| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,376,291 | 0 | T | C | 5.1% | 614.1 / 13.3 | 183 | intergenic (+26/‑26) | efp/ecnA | polyproline‑specific translation elongation factor EF‑P/entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (83/89); new base C (2/8); total (86/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGC‑GGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCTGCCAGCTAATTTTTCTTCTCTTCCGAAAAATCATCAGATTCCCATCATTTTTGGCGATGTTGTCTATTATTAATTTGCTATAGGCAAACATAAATAACATTACCTAAAAGGAAGACG > NC_000913/4376025‑4376550 | agTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGCCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGC‑GGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGTTGCACCATCACTTATTc > 2:75639/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |