACCAATGCACCAAGAGCCGATAATTTGCAGGAAATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAGCTCCTGGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCGGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGAGGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTaa < 3:263830/275‑1 (MQ=18) aacaaacaTTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTCTGCGGATGCCATT‑CGCTATAATGCTCGAACGCCCCTGCAAGGGTCTTTGCTGCCTTTAAc > 4:742508/1‑275 (MQ=255) aacaaacaTTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATTCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTTCTTCCGTTaa > 1:876472/1‑274 (MQ=255) aacaaacaTTGCAGAACTCCACCAATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAACCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGTCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGCTGCCACT‑CGTGATCATTCTCGCACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGCTacc > 4:78935/1‑273 (MQ=25) 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atCCACCCAGGCCTCCAGAGCCGATAATTTCCAGGACATCCCCGCGGTAAAGATAACAGAAAAGCCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAACCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAGAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCa < 3:321552/274‑1 (MQ=18) caccaATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTTGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACACATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCCCTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGACCGCCCCCGACAGGTTCTTTCCTGCCTTTAACCCGTCTGCTTTGGGCATGAt > 4:323341/1‑276 (MQ=21) caccaATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGTTTTGCCCCTATTTTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCCGATATTCCCGTTGCGAGCGATAACCCAGCCCACCATGCGGTTGCCATT‑CGTTCTTATACTCTAACGCCACTGCAAGTTTCTTTCATTCCGTTAACCCGCCCGGTTTTGGctttga > 4:94245/1‑271 (MQ=21) caccaATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCTTTAACCCTACTGGTTTCGGCATGa > 2:267658/1‑275 (MQ=255) caccaATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCCCCGGAGTAGAGATAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCCCTGCAAGGTTCTTTGCTGCACTTCACCCTTCTGGTTTGGGCCTg > 4:949396/1‑274 (MQ=255) caccaATGCCTCCATAGCCGATAATTTGCAGGACATCACCGCAGTAGAGATAACAGACACCTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAAGCCGAATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATACTTCCAGACATCTGTTATCACGTAACCCATGACAAACCAACTGCCGCAGATATTCCAGTGTCGAGCGACAACCCAGAGACCTATCCGGCTGACATTGCGTCA‑CATGCTCCACAGCCGCGACGAGGCTCTTGTCTGCCTTGAACCCGTCTgtgtgtggagtgtt > 4:690426/1‑263 (MQ=255) 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agtagtGATAACATACATCCCCTTGGCATGCCGTAAGCTAATCCGCATTCTTGGCTTGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTTCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAGAATCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTg < 4:421842/275‑1 (MQ=14) gagaTAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGATCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCGTT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCACGGTTCTTTGCTTCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGAGATTGATTTAGTCCCTGTTTATCGTTTTCCCGATCCTCCCTGTTAtt > 4:937478/1‑276 (MQ=17) gagaTAACAGACAACTCCTTGGCAGGCCGTAAACAAATCCGCATTCGTGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGCTGCCATT‑CGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATTATACTGATCTAGTCACGCTTTCTCGTTTCAACTGACCTCTCTGcct > 3:59902/1‑272 (MQ=17) 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NC_000913/2068814‑2069204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |