| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 2,494,426 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑24/‑269) | yfdX ← / → ypdI | uncharacterized protein/putative lipoprotein involved in colanic acid biosynthesis |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 203 (1.060) | 92/512 | 0.5 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2494426 = | 0 (0.000) | intergenic (‑24/‑272) | yfdX/ypdI | uncharacterized protein/putative lipoprotein involved in colanic acid biosynthesis | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGC‑CACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGT > NC_000913/2289839‑2290386 | cactgctgcATGACGTGACGGCTGAGACTGGTTTCCAGCGGATACGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTTGGGTAAAACGTCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGTGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCAt < 4:469886/273‑1 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |