| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,285,190 | T→A | 10.8% | L18I (TTA→ATA) | narJ → | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,285,190 | 0 | T | A | 10.8% | 293.0 / 23.8 | 93 | L18I (TTA→ATA) | narJ | molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone delta subunit of nitrate reductase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/50); new base A (6/4); total (39/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
GGTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCGA > NC_000913/1285044‑1285338 | ggTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCtt < 2:30976/148‑1 (MQ=255) tGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt < 1:427665/148‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATgg < 2:391951/148‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAgg < 2:4263/148‑1 (MQ=255) ggCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgca > 2:166842/1‑148 (MQ=255) ggCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGgca > 2:278015/1‑148 (MQ=255) tGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCAt < 3:614946/149‑1 (MQ=255) gCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGGCAGCATc < 3:195070/149‑1 (MQ=255) ccACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcc < 4:183793/149‑2 (MQ=255) ccACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATc > 2:24754/1‑148 (MQ=255) aCGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATcaac > 4:653421/1‑149 (MQ=255) ttCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAag < 1:671010/148‑1 (MQ=255) tCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAaga > 1:616544/1‑148 (MQ=255) cAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAgaga < 4:225757/149‑1 (MQ=255) aGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAgaga < 1:261934/148‑1 (MQ=255) gATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCACAACGGAGCCGCATACATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg < 3:142045/149‑1 (MQ=255) aTACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCCTCAACAAGAGATg < 1:684960/148‑1 (MQ=255) aTACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATg > 1:514051/1‑148 (MQ=255) tACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGtt < 3:144754/149‑1 (MQ=255) aCCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGtt < 2:501153/148‑1 (MQ=255) aCCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCATAAGgc < 2:799927/129‑1 (MQ=255) ccAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCGTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt > 3:309400/1‑125 (MQ=255) ccAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCGTGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt < 4:309400/125‑1 (MQ=255) cAAATTCAATCTGTTGAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGCATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTg < 1:900567/148‑1 (MQ=255) cAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGttt > 3:544000/1‑147 (MQ=255) cAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGttt < 4:544000/147‑1 (MQ=255) aaaTTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATca > 2:719482/1‑133 (MQ=255) aaaTTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATca < 1:719482/133‑1 (MQ=255) aTTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt < 3:127917/121‑1 (MQ=255) aTTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTAt > 4:127917/1‑121 (MQ=255) ttCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCg > 4:135765/1‑149 (MQ=255) ttCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCg > 3:581865/1‑149 (MQ=255) gTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcgc < 3:394308/149‑1 (MQ=255) tCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTg > 2:907055/1‑134 (MQ=255) tCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTg < 1:907055/134‑1 (MQ=255) tCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCcgcg > 2:362417/1‑148 (MQ=255) aCAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCg < 1:572195/148‑1 (MQ=255) aGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAGCGGAGCTGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGCCTCCTTGAATATCCGGATGCAGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaa < 1:892972/148‑1 (MQ=255) cgtcgtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaaaaa < 1:24754/148‑1 (MQ=255) cgtATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCt > 2:368536/1‑148 (MQ=255) tCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTaag < 4:619962/96‑3 (MQ=255) tCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATg > 3:619962/1‑96 (MQ=255) gATGCCATCGATGTGACCAGCAAAATCGAGCCGCATACATGATCGAACTCGTGATTGTAGCGCCTCTCCCTGAATATCCGCATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGCCGATGGCTGCGTCGAAAAATCTGCCaaaa < 4:759416/149‑1 (MQ=255) gATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCaaa < 1:362417/148‑1 (MQ=255) gATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCaaa < 2:913102/148‑1 (MQ=255) aTGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaaaa < 2:725375/137‑1 (MQ=255) aTGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGaaaa > 1:725375/1‑137 (MQ=255) aTGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCaaca > 2:262711/1‑146 (MQ=255) tGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAag < 2:860523/148‑1 (MQ=255) tGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAag > 2:314788/1‑148 (MQ=255) gCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAagag < 4:170446/149‑1 (MQ=255) cATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAag > 1:674887/1‑103 (MQ=255) cATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAag < 2:674887/103‑1 (MQ=255) tCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGAt > 1:97250/1‑148 (MQ=255) cGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGc < 3:809665/149‑1 (MQ=255) gATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGc < 2:437649/148‑1 (MQ=255) gACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATg < 2:514051/148‑1 (MQ=255) ccAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATgcgc > 3:493058/1‑149 (MQ=255) gCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg < 2:598016/148‑1 (MQ=255) gCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑Tg < 2:616544/148‑1 (MQ=255) aaCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCa > 1:768834/1‑148 (MQ=255) aCGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCA‑GCGCATGGGCAtc < 4:520650/149‑2 (MQ=255) cGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCAtt < 1:262711/148‑1 (MQ=255) gCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCt < 3:135765/149‑1 (MQ=255) tCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGcgcg < 2:748590/148‑1 (MQ=255) cATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGAt < 2:363088/148‑1 (MQ=255) gATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTaa < 3:653421/149‑1 (MQ=255) aCTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAacgacg < 2:754665/148‑1 (MQ=255) cTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAAcgacga < 2:166766/148‑1 (MQ=255) gTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGa > 4:511331/1‑149 (MQ=255) gATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑t > 3:667175/1‑114 (MQ=255) gATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑t < 4:667175/114‑1 (MQ=255) tATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTc > 4:424598/1‑149 (MQ=255) cgcgTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGa < 1:314788/148‑1 (MQ=255) tctcCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGa < 3:509006/90‑1 (MQ=255) tctcCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGa > 4:509006/1‑90 (MQ=255) cTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAgg < 1:913180/148‑1 (MQ=255) tGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGgcg > 2:502050/1‑148 (MQ=255) gAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGgcgc < 1:166842/148‑1 (MQ=255) atCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTAc > 4:471203/1‑149 (MQ=255) tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTAc < 2:768834/148‑1 (MQ=255) tCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACa < 3:471203/149‑1 (MQ=255) cGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAg < 1:103860/148‑1 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGa > 3:213541/1‑149 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGa > 4:181208/1‑149 (MQ=255) gATGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGa > 4:479230/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGa > 2:758793/1‑148 (MQ=255) aTGCTGCCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGa > 2:426570/1‑148 (MQ=255) tgctgcCATAAGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAAc > 4:629587/1‑149 (MQ=255) gctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACt < 3:424598/149‑1 (MQ=255) gctgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACt > 4:406190/1‑149 (MQ=255) tgcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGt > 4:708036/1‑149 (MQ=255) gcCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGt > 2:226382/1‑148 (MQ=255) cTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTc > 2:318695/1‑148 (MQ=255) ttATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCGa > 4:488646/1‑149 (MQ=255) ttATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCACATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCGa < 3:511331/149‑1 (MQ=255) | GGTGATGGCTGCCACGGTTCAGATACCAAATTCAATCTGTTCAACAGCCGTCGTATCGATGCCATCGATGTGACCAGCAAAACGGAGCCGCATCCATGATCGAACTCGTGATTGTATCGCGTCTCCTTGAATATCCGGATGCTGCCTTATGGCAGCATCAACAAGAGATGTTTGAGGCGATTGCCGCGTCGAAAAATCTGCCAAAAGAGGATGCCCATGCGC‑TGGGCATTTTCCTGCGCGATTTAACGACGATGGATCCGCTCGATGCCCAGGCGCAGTACAGCGAACTGTTCGA > NC_000913/1285044‑1285338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |