| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,313,209 | T→C | 5.4% | intergenic (‑31/+133) | rbfA ← / ← infB | 30s ribosome binding factor/translation initiation factor IF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,313,209 | 0 | T | C | 5.4% | 491.5 / 12.2 | 149 | intergenic (‑31/+133) | rbfA/infB | 30s ribosome binding factor/translation initiation factor IF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/72); new base C (5/3); total (74/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GCTGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAACGTCATCTTTGAAGCGGCGCA > NC_000913/3312936‑3313481 | tGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGc > 2:183549/1‑275 (MQ=255) ttGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCa > 2:674732/1‑274 (MQ=255) gCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTa > 2:442887/1‑244 (MQ=255) tGATGCCCGCTTGAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAggg < 2:162452/273‑1 (MQ=255) aTGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGt < 4:472611/275‑1 (MQ=255) cTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGtt < 2:518510/275‑1 (MQ=255) aCTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAaat > 4:515200/1‑202 (MQ=255) tttGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCgg > 4:147862/1‑274 (MQ=255) ttGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCAATAATAAATTCCCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACTTGATATGACGCGCCAGCG‑TCCCATCAGGCAATCAATGCCGGa > 2:175443/1‑274 (MQ=255) tGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGCTGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCACTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGTGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCCGGTGGAAGGCCTGTTCACGTTGACCTTATAAACCGCACCAGCGCTCA‑ATCGCGCAATCCATGCCGGATg > 4:381583/1‑275 (MQ=255) tGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAaattaat < 2:515202/202‑1 (MQ=255) tACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTgg < 4:401904/206‑1 (MQ=255) ggTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTaaa > 2:406359/1‑272 (MQ=255) 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(MQ=255) tcatcaTGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTa > 8:295722/1‑149 (MQ=255) tcatGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTaaaa > 8:504994/1‑149 (MQ=255) tcatGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTaaa < 6:757874/148‑1 (MQ=255) ggCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGtt < 2:659525/274‑1 (MQ=255) gCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAACATTAATTTCAg < 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tttAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAATGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAggt > 7:79976/1‑148 (MQ=255) tttAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTAACAGCCCCtttttt > 7:815762/1‑126 (MQ=255) ttAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGTTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAggg > 5:629001/1‑148 (MQ=255) ttAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAggg > 6:626398/1‑148 (MQ=255) ttAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTAACAGCCCCttt > 6:699478/1‑123 (MQ=255) ttAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTAACAGCCCCttt < 5:699478/123‑1 (MQ=255) tttCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAg > 7:110930/1‑142 (MQ=255) tttCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAg < 8:110930/142‑1 (MQ=255) tttCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGt < 6:21386/148‑1 (MQ=255) tcccGCTGCAGGGTGAATGCGATCTCTTTTTTCATTTCCTGCGCTACGCGCTGACGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGa < 4:143512/272‑1 (MQ=255) 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cgcTTCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAAGTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGc < 2:277557/275‑1 (MQ=255) cTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAgg < 2:786654/135‑1 (MQ=255) tgacgggggccgaaTTCTTTCGCCATAATAAGTTCTCCTGACAAAAAAGGGGCAGTTGGCACCTTGTTAAAATTCATTTCAGTGGGTAGGGCTGGTCACGTTGGACTGATACGACCCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGGCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGTATCTCGGTGATTTCGAATACTTCGATAACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTTGTTCTTAACGCCGa < 4:68946/263‑1 (MQ=255) tGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCa > 1:53846/1‑136 (MQ=255) gggCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGc < 6:371885/148‑1 (MQ=255) ggCGACNNAATTCTTTCGCCATAATAAATTCNCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATcc < 3:53845/136‑1 (MQ=255) gCGACCAAATTGTTTCGCCAGAAAAAATTCTCCCGGCAAAAAAGGGGCGGTTAGCCCCTTTTTAAAAGTAACTTCAGGTGGAAGGGCCGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCTCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACca < 4:527938/275‑1 (MQ=255) gCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGc < 7:223771/149‑1 (MQ=255) 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ttCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATATGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTa > 5:655456/1‑148 (MQ=255) tCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGa > 4:431608/1‑85 (MQ=255) tCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGc > 1:102924/1‑135 (MQ=255) ccATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATccc > 5:462937/1‑148 (MQ=255) ccATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATccc > 5:665795/1‑148 (MQ=255) cATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTaa < 3:102923/135‑1 (MQ=255) cATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTaa > 6:560583/1‑135 (MQ=255) aataaATTCGCCTGACAAAAAAGGGGATGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGTTTGAAGAGCTGTTCACGTTGACCTGCTAAGACGCGTCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGAATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGCTCTCGATGANTGCGACTACTNCGCTNACATCCCNAgan > 4:767175/1‑219 (MQ=255) aaTTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa < 2:767177/221‑1 (MQ=255) ttCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGAATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc < 7:673405/149‑1 (MQ=255) tctcCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa > 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5:263376/1‑148 (MQ=255) ttAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAACGTCATCTTTGAAGCGGCGCa > 2:478833/1‑274 (MQ=255) tAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGGAGTTCTTAACGACGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAAAGTCATTTTTTAAGCGGCGCa > 2:414115/1‑273 (MQ=255) | GCTGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAACGTCATCTTTGAAGCGGCGCA > NC_000913/3312936‑3313481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |