| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3787895 = | 487 (2.920) | 4 (0.020) | 4/494 | 14.7 | 0.86% | coding (1058/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor |
| ? | NC_000913 | = 3787891 | 458 (2.860) | coding (1054/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 494 total aligned reads displayed.
GGCGGTTCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTT‑CACTCTATTTCGAAATTCGCCGCCAGGGTCAGGCGGTCAATCCACAGCCGTGGTTGGGAAGATAAGTTTTGTTTCCATTTCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTT > NC_000913/3787614‑3788166 | ggTGCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCCCCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTc < 1:818581/275‑1 (MQ=255) agTTCGCGACCGACAGAGAGGAGGGCAGCGCAAAGGCACCCGCCACAAACCGGCCGAAGGGGAAAAAGCGGTGAGGTGCCGTCCCGGGGGTCTGGGCGCGCCGGGGG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGAGGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtg < 4:496026/276‑1 (MQ=255) ttCGCGACCGCCAGAAAGAGGCGACGCGCGAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggt < 2:685301/277‑1 (MQ=255) ttCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCCGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTCCAGGGTGACTTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTACAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTTGCTGCAAGGCTACGGtgtg > 1:766652/1‑275 (MQ=255) tCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGGTTCTGGCTGGCTGGCGGCGAGGCTACGGGCtgggtg > 4:127403/1‑275 (MQ=255) tCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCCGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCCAAGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCGGCATGGCTACGGTCtggtg > 2:535788/1‑277 (MQ=255) gcgAACGCCAGAAAGGAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGAACGAAAGGGAAAAATCGCTGATGCCCCGTGCCGGTGGTCGGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTATGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggt < 4:248805/277‑1 (MQ=255) aCCGCCAGAAAGAAGCGCCGCGCAAAGGCCCCACCTACAAACGAACCGGAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGGGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGGATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggt < 3:710751/274‑1 (MQ=255) aCCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggtg < 1:612419/275‑1 (MQ=255) aCCGCAAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACACCCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGGCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggtg < 3:238034/275‑1 (MQ=255) aaaacacggagcgcAAAGGCACCACCGACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCCGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 1:150006/265‑1 (MQ=255) agaagCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGGCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGc < 1:793088/275‑1 (MQ=255) gACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGGCCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTa < 3:156305/275‑1 (MQ=255) gACCCGCAAAGGCCCCACCCTCAAACCGACCAAAAGCGAAAAGTCGCTTGTGTCCCGTACCGGTGGCCGTGGCGCGCCGCGGG‑GTCAGGCCTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTa < 3:766652/275‑1 (MQ=255) aaggaaaGGCACCAACTACAGACCGACCGAAGGCGAACAATCGCTGATTTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGGGAGCCGAGGCTGCATCGCTATGGCGAAGAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAATGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGGGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTaaa < 1:801854/270‑1 (MQ=255) ggCACAACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAAGCGCTGAGGTCCCGTACCGGGGGTCTGGGGGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATg < 2:549912/276‑1 (MQ=255) accTCCAAACCGACGGAAAGCGAAAAAGCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCGGGGCGCGCCGCGGG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCttt < 2:101451/277‑1 (MQ=255) accTACAACCCGGCCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTGTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAGAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:95009/278‑1 (MQ=255) accTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCGGGGCGCCCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTTGCGTGCCGACGCTGCATCTCTATCGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:235279/278‑1 (MQ=255) ccTCCAAACCGCCCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GGCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTAGTGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACTGTCGGGTGATTCTGGCTGACTTGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:273629/277‑1 (MQ=255) cTACAAGCCGACCGAAAGCGAAAGATCGCTGAGGTCCCGTACCGGGGGTCTGGGCGCGGCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCGGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACg < 2:490122/278‑1 (MQ=255) taccacccgcccgaAGGCGAAAAAGCGCGGATGTCCCTTACCGGAGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCAGTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 1:582500/269‑1 (MQ=255) tACAGACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGTCGACGCTGCATCGCTAGGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 1:515756/275‑1 (MQ=255) tACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGGCCGGTACCGGGGGGCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGAGGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 3:323809/275‑1 (MQ=255) aaaCCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCta > 2:319344/1‑278 (MQ=255) acccgaccaaAAGGGAAAAAGGGCTGCTGGCCCGTACCGGTGGTCTGGGGGGGCCGGGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGc < 3:661453/273‑1 (MQ=255) accgaAAGGGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGGTGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCATGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGCCGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCa < 2:392678/278‑1 (MQ=255) accgaAAGCGAAAACTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGAGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCa < 2:504248/278‑1 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATTGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGGGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATaa > 1:300823/1‑275 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGTTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCGAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACTTGAGTCTTTACGGCTATaa > 1:721501/1‑275 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGACGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGACTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTACAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATaa > 1:907974/1‑275 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCGTGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCa > 2:126222/1‑278 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGCCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGGGTCTTTACGGCTATAATCa > 2:290276/1‑278 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGCACTGACGTTAAAGTGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGATTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGGGGTGTTTGAGGATTGTAAAGGCGGCATGAGTCTCGCCGGCtacta > 3:897051/1‑272 (MQ=255) aacggAAAATCCGCTGATGTGCCGTGCCGGGGGGACGGGGGGGCCG‑GTGTGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGAGGCTGGATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACGGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCagg < 3:638055/271‑2 (MQ=255) aaGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGtt < 3:591604/232‑1 (MQ=255) cGAAAAATCGCTGATGTCCCGGACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAgcg < 1:543335/275‑1 (MQ=255) aaaTCGCTGATGTCCCGTACCGGGGGGCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGGTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGt < 2:215475/278‑1 (MQ=255) tCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTG‑GTCAGGCTTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGt < 1:745184/275‑1 (MQ=255) gggtGTCCCGTACCGGGGGTCTGGGGGGGCCGCGTG‑GTCAGGAATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAg < 1:325737/271‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |