| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,952,587 | T→A | 5.0% | W108R (TGG→AGG) | yecN → | MAPEG family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,952,587 | 0 | T | A | 5.0% | 625.1 / 13.7 | 176 | W108R (TGG→AGG) | yecN | MAPEG family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/85); new base A (4/5); total (86/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
CGCGTTGCCTATGGCGACGGCGGTTTTAGCGAACTGCAAAGCGCTATTCGCATTCATGGTAACGCGGTGGAATATATTCCCATCGCGATTGTGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTATCGCCAGACTGGGCGACTGGACCTTTGATGAACGGGTAGCTGAAGTCTTCCCGGATATGATCCAGCGTTCCGTACCCGGCTATTCCAAT > NC_000913/1952350‑1952824 | cgcgTTGGCTATGGGGAATGCGGGTTTTGCGCACTGGAATGCGGTATTCGCATGCATTGTAACGCGGTGGAATATATTCCCATCGCGATTGTGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGCGGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCGGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGGGCTGGCGAATCttt < 4:177635/274‑1 (MQ=255) ttCGCATTCATGGTAACGCGGTGGAATATATTCCCATCGCGATTGTGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTTGCGACGTTCCGGCCTGAGCGC‑CACCTGGTCTGCGCTGTTGCTGATGGTTCTGGCGAATCTTTGGTTTATGCCCTGGGCGTTGGTTTTTTCCCTGCGTTAgccccccatc > 4:172084/1‑267 (MQ=255) tGGAATATATTCCCATCGCGATTGTGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCATGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa > 2:235216/1‑275 (MQ=255) atTCCCATCGCGATTGTGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCCTATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGGGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCCAAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGCttttttc > 4:294605/1‑272 (MQ=255) 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aTGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTgc < 5:1437680/149‑1 (MQ=255) gCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc < 8:1226513/149‑5 (MQ=255) cTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCt > 8:506800/1‑149 (MQ=255) tGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTg < 6:491690/149‑1 (MQ=255) tttATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGtt > 7:1120512/1‑149 (MQ=255) 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aaaTGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATg < 6:213514/149‑1 (MQ=255) tgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTgg < 7:1389244/149‑1 (MQ=255) gcAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGaa > 8:479099/1‑149 (MQ=255) aGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATc > 6:239264/1‑149 (MQ=255) aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 6:1296146/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 5:5902/149‑1 (MQ=255) aCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg < 6:904773/149‑1 (MQ=255) aCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg > 7:571916/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg < 7:1152921/149‑1 (MQ=255) ggTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGc < 5:770895/149‑1 (MQ=255) 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tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc > 7:576979/1‑149 (MQ=255) tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc < 5:445956/149‑1 (MQ=255) tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc < 5:239264/149‑1 (MQ=255) tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTATCGCCAGACTGGGCGACTGGACATTTGATGCACGGGTAGCTGAAGTCTTACCGGGTATATTCCATCGTTCCGTACCCCGCTATTcacat > 1:36049/1‑271 (MQ=255) ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTa > 8:459823/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTAt < 8:1084142/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg < 8:571916/149‑1 (MQ=255) gACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGGGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg < 6:813979/141‑1 (MQ=255) gACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg > 5:813979/1‑141 (MQ=255) gTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTACGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGa > 5:1054667/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGac > 5:65091/1‑149 (MQ=255) cGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACg > 8:553775/1‑149 (MQ=255) ggCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGc > 6:365662/1‑149 (MQ=255) ggCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGc < 7:479099/149‑1 (MQ=255) gCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCACTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTTTGTCTCACCGCGACACGCt > 6:1127546/1‑149 (MQ=255) tGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTAtt > 8:1028214/1‑149 (MQ=255) agcgcacACCAGGTG‑GCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTAtttt > 8:1362062/7‑149 (MQ=255) cgc‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCt < 6:271019/149‑1 (MQ=255) cgc‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCt < 6:468246/149‑1 (MQ=255) gc‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTg < 8:1055447/149‑1 (MQ=255) cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGcc < 8:907166/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc < 5:760024/113‑1 (MQ=255) cTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc > 6:760024/1‑113 (MQ=255) cTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCt < 7:461760/149‑1 (MQ=255) tGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTa > 8:1107632/1‑149 (MQ=255) | CGCGTTGCCTATGGCGACGGCGGTTTTAGCGAACTGCAAAGCGCTATTCGCATTCATGGTAACGCGGTGGAATATATTCCCATCGCGATTGTGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTATCGCCAGACTGGGCGACTGGACCTTTGATGAACGGGTAGCTGAAGTCTTCCCGGATATGATCCAGCGTTCCGTACCCGGCTATTCCAAT > NC_000913/1952350‑1952824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |