| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4332094 | NA (NA) | 8 (0.050) | 5/246 | NT | 6.2% | intergenic (+90/‑22) | proP/pmrR | proline/glycine betaine transporter/putative membrane‑bound BasS regulator |
| ? | NC_000913 | = 4332102 | 120 (0.820) | intergenic (+98/‑14) | proP/pmrR | proline/glycine betaine transporter/putative membrane‑bound BasS regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CGACACCGGCGGCGTCAGATATACAGGAAGCGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCAATCCCGCCATAACGGCTGTCCATACGTACAAACGCTTTACTCAACTCCCCGC > NC_000913/4331847‑4332371 | cGACACCGGCGGCGTCAGATATTCAGGAAGCGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGaaa > 2:146306/1‑275 (MQ=255) aGCGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACGACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGTCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GACGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTTTTTATGATAGTTTAACTAcag > 2:306728/1‑273 (MQ=255) aGCGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCTCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTAGGAAAGTTTAACTAACg > 2:95481/1‑275 (MQ=255) aGCGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAACAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCg > 1:157115/1‑275 (MQ=255) cGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCgtg > 4:399482/1‑275 (MQ=255) aaGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGtt < 2:125063/275‑1 (MQ=255) cgAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtggtg < 2:318263/274‑1 (MQ=255) ttACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTcagca < 2:399483/275‑1 (MQ=255) cAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGACTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCCGTCTTATCAGGCCAATTTAACTCTTTAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGATGAACGTGAAATGAAAAAGCGTCTTTCTGAAAGTTTTACTACCTTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCACCAGCTTTCTTTAAATcc > 4:64953/1‑273 (MQ=255) atatTGACCACGAGATGACCGGTTTGAAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGGTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTa < 4:240692/274‑1 (MQ=255) tGACCACGAGATTGCCGATTTTCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATc > 4:135460/1‑256 (MQ=255) cACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGt < 2:135461/256‑1 (MQ=255) gagaTTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATATCTGACGCGCATACTCTCCTCCGGGTTAAC‑GGAGGAGCGTGCAATGAAAAACCGTGTTAATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCATGTACTGCtctttatt > 2:485811/1‑275 (MQ=255) aTTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAg < 4:282045/275‑1 (MQ=255) ttGCCTATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGTTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAg < 1:98542/274‑1 (MQ=255) tGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGcc < 4:146305/275‑1 (MQ=255) ggCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑g < 5:1114882/148‑1 (MQ=255) ggCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑g > 8:396465/1‑148 (MQ=255) cccGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAc < 7:129676/136‑1 (MQ=255) cccGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAc > 8:129676/1‑136 (MQ=255) cGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑gg > 5:354717/1‑136 (MQ=255) gcgAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctt > 1:93335/1‑189 (MQ=255) aTTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCCGGTTAAC‑GGCTGAGAGTGCAATGAANAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGNTTGCTACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGGNGNACGTCTCTTGCCGGTTTTTCAGGgaaa > 3:50618/1‑274 (MQ=255) aTTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttctt < 3:93335/189‑1 (MQ=255) tgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCa > 6:323027/1‑118 (MQ=255) aaGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCaa < 5:930691/114‑1 (MQ=255) cTGTAACGGATGGGCGGTTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCGCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATg < 4:127685/274‑1 (MQ=255) aaaCGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑gga > 8:852766/1‑97 (MQ=255) cGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGt > 6:849249/1‑148 (MQ=255) cTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGaaaa < 8:435339/103‑1 (MQ=255) tcaTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTAACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTa < 8:734616/120‑1 (MQ=255) tGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTaa > 5:568394/1‑123 (MQ=255) tGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTa > 7:734616/1‑122 (MQ=255) aTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTNTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTNCCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAANCNACCCGTGAAGCAACTGTGTAAttcct > 3:53799/1‑269 (MQ=255) aTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACg > 2:365015/1‑177 (MQ=255) gtgACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTcagc < 6:1032370/148‑1 (MQ=255) tgACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCg < 5:1092061/124‑1 (MQ=255) ggACGATGTATTATCAGCACAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGGGCTTAATATCTTCCTGATTAACGGGAGGAGA‑TGAAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACGACCGTGTGCAAGGTGCTGGGGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTGCTTCGGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAGCTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGAc < 4:517220/274‑1 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACTCGCATACTCTCCTCCAGGTGAAC‑GGAGGAGAATGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACa < 2:159555/275‑1 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACt < 4:365014/177‑1 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCaa < 1:53799/256‑1 (MQ=255) cTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑ggagg > 5:330129/1‑77 (MQ=255) cTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑ggagg < 6:330129/77‑1 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACt > 2:344158/1‑274 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACt < 2:335736/274‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGc > 2:517221/1‑263 (MQ=255) cTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑Ggaggag < 8:19001/75‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTaa > 8:1127115/1‑109 (MQ=255) ttATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCg > 6:1011852/1‑123 (MQ=255) tATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttctt < 8:641645/145‑1 (MQ=255) tATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttctt > 7:641645/1‑145 (MQ=255) tATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttc > 7:318020/1‑143 (MQ=255) ccAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GTAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGCTCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGATTTGCAGGATAAACGGCCTGGTATGCCACTTTTTAAAGCGGCTTACAGTAGTTACCCCCAGAc > 2:78701/1‑274 (MQ=255) ccAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttc > 7:418216/1‑136 (MQ=255) tGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtgg > 6:283957/1‑116 (MQ=255) tGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtgg < 5:283957/116‑1 (MQ=255) gAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTa > 5:719440/1‑93 (MQ=255) gAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTa < 6:719440/93‑1 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa > 8:886995/1‑85 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa < 7:886995/85‑1 (MQ=255) ctctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGCGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTTCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCAATCACGcc > 1:6983/1‑275 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAg < 8:891795/102‑1 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTca < 5:772675/116‑1 (MQ=255) ttAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGTGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctt > 6:964947/1‑122 (MQ=255) tAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGCAAAAcc < 6:615330/69‑1 (MQ=255) tAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTg > 8:320954/1‑148 (MQ=255) cACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCAATCCCGCCATAACGGCTg > 2:411043/1‑274 (MQ=255) tAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTg > 6:543556/1‑93 (MQ=255) tAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTg < 5:543556/93‑1 (MQ=255) tAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttcttt > 7:160100/1‑115 (MQ=255) tAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttcttt < 8:160100/115‑1 (MQ=255) tAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTtata > 7:836593/1‑118 (MQ=255) tAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTtata < 8:836593/118‑1 (MQ=255) aTCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTg > 6:88488/1‑120 (MQ=255) aTCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTg < 5:88488/120‑1 (MQ=255) aTCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGtc > 7:744240/1‑122 (MQ=255) ctGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTa < 7:872989/59‑1 (MQ=255) ctGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTa > 7:205538/1‑148 (MQ=255) gagcATCCTGTCCTCCGGGTTAAG‑GGAGGGGATTGCAAGTATAACGAGTTTGTATAAAATTTAAACGTCCGTTTTGAGCGTTCTGGTGGTCAGCAGTTTTCTTTATATAGTTTTTGCCACTTACTGATGTTGTTGCAGCCTAACCCAGGCCGGCGTGCGGGAAGTCTCTTCCCGGTTTTGCAGAAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATCCTAAACCCCAGACCATTCCCGCCATAACGGCTGTCCATACGTACAAACg < 4:95480/273‑1 (MQ=255) cgcATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTc < 7:508081/90‑1 (MQ=255) cgcATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTAc > 7:434562/1‑143 (MQ=255) cgcATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTAc > 5:447758/1‑143 (MQ=255) cgcATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTAc < 8:434562/143‑1 (MQ=255) cgcATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTAc < 6:447758/143‑1 (MQ=255) cATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCAATCCCGCCATAACGGCTGTCCATACGTACAAACGCt > 2:123452/1‑274 (MQ=255) tctcCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCaa > 4:217316/1‑234 (MQ=255) ctcctcCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGctttct < 7:167905/93‑1 (MQ=255) tcctccAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATTCGGCTGACAGTACTTAACCCCAGACCAATCCCGCCATAACGGCCGTCCATCCGTACCAACGCTTTACTCaa > 2:220339/1‑275 (MQ=255) cctccAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTc < 5:992113/80‑1 (MQ=255) cctccAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTc > 6:992113/1‑80 (MQ=255) ctccAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCAATccc < 2:217317/234‑1 (MQ=255) tccAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTg < 7:931345/98‑1 (MQ=255) ccAGGTTAAC‑TGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTATCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGa < 8:975600/148‑1 (MQ=255) ccAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTg < 6:491272/102‑1 (MQ=255) ttAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGtct < 8:728387/148‑1 (MQ=255) ttAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCCTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGa < 5:295879/143‑1 (MQ=255) tAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtgg > 6:1127326/1‑66 (MQ=255) aC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCtt < 8:205538/148‑1 (MQ=255) c‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGt < 7:975321/90‑1 (MQ=255) c‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGt > 8:975321/1‑90 (MQ=255) | CGACACCGGCGGCGTCAGATATACAGGAAGCGAAGGAAATTCTCGTCGAGCATTACGATAATATCGAGCAGAAAATCGATGATATTGACCACGAGATTGCCGATTTGCAGGCGAAACGTACCCGCCTGGTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAC‑GGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCGGTTTTGCAGGAAAAACTGCCCGTGATGCAACTGTGTAATGCGGCTGACAATACTTAACCCCAGACCAATCCCGCCATAACGGCTGTCCATACGTACAAACGCTTTACTCAACTCCCCGC > NC_000913/4331847‑4332371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |