| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,888,034 | A→T | 6.2% | intergenic (‑43/+27) | rnd ← / ← fadD | ribonuclease D/acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,888,034 | 0 | A | T | 6.2% | 452.2 / 16.1 | 128 | intergenic (‑43/+27) | rnd/fadD | ribonuclease D/acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/66); new base T (3/5); total (57/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATCC > NC_000913/1887887‑1888180 | gcgcGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑c < 2:546281/149‑1 (MQ=255)gcgcGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑c < 1:205035/149‑1 (MQ=255) aCGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGTTAAT‑CCGGCGt < 2:564433/149‑1 (MQ=255) aCGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGt > 2:711237/1‑149 (MQ=255) gAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACTGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCt > 4:857719/1‑149 (MQ=255) gAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGTTAAT‑CCGGCGttt < 3:95375/149‑3 (MQ=255) aaCAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGTTAAT‑CCGGCGttt < 4:1402324/148‑3 (MQ=255) aaCAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTg > 3:398395/1‑149 (MQ=255) aaCAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGG‑TTAATCCGGCGttt > 3:1402324/1‑146 (MQ=255) aCAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTga > 2:759437/1‑149 (MQ=255) aaaTTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTATTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTgacg > 1:1033294/1‑149 (MQ=255) aaaTTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAAAGCCGGGTTTA‑ACGGCGGCTtacg > 1:287612/1‑149 (MQ=255) aaTTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGTTAAT‑CCGGCGtttttttt < 1:127852/149‑8 (MQ=255) aTTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTgacgac > 3:368192/1‑149 (MQ=255) ttCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTg < 1:579509/143‑1 (MQ=255) ttCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACgact > 3:1036202/1‑149 (MQ=255) cAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACgactga < 4:329054/149‑1 (MQ=255) cAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACgactga < 3:1440246/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTaa > 3:1415562/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTaa > 4:1210383/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTaa < 1:1193348/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAAc < 3:136134/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACCACTGACTTAAc < 4:134849/149‑1 (MQ=255) cAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACg > 3:354940/1‑149 (MQ=255) aGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTCAAAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACg > 2:950455/1‑149 (MQ=255) aGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGTTAAT‑CCGGCGtt < 4:519810/131‑2 (MQ=255) aGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGTTAAT‑CCGGCGtt > 3:519810/1‑130 (MQ=255) aGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑cc < 1:1030519/125‑1 (MQ=255) aGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGc > 4:1189855/1‑149 (MQ=255) aGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGc > 2:1410321/1‑149 (MQ=255) gCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCa < 1:806711/149‑1 (MQ=255) gCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCa < 4:664885/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGc < 1:711237/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCt > 4:522195/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCt > 3:292561/1‑149 (MQ=255) ccGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTa < 4:211643/149‑1 (MQ=255) ggAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTAtt < 4:798150/149‑1 (MQ=255) ggAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTAtt < 3:1189855/149‑1 (MQ=255) aaagCACGGACCGGTTTACAAAAAGGAGCCAAGGCATCCGTCGGTGGTAAT‑ATTTGGTTATTCAAATTTTTTTCCTTTTTGGGGGGCTCA‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGt < 2:287612/146‑1 (MQ=255) aGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTcc < 3:1366205/149‑1 (MQ=255) cACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACt < 3:610035/149‑1 (MQ=255) gacggCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCACGCTTTATTGTCCACTTTGc < 3:857719/149‑1 (MQ=255) gCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCcgcg > 4:771640/1‑149 (MQ=255) cTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCcgcgc > 1:810444/1‑149 (MQ=255) cacaAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTc < 4:1368415/149‑1 (MQ=255) cacaAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTc < 4:379531/149‑1 (MQ=255) cacaAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTc < 2:397292/149‑1 (MQ=255) acaAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTga > 3:1158006/1‑100 (MQ=255) acaAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTAt > 4:1278528/1‑126 (MQ=255) acaAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTAt < 3:1278528/126‑1 (MQ=255) acaAAGAAGCCAGCGCAT‑CCTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTga < 4:1158006/100‑1 (MQ=255) caAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGt > 3:47032/1‑149 (MQ=255) aaaGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGTCTTTACTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTc > 1:297527/1‑149 (MQ=255) aaaGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTc < 3:247228/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTaa < 4:511442/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAAt > 3:1432586/1‑149 (MQ=255) aT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCtcgtc < 1:872478/149‑1 (MQ=255) aT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCtcgtc < 2:810444/149‑1 (MQ=255) t‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTCAAAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCtcgtc > 3:646947/1‑149 (MQ=255) gTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCa > 4:429798/1‑149 (MQ=255) tCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCaa > 1:874061/1‑149 (MQ=255) tAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAAttttt < 3:309640/149‑1 (MQ=255) tAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTGATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAAttttt < 3:771640/149‑1 (MQ=255) tAAGCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAAttttt > 1:1275043/1‑149 (MQ=255) aaTCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTc < 3:43792/149‑1 (MQ=255) aaTCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTc > 3:1022650/1‑149 (MQ=255) aTCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTcc < 3:314357/149‑1 (MQ=255) aTTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGAc > 4:400298/1‑149 (MQ=255) aTTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGAc > 4:467028/1‑149 (MQ=255) tttGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACg > 4:1100213/1‑149 (MQ=255) tttGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑‑AAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGt > 3:746997/1‑149 (MQ=255) ttGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGt < 2:1065847/149‑1 (MQ=255) ttGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGt < 2:1472823/149‑1 (MQ=255) tGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGtt < 4:109730/149‑1 (MQ=255) ggTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTa > 2:548673/1‑149 (MQ=255) tCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTc < 2:1450600/149‑1 (MQ=255) cAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCg < 1:1305428/149‑1 (MQ=255) aaaTTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCtcgt < 4:332557/120‑1 (MQ=255) aTTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCgg > 4:359809/1‑147 (MQ=255) aTTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTa < 3:650234/149‑1 (MQ=255) ttGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTaa < 4:1130143/149‑1 (MQ=255) tttt‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCg > 2:28454/1‑142 (MQ=255) tttt‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCg < 1:28454/142‑1 (MQ=255) t‑ctcTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACtcatc < 1:1223078/149‑1 (MQ=255) ctctTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACtcatca < 1:1051718/149‑1 (MQ=255) tctTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCAc < 3:1210383/149‑1 (MQ=255) tAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGaaa < 1:1253086/149‑1 (MQ=255) tAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGaaa < 2:1417940/149‑1 (MQ=255) ggCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTcca > 1:632518/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaCGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCtt > 1:1309730/1‑149 (MQ=255) tcagaCGCCGGTTAAT‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCg > 3:343193/5‑149 (MQ=255) aaaaCGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCgg > 3:337319/1‑149 (MQ=255) aCGCCGGTTAAT‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGTCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTAc > 3:1432330/1‑149 (MQ=255) gCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACtt < 1:1040465/149‑1 (MQ=255) ccGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACttt < 3:429798/149‑1 (MQ=255) ccGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACttt < 3:467028/149‑1 (MQ=255) ggATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGt > 3:1010610/1‑149 (MQ=255) gATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTa > 2:1471429/1‑149 (MQ=255) gATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTa > 2:1467188/1‑149 (MQ=255) aTTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGGAt < 2:458507/149‑1 (MQ=255) | GCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATCC > NC_000913/1887887‑1888180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |