| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,208,201 | G→A | 5.9% | V60M (GTG→ATG) | ttdT → | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,208,201 | 0 | G | A | 5.9% | 372.7 / 10.8 | 121 | V60M (GTG→ATG) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/60); new base A (2/5); total (53/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.11e-02 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GAAGAGATCTGCGAGCACGTCCATTACATCAAATAACCCTCCCGGAGAGGCTCACCCCTCTCCTTTTTCGCAGGCATAACACGATGAAACCTTCCACTGAATGGTGGCGATATCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGG‑CGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTCGCCGCCTTTATGTTTGGCACAGGCTATGAAAAAACCGGGCTTGGACGCCGCATTGCGCTGATTCTGGTGAAAAAGATGGGACATCGCACGCTGTTT > NC_000913/3207941‑3208440 | gAAGAGATCTGCGAGCACGTCCATTACATCAAATAACCCTCCCGGAGAGGCTCACCCCTCTCCTTTTTCGCAGGCATAACACGATGAAACCTTCCACTGAATGGTGGCGATATCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGG‑CGATGGTGGGTATATCcatc < 2:630882/275‑1 (MQ=255) gaaaTCACCCCACCCGGGAGCCTCACCCCTCCCGTTTTACGCAGGACTAGACCGGTGAAACTCTCCACTGCGTGGTGTCGATATTTTGCGCCACCGGGGGCCATCGCCATTATTGCTCTCCGTCCGGTTCCCGCAAGGCTGGAGAACCCTTCCTGGCGCTACTGTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCGCGAATACGTGCCGGGTGCCGTGGTGG‑CGATGGTGGGTAAATACATCATCGCTATATTCTCTCCCTGGCTGCTGtg < 4:235138/274‑2 (MQ=255) aaTAACCCTCCCGGAGAGGCTCACCCCTCTCCTTTTTCGCAGGCATAACACGATGAAACCTTCCACTGAATGGTGGCGATATCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGG‑CGATGGTGGGTATATCCCTCATCGCCATCCTCCCTCCCTGGCTGCTGTTc > 2:338615/1‑274 (MQ=255) aTAACCCTCCCGGAGAGGCTCACCCCTCTCCTTTTTCGCAGGCATAACACGATGAAACCTTCCACTGAATGGTGGCGATATCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGTCTGGAGAACCATACCTGGCTCTCCTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTTATCCTCGAACCCCTTCCGGGTTCCGTGGTGGCCGGTGG‑GGGTATATCCATCATCGCCATATTCTCTccccctgacccttctc > 4:684624/1‑261 (MQ=255) 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GAAGAGATCTGCGAGCACGTCCATTACATCAAATAACCCTCCCGGAGAGGCTCACCCCTCTCCTTTTTCGCAGGCATAACACGATGAAACCTTCCACTGAATGGTGGCGATATCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGG‑CGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTCGCCGCCTTTATGTTTGGCACAGGCTATGAAAAAACCGGGCTTGGACGCCGCATTGCGCTGATTCTGGTGAAAAAGATGGGACATCGCACGCTGTTT > NC_000913/3207941‑3208440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |