| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3246148 | 134 (0.830) | 17 (0.100) +GTGCA |
3/486 | 15.3 | 11.1% | coding (925/1299 nt) | exuT | hexuronate transporter |
| ? | NC_000913 | 3246149 = | 140 (0.840) | coding (926/1299 nt) | exuT | hexuronate transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
AATGTCCGTTGGTCAGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCGGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACGCTCTCTTCCGATGTGTTTGGTCGTAACGAAGTGGCAACGGCAAACGGTTTAACCGGGATGTCCGCATGGCTGGCAAGTACGCTGTTTGCGCTGGTTGTCGGTGCACTGGCTGACACCATCGGCTTCAGCCCGCTGTTCGCAGTTCTGGCAGTGTTCGA > NC_000913/3245874‑3246425 | aaTGTCCGTTGGTCCGATCCTGCGTAACCGTCCGGTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTGTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTg < 4:115285/278‑1 (MQ=255)aaTGTCCGTTGGTCAGTGCCTGCGTACCCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGTGGTACTTTTTACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTg < 2:496903/278‑1 (MQ=255)aaTGTCCGTTGGGCCGATCCTGCGTAACCGGCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTg < 2:108979/278‑1 (MQ=255) aTGTCCGTTTGTCAGACCCTGGGTAACCGTCGATTCGGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGCTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTg < 2:151045/277‑1 (MQ=255) ttCCGTTGGTCGGTTCCTGCGGACCCGTCAGTTCTGTGGTGTCGCGTGGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGTGGTACTTTTACCGCATGGATCCCGCTGTTCATGTGTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATTGCGATGTTCGCCGGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCa < 4:667424/276‑1 (MQ=255) gTCCGTTGGTCAGATCCGGCGTCACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCTCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTAAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCAGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTg < 1:629030/275‑1 (MQ=255) ttGGTCGGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTTCCGCTGCTGTTTCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCGGG‑‑‑‑‑GTGCAGTg > 1:499153/1‑275 (MQ=255) ggTCAGAGCCAGCGTAAACGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCTCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGATTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGCTGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑t < 1:131867/275‑1 (MQ=255) aGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGAGATGTTCGCCTGGATGCCGCTGCTGTTTTCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCAGCGTCTGTTCCAGCGTTGGTGTGGTGTGACTCTTCTCGTTCCCTGTAAGGTGGTCGTAACGATGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGAtt > 4:180587/1‑278 (MQ=255) aTCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑Tgatgat < 1:211718/275‑1 (MQ=255) tGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGc < 1:397767/275‑1 (MQ=255) gCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGTTCGTAACGGTGG‑‑‑‑‑GTGGCGTGC‑‑‑GTATGATTGGcc > 3:692321/1‑275 (MQ=255) ctgaaCCGTGCGTTCTGGGGTATGCGGCTGCCGTGTTTCCTGGCGGATCCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTCAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGGTATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCggg < 4:269474/275‑1 (MQ=255) cagtgttGGGGTATCTCGCTGGCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGGAGTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCATGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGa < 1:526525/268‑1 (MQ=255) gTTCTGGGGTATCGTGCTGCGGCGGTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCGCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑Cg < 3:270861/275‑1 (MQ=255) gTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGTGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCGTTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGc < 2:412299/277‑1 (MQ=255) ttCGGGGGTATCGCTGCGCCGCCGTTCGTGGGAGAACCGGGCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCt < 2:475070/278‑1 (MQ=255) tgttGGGGTATCGCGCTTCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCt < 2:207003/275‑1 (MQ=255) tCTGGGGTATCGGGCGGCCGCGGTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGCGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGc < 3:208148/275‑1 (MQ=255) tCTGGGGTATCGCGCGGCCGCGTTTCCTTGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTGTAACGCGTGGGTCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAAATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGc < 1:777194/275‑1 (MQ=255) tCTGGGGTATCGCGCGGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGc < 1:324408/275‑1 (MQ=255) gggTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGt > 3:66523/1‑275 (MQ=255) 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ttCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGc < 1:739083/275‑1 (MQ=255) cAGAACCGTCCTCGTGTACTTTTAACGCGTGGATCTCGATGTTCAGGTTTAACGTGTGCGGTTTTAACCTTAGAGGTATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCTGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTAtgctg < 4:288733/278‑1 (MQ=255) cAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTAtg < 3:5125/275‑1 (MQ=255) 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gg‑‑‑‑‑gTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCGGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACGCTCTCTTCCGATgtgt > 3:379142/1‑137 (MQ=255) gg‑‑‑‑‑gTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCGGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACGCTCTCTTCCGATGTGTTTGGTCGTAACGAAGTGGCAACGGCAAACGGTTTAACCGGGATGTCCGCATGGCTGGCAAGTACGCTGTTTGCGCTGGTTGTCGGTGCACTGGCTGACACCATCGGCTTCAGCCCGCTGTTCGCAGTTCTGGCAGTGTTCg > 2:178982/1‑278 (MQ=255) g‑‑‑‑‑gTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCTGGTCTGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCTGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACGCTCTCTTCCGATGTGTTTGGTCGTAACGAAGTGGCAACGGCAAACGGTTTAACCGGGATGTCCGCATGGCTGGCAAGTACGCTGTTTGCGCTGGTTGTCGGTGCACTGGCTGACACCATCGGCTTCAGCCCGCTGTTCGCAGTTCTGGCAGTGTTCGa < 2:675608/278‑1 (MQ=255) | AATGTCCGTTGGTCAGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGG‑‑‑‑‑GTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGAT‑CGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCGGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACGCTCTCTTCCGATGTGTTTGGTCGTAACGAAGTGGCAACGGCAAACGGTTTAACCGGGATGTCCGCATGGCTGGCAAGTACGCTGTTTGCGCTGGTTGTCGGTGCACTGGCTGACACCATCGGCTTCAGCCCGCTGTTCGCAGTTCTGGCAGTGTTCGA > NC_000913/3245874‑3246425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |