| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3063139 = | 159 (1.010) | 11 (0.070) | 8/252 | NT | 7.1% | coding (153/996 nt) | argK | membrane ATPase/protein kinase |
| ? | NC_000913 | 3063168 = | 138 (0.920) | coding (182/996 nt) | argK | membrane ATPase/protein kinase | |||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
CGTCATTCCGCCGCAGGATTACGCCTTCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTT > NC_000913/3062868‑3063408 | cGTCATTCCGCCGCAGGATTACGCCTTCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGc > 2:80650/1‑272 (MQ=255) gatgtcgccgcCGGATTTGGCCTTCCTGTAAGTGGGCGGGGGTGCGGCAATTTATGGGCCAGGTACCCCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTCCTGAATCTCATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCGGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTaa < 4:87049/269‑1 (MQ=255) cATTCCGCCGAAGGATGACGCCTTCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTaa < 2:495686/274‑1 (MQ=255) ttCCGCCGCAGGCTTACGCCTTCCTGCAAGGGGGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAaca < 4:473705/274‑1 (MQ=255) tCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGNCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGCNATCAGGCCATCAGTACGCAGCTGCGTGATGCCATTCTGCCCTACCNCNGACACACCCGGCCACCGGGCGTTACCgg > 3:42108/1‑275 (MQ=255) tCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCgg > 2:365748/1‑275 (MQ=255) gcgcGGCGTGGCGGGGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGgc < 2:177999/275‑1 (MQ=255) ggcggcGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGAGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGaaa > 2:462869/1‑275 (MQ=255) cTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCCCCGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCC‑tgttgt > 2:521954/1‑275 (MQ=255) cGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAg < 1:128992/244‑1 (MQ=255) tGAAACTGATAGGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCCCCCTGGCAGAAAGT‑TTTCGCCGCTTACGTACGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGt < 4:170155/275‑1 (MQ=255) gATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCCTCAGGCACTAAGAACGCTGCTGCTAGCTGCCATTATGCCGTACTGAGGTAACACCATGCTCCTGGGAGTTACCGGANC‑CCCCGGCGCGCGGCAAAGTACATCTATGTAGGCGTTGGGCACTGTTGTTG‑TTCGAGAGGGATTTAAGGTccgggt > 3:113347/1‑269 (MQ=255) atcatGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATAAAAGGTCGCGGTTATTTCGGTGGa > 4:212589/1‑275 (MQ=255) gttAATGAAGCCAGGCTGG‑AGGAAGTGATTCGCCGGTTACGTACGGGGGAGCTGGCCACGCTCGCCCAGGCCATGACGCTGGGGGAAAGCCGTCACACGCTTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCGTGAGTCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTAGATCCcag < 4:283594/274‑1 (MQ=255) aTGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGATTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCgg < 7:845050/148‑1 (MQ=255) gAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCgg < 5:790563/146‑1 (MQ=255) gCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAaca > 8:950972/1‑148 (MQ=255) gCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCt > 2:565246/1‑152 (MQ=255) ccACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTTTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGGGGTTATTGCGGTCGATCCCAGAACCCCGGTc > 4:364158/1‑275 (MQ=255) aCGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACAccc < 5:180374/148‑1 (MQ=255) ggttttatccccgagaatgctaccgccagtgaccgagctgctgggatcgaccgcaataaccgcgacctttaatccctctcgaatcaacaacatgccataggcctcaagaaaggtacttttccccgcgccgggggtgcCg < 6:681417‑M1/2‑1 (MQ=255) gCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTg < 6:840432/148‑1 (MQ=255) aGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTggg < 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cgTCAGCCGGCACTGAGTACGCAGTGGGTTGTGCCCATTTTGCCGGGCTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGGGTTACCGGCAA‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGGACCTTTCTTGAGCCCTTGGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCg < 4:56204/274‑1 (MQ=255) caacatgccaaaggcctcaagaaaggtacttttccccgcgccgggggtgc‑GGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCa > 6:951064‑M1/51‑81 (MQ=255) caGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGa < 5:345772/91‑1 (MQ=255) ggCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGttgttg < 6:43981/124‑1 (MQ=255) ggCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCg < 5:641235/129‑1 (MQ=255) cACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGaaa > 8:462793/1‑89 (MQ=255) 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aCTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCg > 2:40628/1‑275 (MQ=255) aaGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGt < 6:494789/88‑1 (MQ=255) aCGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑tgttgt > 8:555907/1‑112 (MQ=255) aCGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑tgttgt < 7:555907/112‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCa > 7:622952/1‑105 (MQ=255) cGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCa < 8:622952/105‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTgg < 2:540321/172‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGCAGCGGCGTTTAGTCGCCCGGTAACATCCCACGGCCATCTGGGCGGTGcccga > 4:138961/1‑272 (MQ=255) agaaaggtacttttccccgcgccgggggtgcCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTa > 8:594650‑M1/32‑57 (MQ=255) agaaaggtacttttccccgcgccgggggtgcCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTa < 7:594650‑M1/26‑1 (MQ=255) gctgctTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAg > 4:306318/1‑221 (MQ=255) 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tGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCg > 8:696965/1‑136 (MQ=255) tGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGcgcg < 2:148386/273‑1 (MQ=255) tGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGcgcg < 2:215595/273‑1 (MQ=255) aTTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTaa < 6:577149/112‑1 (MQ=255) 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CGTCATTCCGCCGCAGGATTACGCCTTCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGT‑ATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCA‑TGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTT > NC_000913/3062868‑3063408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |