| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,827,811 | T→G | 5.5% | K150T (AAA→ACA) | astB ← | succinylarginine dihydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,827,811 | 0 | T | G | 5.5% | 374.7 / 13.1 | 110 | K150T (AAA→ACA) | astB | succinylarginine dihydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/53); new base G (4/2); total (55/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.42e-02 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CGTCCGGGTTTTGCTGGGCGAAAATCACCTGTTGGGGATTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCGGAATAAACGGACGCTCGTGCGGCGGGATCA > NC_000913/1827539‑1828078 | tCCGGGTTTTGCTGGGCGAAAATCACCTGTTGGGGATTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGACGGCCGGGTACCCTTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGCCAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGCCGATCGTGGTTTATCGCCCCTTCCTCCCCGCGCCACGCTACCCTGGGCAACGCCCACTGCACGCCCAATTTCTCTTCGCTCTTACAAATTCCTTTTa > 4:22172/1‑274 (MQ=255) tCCGGGTTTTGCTGGGCGAAAATCACCTGTTGGGGATTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGTCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCCCTTCGTCGTTAACAATCGCTTTTa > 2:10947/1‑274 (MQ=255) ttGGGGATTCACTGGTCTCGGCTGTGACACCGCCCCGCTGGCTTCGCTGGTATTTCGCGCCGGATAACGGGAATGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCGCGCCCATAGACAAAAAGTTGCATCCCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGC‑TTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCg < 4:247507/274‑1 (MQ=255) ttGGGGATTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGCCGTCAAAAATCGCTTTTAACACCGATTCAGTGACGGGCGCTTACGGCg > 1:118887/1‑275 (MQ=255) ggggATTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGaa < 2:448188/275‑1 (MQ=255) aTTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGt < 2:122085/275‑1 (MQ=255) aCCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTGTCAGCGAACGGTTaat > 2:34653/1‑274 (MQ=255) aTTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCACTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGGGAAATTTAt > 1:54842/1‑275 (MQ=255) aTTAAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTa < 2:22172/274‑1 (MQ=255) acattGCCACCGGCTCGCTGGCTTCGCGGGTTTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGtt < 2:249758/271‑1 (MQ=255) ttgaccccgccgCGGTGGCTTCGGGAGTCTGTCGCGACGGATAACCGGAAGGCCTGGGATCATTGCCCTCTTCTCGCCCGTAGACCAAAAGTTGCATACCCGGTTTGCCGTAAGGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAgg < 4:186852/269‑1 (MQ=255) ttCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCa < 4:283132/275‑1 (MQ=255) tgggggggcTGTCTCGCCGGATAACGGGGGGGCCGGGTATCATTGCCTGCTTCGCGCCCGTCGACAAAAAGTTTCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCa < 4:34652/266‑1 (MQ=255) aTTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTTACGGGCTCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAAGGGTGGGCTGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGACAG‑TTGCCCGATCGTTTcc > 4:73673/1‑274 (MQ=255) ctggCCCGTAGACAAAAAGTTGCATAACCTGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTGGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGTCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTAc < 2:222816/271‑1 (MQ=255) cGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTa > 6:500521/1‑148 (MQ=255) gCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCAATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCcac > 2:536165/1‑275 (MQ=255) aaaaGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCtt > 5:927344/1‑133 (MQ=255) aaaaGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCtt < 6:927344/133‑1 (MQ=255) aaaaGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAg > 7:474021/1‑148 (MQ=255) aGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGa > 8:725085/1‑148 (MQ=255) ttGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAANAATCGCTNTTANCAGCGANTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGTGGAAATTTATTGTTCAgg > 3:24479/1‑184 (MQ=255) cATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCtt < 8:489487/125‑1 (MQ=255) aTACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTgg < 1:24479/184‑1 (MQ=255) tACCCGGTTCACCTGAATGACCGCCGAGAAGGTTGTGGTTTGCCGCCCCCGCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGAc < 4:445635/274‑1 (MQ=255) cccGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACg > 5:926523/1‑141 (MQ=255) ccGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGa > 6:1000690/1‑130 (MQ=255) cGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGgcg < 5:1084416/143‑1 (MQ=255) cGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGgcg > 6:1084416/1‑143 (MQ=255) gTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAg < 5:500521/148‑1 (MQ=255) ttCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGc > 6:260574/1‑148 (MQ=255) tCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTCAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTCAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGCACGGGTAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CCAATGGGGCGATGGTTGCAGCATTGGCAACCCACATTGCGGAGACGGAACGGAAGCGGGAAAg > 4:277882/1‑275 (MQ=255) taCCGTAAAGACCGGCTAGACGATTGGGGTTTGCCTCCCCCTCATCACCGAGCAACGGTACCTGTGGCAACGCCGAATGGAAGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGc < 4:394780/274‑1 (MQ=255) aaTGACCGCCGAGACGAATATGGTTTGCCGCCCCCTCTTCACCGAGCCACCCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTCAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCTATTCAGTGACGTGCGCTGCCAGCGACCCGTGTAATTCATTCTTCGGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTCACGG‑CGGATGGCGAGATCGTTGCAGCATTGGCCACCGACATTCGCGAACCGGACCTTACGATTGACAGCCAGTGc > 4:164571/1‑275 (MQ=255) aCCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAAc > 2:304790/1‑251 (MQ=255) cgccgAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGcc > 2:271044/1‑275 (MQ=255) agaCGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCa < 5:29033/111‑1 (MQ=255) cGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTg < 2:107923/274‑1 (MQ=255) aTTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAgg > 7:801477/1‑148 (MQ=255) ttgGTTTGCCGCCCCCCGATCACCGGGCAACGATACCTGGGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATGTCGCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACt < 4:252775/273‑1 (MQ=255) tttGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGa < 5:1083336/119‑1 (MQ=255) tttGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGa > 6:1083336/1‑119 (MQ=255) ccgccCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAAt < 8:724896/125‑1 (MQ=255) ccgccCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAAt > 7:724896/1‑125 (MQ=255) ccgccCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAg > 2:355253/1‑274 (MQ=255) gccCCCTCATCCCCGAGCAACGCTACCTGGGGCAAATCCGAATGGACGCCAAATGTCGTTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGTGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTAc < 4:10947/275‑1 (MQ=255) gccCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTga < 8:801477/148‑1 (MQ=255) ccccTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTgaga < 5:260574/148‑1 (MQ=255) cccTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCt > 4:333154/1‑274 (MQ=255) tcatcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCtt < 5:1041364/100‑1 (MQ=255) atcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTcc > 8:1036418/1‑100 (MQ=255) atcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTcc < 7:1036418/100‑1 (MQ=255) atcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACt > 6:613988/1‑148 (MQ=255) tcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTc < 5:383131/123‑1 (MQ=255) tcaCCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTc > 6:383131/1‑123 (MQ=255) taaCCGAGCAACGTTAACTCTGGCAACGCCGAATGGACTCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCAt < 4:20082/272‑1 (MQ=255) aGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAACTTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGCACGGTGAACTTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGCGATCCACTTTGCAATCCAGCGTATCGG‑CCGATGGCGCGATCGTCGCCGCCTTGGCTACCCCCATTGGCGCAGAGGAACTGCCGCTGGAAAGCCAGGTAGGTGTCTGGGGTCAACCTTTTTCCAGTAACTGCCCATCGCCAc > 4:21696/1‑274 (MQ=255) cAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTAt > 8:702031/1‑110 (MQ=255) cAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTAt < 7:702031/110‑1 (MQ=255) cAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATcc < 5:613988/148‑1 (MQ=255) cGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGa > 1:3005/1‑275 (MQ=255) cGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGACTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAACGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTTCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCAACCCTCCCACTg > 4:283259/1‑274 (MQ=255) gCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGa < 7:290607/148‑1 (MQ=255) aCGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACa > 7:715513/1‑51 (MQ=255) cGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACgcagca < 2:248219/275‑1 (MQ=255) gAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCAc < 2:73674/275‑1 (MQ=255) aTGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCg < 2:470909/275‑1 (MQ=255) cGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCGGAAt > 2:317387/1‑274 (MQ=255) cTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTga < 8:710612/100‑1 (MQ=255) cTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTga > 7:710612/1‑100 (MQ=255) cTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGAt < 7:1112427/140‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGt < 7:436401/135‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGt > 8:436401/1‑135 (MQ=255) ctTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGa < 8:330383/55‑1 (MQ=255) tcgtcgTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGTCGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTAGTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCGGAATAAACGGACGCTCGt < 1:67115/274‑1 (MQ=255) tcgtcgTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACg < 8:235077/56‑1 (MQ=255) tcgtcgTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACg > 7:235077/1‑56 (MQ=255) tcgtcgTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTAccc > 8:149344/1‑148 (MQ=255) tcgtTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCtt < 7:538550/43‑1 (MQ=255) tcgtTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCtt > 8:538550/1‑43 (MQ=255) tcgtTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATg > 6:512682/1‑89 (MQ=255) tAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACtt > 8:238343/1‑90 (MQ=255) tAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACtt < 7:238343/90‑1 (MQ=255) tAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTgg > 7:289284/1‑148 (MQ=255) gaaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCg > 8:1040591/2‑104 (MQ=255) gaaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCg < 7:1040591/103‑1 (MQ=255) gaaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGa > 7:473340/2‑148 (MQ=255) aaaTCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGa < 8:289284/148‑1 (MQ=255) aagcGCTTGTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGAAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCGGAATAAACGGACGCTCGTGCGGCGGGATCa < 2:176817/272‑1 (MQ=255) aaTCGCGTTTAACAGCGGTTCAGGGACGGGCGCTTCCAGGGAACGGGGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGGGATGCACTTTGCCAACCAGCGTATCGG‑CAGGTGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCGGAATAAACGGACGCGCGTGCGGCGGGATCa < 4:288686/275‑1 (MQ=255) cGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCg > 8:29422/1‑148 (MQ=255) cGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACAtt < 8:405539/139‑1 (MQ=255) cGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACAtt > 7:405539/1‑139 (MQ=255) cGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCg > 8:422702/1‑148 (MQ=255) ttttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGaa > 8:735992/1‑148 (MQ=255) tttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGc < 6:938116/75‑1 (MQ=255) tttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGc > 5:938116/1‑75 (MQ=255) tttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCAt > 5:205769/1‑85 (MQ=255) tttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCAt < 6:205769/85‑1 (MQ=255) tttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCgg < 7:915149/97‑1 (MQ=255) | CGTCCGGGTTTTGCTGGGCGAAAATCACCTGTTGGGGATTCACCTGATTCAGCCTTGCCACCGCCTCGCTGGCTTCGCGAGTCTGTCGCGCCGGATAACGGGAAGGCCGGGTATCATTGCCTTCTTCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGG‑CAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACTGACGCTGGAAAGCCAGTGCGGTGCCTGGCGTGCAACTTTTTCCAGTACCTGCTCATCGCTACCACTGAATCCCAACTGACGCAGCACCGGAATAAACGGACGCTCGTGCGGCGGGATCA > NC_000913/1827539‑1828078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |