| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,585,156:1 | +C | 5.2% | coding (1331/2280 nt) | ydeP ← | putative oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,585,156 | 1 | . | C | 5.2% | 764.6 / 36.1 | 174 | coding (1331/2280 nt) | ydeP | putative oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (81/84); new base C (5/4); total (86/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.53e-03 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GAATCATCGACATTGAATCCTCAACGGTTACCGCCTGCGCACCGTTTTTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTAACAGATAATGGTGCGTTCGGCAG > NC_000913/1584884‑1585417 | gAATCATGGACATTGAATCCTCCACGGTTACCGCCTGCGCACCGTTTTTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTAAGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑ca < 2:71665/275‑1 (MQ=255) cATTGCATCCTCAACGGTTACCGCCTGCGCACCGTTTTTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCa < 2:336757/274‑1 (MQ=255) aTTGAATCCTCAACGGTTACCTCCTGCGCCCCGTTTTTTTGCATGGCAATCTCGATACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCAGTAAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTAAATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAg < 1:111372/274‑1 (MQ=255) tCAACGGTTACCGCCTGCGCACCGTTTTTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCCTGAgg > 2:433010/1‑275 (MQ=255) cAACGGTTACCGCCTGCGCACCGTTTTTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCACGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATGT‑CAGGATGTCAAGGTGCATGAggg > 2:232668/1‑274 (MQ=255) cttcgcACCGTTTGTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGATAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCTAAATCTAATGGCGTTAACGGTAAAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCAt < 1:100055/272‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATg > 2:425624/1‑238 (MQ=255) cGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCg > 4:387068/1‑274 (MQ=255) tataGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCCCCCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTtcccaggtaaacc > 4:263283/1‑263 (MQ=255) tGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCg > 2:382068/1‑275 (MQ=255) ggagTCAACAGATGTGAGCGGTTAAGCTTNNGGGCTACGTGGCCCGCAAAATCTAAGTGCGNTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGNCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGcc < 3:59878/272‑1 (MQ=255) gTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCt < 2:258837/274‑1 (MQ=255) gTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCGTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGcc < 2:516687/272‑1 (MQ=255) cgtgagCGGTTAAACTTGGTGGCTAGGTGAACCGCAAAAGCTAAGGGGGGTAGCGGTACAGCGATCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGGGCCAAATGGGCCCCCATGAAGAGCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCAGGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCGCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag < 4:257903/271‑1 (MQ=255) agggCGGGTAAGTCTAGTGGCCACGTGTACCGCCAAATCTAAATGCTTAAACGTTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGAGCAATGCTCTAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTagag < 4:187327/271‑1 (MQ=255) cGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCACATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGAATGCTGGCCATTG‑CAGCATGTCCAGGGTCATg > 4:281735/1‑173 (MQ=255) cGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGGTTCTCGGGGATAACGACGGTTCGGTCGCCCTGTAAATTagctgtcg > 1:22458/1‑268 (MQ=255) ttAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTAGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTAAATTAGAGTGTCCAc > 2:103703/1‑274 (MQ=255) tAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑cagc > 6:326892/1‑148 (MQ=255) ggCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑ca < 6:349807/142‑1 (MQ=255) tACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGAACAGGGGTGGGTTACCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCTTGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCCCCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCa < 4:103702/274‑1 (MQ=255) ccGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATg < 7:946427/148‑1 (MQ=255) tCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTc < 8:199972/130‑1 (MQ=255) tCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTc > 7:199972/1‑130 (MQ=255) tCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTgggg > 8:37905/1‑148 (MQ=255) tAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑c > 8:262078/1‑120 (MQ=255) tAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTg‑c < 7:262078/120‑1 (MQ=255) gTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCAt < 8:52878/148‑1 (MQ=255) gTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATCCCGACGGTTCGGTCGACCTTTACATTACGATTTCCACGTAGGGGGCAGATTACCGCACCCGGCTTGCCAATGTTaac > 4:163040/1‑273 (MQ=255) ttAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCa > 6:329019/1‑122 (MQ=255) ttAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGagcgctat > 8:453974/1‑141 (MQ=255) ttAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACCCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGATTGTCCACGTATTTGGCAGATACCCGACCCAGGGTTGCCAATGTTACCt > 4:432974/1‑275 (MQ=255) ggTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCCGCGCAAAATTGCCCCCCGTGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACAAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTtcat < 1:159371/275‑1 (MQ=255) cAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCAcc > 6:599740/1‑148 (MQ=255) gctcgctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGa > 6:1103327/1‑148 (MQ=255) gctcgctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGcc < 4:100615/201‑1 (MQ=255) cgctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGa < 6:1126376/125‑1 (MQ=255) cgctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGa > 5:1126376/1‑125 (MQ=255) gctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGAt > 2:114920/1‑274 (MQ=255) ctTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGc < 5:599740/148‑1 (MQ=255) ttCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGcc < 5:1103327/148‑1 (MQ=255) tCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCa > 7:441753/1‑148 (MQ=255) tCCCGATCTGGCACTTCCAGCCCAAACTTGCCCCCCATCCCGATCAATGCTCGGGCCTGCCCCGTACCTATTGCTTGCATGCTGGAAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGAc < 4:527857/275‑1 (MQ=255) ccGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCT‑GCAATTg‑ccagc < 8:427790/93‑5 (MQ=255) cGATCTGGCATTGCCAGCGCAAACTTGCCCCCCCTGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAgcg < 6:884574/128‑1 (MQ=255) cGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGGGGGGTGAAGCCATAgcg > 5:884574/1‑128 (MQ=255) cTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGtt < 1:90718/273‑1 (MQ=255) cTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCAAGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGc > 1:57443/1‑275 (MQ=255) ggCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTg < 7:746897/106‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAgg > 5:346452/1‑91 (MQ=255) ttGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGa < 8:441753/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCAAAATTGCCGCCCAGCGAGATCAATGCGCCGGCCTGCCCCGTAGAGATTGTTTGCATGCTGGCAATCG‑CAGGATGTCCAGGGGCATGAGGTGGGGGTAAGCCATAGCGCTCACCCAGTCGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCCTCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTc < 4:503618/275‑1 (MQ=255) aaaTTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCgg < 5:326892/148‑1 (MQ=255) tGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGAt > 6:219633/1‑148 (MQ=255) ccccATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCg > 8:584062/1‑148 (MQ=255) caggCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTg < 2:263284/270‑1 (MQ=255) aaTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATccc < 2:256508/275‑1 (MQ=255) aTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAg > 8:86144/1‑77 (MQ=255) aTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTg > 7:937743/1‑111 (MQ=255) aTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTg < 8:937743/111‑1 (MQ=255) aTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTg < 6:464737/111‑1 (MQ=255) aTGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGcc > 6:1020981/1‑148 (MQ=255) gAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTcct > 2:189628/1‑274 (MQ=255) gcctgcccgtgtgatatTTGTTGCGTGCNGNCCATTG‑CGGCATGTGCGGGTGCAGGGGGTTGGGGTAATCCATAGCNCTCCCCCGGACGGGCCAGAAACGCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACNTTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTa < 3:45157/262‑1 (MQ=255) gCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCACCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTa < 2:99219/275‑1 (MQ=255) ccTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACAtt > 6:734188/1‑148 (MQ=255) ccTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACAtt < 5:734188/148‑1 (MQ=255) cTGCCCCTGCCATATTGCTTGCGTGCTGGCACTTG‑CGGCATGTCCAGGTGAATGGGGTGGGGTGAAGCCACAGCGCTCACCCCGGCGGGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTAAc < 4:433009/275‑1 (MQ=255) tGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGAt > 2:448292/1‑214 (MQ=255) tGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACCCTGCAGACGGTTTCTCAGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag < 5:219633/148‑1 (MQ=255) tGCCCCGTACATAGTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTa < 1:60277/272‑1 (MQ=255) tGCCCCGAACAGATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTa < 2:163041/272‑1 (MQ=255) cccGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTCGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTtct > 6:965552/1‑109 (MQ=255) cccGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAAGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTtct < 5:965552/109‑1 (MQ=255) ccGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAgtg > 6:986007/1‑148 (MQ=255) ccGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGAc < 4:448291/214‑1 (MQ=255) tACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCgg < 7:321204/108‑1 (MQ=255) tACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGt > 1:8107/1‑126 (MQ=255) tACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTc > 1:45157/1‑261 (MQ=255) tatTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGcc < 3:8107/126‑1 (MQ=255) atTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACg < 7:1119546/74‑1 (MQ=255) atTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTAACAGATAATGGTGCg > 2:515904/1‑275 (MQ=255) tgcttgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag < 7:503214/134‑1 (MQ=255) tgcttgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGt < 5:1020981/148‑1 (MQ=255) cttgcATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAg < 8:1041456/72‑1 (MQ=255) cATGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCg > 7:422265/1‑115 (MQ=255) aTGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAgtgt > 6:784166/1‑132 (MQ=255) aTGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAgtgt < 5:784166/132‑1 (MQ=255) aTGCT‑GCAATTGCCAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGa > 8:134426/1‑148 (MQ=255) tGCCGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAgg < 2:273242/160‑1 (MQ=255) ggCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAg > 7:660290/1‑135 (MQ=255) gCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACg > 6:89291/1‑99 (MQ=255) gCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACg < 5:89291/99‑1 (MQ=255) gCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTg < 8:739251/136‑1 (MQ=255) cAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAg < 5:38723/133‑1 (MQ=255) cAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAg > 6:38723/1‑133 (MQ=255) cAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTg > 7:5569/1‑135 (MQ=255) ttG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag > 6:943313/1‑117 (MQ=255) ttG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTag < 5:943313/117‑1 (MQ=255) tG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCa > 8:252242/1‑148 (MQ=255) | GAATCATCGACATTGAATCCTCAACGGTTACCGCCTGCGCACCGTTTTTTTGCATGTCAATCTCGCTACGTCCCAGGACCGGCAGAATATAGCTATGCCGTGCGGTCAACAGATGAGAGCGGTTAAGCTTAGTGGCTACGTGTACCGCCAAATCTAATTGCGTTAACGGTACAGCGCTCGCTTCCCGATCTGGCATTGCCAGCGCAAAATTGCCCCCCATGCAGATCAATGCTCGAGCCTGCCCCGTACATATTGCTTGCATGCTGGCAATTG‑CAGCATGTCCAGGTGCATGAGGTGGGGTGAAGCCATAGCGCTCACCCAGACGAGCCAGAAACTCTGCAGACGGTTTCTCGGTGATACCGACGGTTCGGTCGCCCTGTACATTAGAGTGTCCACGTAGTGGGCAGATACCCGCACCAGGCTTGCCAATGTTACCTTTCATCAACAGCAGATTGACCAGTTGCTGTACGTTCTGGGTACCATGTTCGTGCTGAGTGATCCCCATTCCGTAACAGATAATGGTGCGTTCGGCAG > NC_000913/1584884‑1585417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |