| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,952,587 | T→A | 5.8% | W108R (TGG→AGG) | yecN → | MAPEG family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,952,587 | 0 | T | A | 5.8% | 538.6 / 14.3 | 152 | W108R (TGG→AGG) | yecN | MAPEG family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (67/76); new base A (4/5); total (71/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTA > NC_000913/1952441‑1952735 | tgCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTgg < 1:601928/149‑1 (MQ=255) cTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGgtg > 3:114503/1‑149 (MQ=255) tGATGCTGATTATGGAAATGAATGATGTAGAAGCGTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTAACTGGTTGACTGATGCATTATTCCGGTTTGCCTCACCGTCTGTTCCGCTTGCGGCGTTACGGCAGGAGCGC‑CTGCTGgtgt < 4:1382593/149‑1 (MQ=255) gATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGtgtg > 1:118029/1‑149 (MQ=255) aTGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTgc < 1:1437680/149‑1 (MQ=255) gCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc < 4:1226513/149‑5 (MQ=255) cTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCt > 4:506800/1‑149 (MQ=255) tttATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGtt < 1:885540/149‑1 (MQ=255) tATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGGTG‑GCGCtcatgc < 4:120805/149‑6 (MQ=255) tATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGGTG‑GCGCtcatgc < 4:233678/149‑6 (MQ=255) gAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc < 3:1443175/139‑5 (MQ=255) gAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc > 4:1443175/1‑135 (MQ=255) aaaTGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATg < 2:213514/149‑1 (MQ=255) aaaTGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTGTTGCTTGCTGGTCGTCTGAGGCATTATTACGGTTTTGATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGGTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGCGTGCGCTGTTGCTGATg > 4:473026/1‑149 (MQ=255) aatgaatgGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATgg < 2:887829/149‑1 (MQ=255) agaatgGCGCAGAAACCCGGATGGTACATATTGGCGGCATCGTGTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTg > 4:32755/2‑149 (MQ=255) ggCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGc < 1:342647/149‑1 (MQ=255) gcAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGaa > 4:479099/1‑149 (MQ=255) cAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAAt < 2:304019/149‑1 (MQ=255) aGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATc > 2:239264/1‑149 (MQ=255) gAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCt > 3:496971/1‑149 (MQ=255) aaaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCtt < 1:66753/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 1:5902/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 2:1296146/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCttt < 3:25195/149‑1 (MQ=255) aCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg > 3:1055447/1‑149 (MQ=255) aCCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg < 1:990165/149‑1 (MQ=255) ccTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTgg < 3:1152921/149‑1 (MQ=255) ggTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGc < 1:770895/149‑1 (MQ=255) tGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGccc < 4:1205590/149‑1 (MQ=255) gCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGa > 2:1415408/1‑119 (MQ=255) gCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCt > 3:1084142/1‑149 (MQ=255) cATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTg < 3:180819/149‑1 (MQ=255) atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTgg < 4:68257/149‑1 (MQ=255) atatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTgg > 1:279183/1‑149 (MQ=255) tatTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTggg > 2:1014971/1‑149 (MQ=255) atTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGa < 1:974722/149‑1 (MQ=255) atTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGa < 1:231440/149‑1 (MQ=255) tttGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAg > 1:895194/1‑149 (MQ=255) tttGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAg > 4:53608/1‑149 (MQ=255) tGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGtt > 2:124127/1‑149 (MQ=255) gCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTg < 1:1014971/149‑1 (MQ=255) gCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTCCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTg < 2:619559/149‑1 (MQ=255) ggCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGCACACCAGgtggcgc > 2:531125/1‑96 (MQ=255) ggCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt < 1:10324/149‑1 (MQ=255) gCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGtt < 1:1444747/149‑1 (MQ=255) gCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGtt > 1:374992/1‑149 (MQ=255) tCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTgc > 2:614935/1‑94 (MQ=255) cGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtct < 3:32755/149‑1 (MQ=255) gTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTtctc > 4:616641/1‑149 (MQ=255) ttttGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTcc < 3:224184/149‑1 (MQ=255) gcttgctGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGc < 3:566795/149‑1 (MQ=255) ttgctGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGt > 2:406727/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgc > 1:1258094/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgc > 1:334325/1‑149 (MQ=255) gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt < 2:468352/130‑1 (MQ=255) gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt > 1:468352/1‑130 (MQ=255) gtcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAgcgc > 1:395756/1‑149 (MQ=255) tcgtcTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGca < 2:334325/149‑1 (MQ=255) tGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCTTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGc < 3:66526/149‑1 (MQ=255) tGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCAGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGGCCTGGGAGCTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGc > 4:1191181/1‑149 (MQ=255) cATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCa < 1:29337/149‑1 (MQ=255) attattACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTg < 3:337115/97‑1 (MQ=255) ttattaCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCAct > 1:1372842/1‑149 (MQ=255) taCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttct > 3:125781/1‑149 (MQ=255) taCGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttct > 4:377089/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCActttcttt < 1:1062043/149‑1 (MQ=255) ggTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt > 2:494911/1‑110 (MQ=255) ggTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGt < 1:494911/110‑1 (MQ=255) ggTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCtttt < 3:1263452/149‑1 (MQ=255) gTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCttttt < 4:835751/149‑1 (MQ=255) ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc > 3:475868/1‑149 (MQ=255) ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc > 3:1385066/1‑149 (MQ=255) ttttCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTc > 2:336511/1‑149 (MQ=255) atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa < 2:395756/149‑1 (MQ=255) atcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGa < 2:485185/149‑1 (MQ=255) tcaCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGAt > 4:1338250/1‑149 (MQ=255) caCCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGAGGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGAtt > 4:1127728/1‑149 (MQ=255) tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc < 1:239264/149‑1 (MQ=255) tCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc > 3:576979/1‑149 (MQ=255) gTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGtt < 3:1338250/149‑1 (MQ=255) ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTGTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGACTTTTACGTTa > 3:576621/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTa < 1:435889/149‑1 (MQ=255) ttCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTa > 4:459823/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTAt < 4:1084142/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg < 4:571916/149‑1 (MQ=255) gACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGGGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATg < 2:813979/141‑1 (MQ=255) gTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGa < 2:279183/149‑1 (MQ=255) ttCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGac > 1:65091/1‑149 (MQ=255) ccGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGATTCTTTGGTATATTCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGTACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGacac > 4:1069364/1‑149 (MQ=255) ggCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGc > 2:365662/1‑149 (MQ=255) gCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCACTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTTTGTCTCACCGCGACACGCt > 2:1127546/1‑149 (MQ=255) tGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTAtt > 4:1028214/1‑149 (MQ=255) cagcgcacACCAGGTG‑GCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGTCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTAttt > 3:777538/8‑149 (MQ=255) cgc‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCt < 2:271019/149‑1 (MQ=255) c‑cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGc > 3:945018/1‑149 (MQ=255) c‑cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGc > 1:768771/1‑149 (MQ=255) cACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGcc < 4:907166/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTAc > 2:760024/1‑113 (MQ=255) tGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTa > 4:1107632/1‑149 (MQ=255) | TGCTGATGCTGTTTATGGAAATGAATGGCGCAGAAACCTGGATGGTGCATATTTGCGGCATCGTTTTGCTTGCTGGTCGTCTGATGCATTATTACGGTTTTCATCACCGTCTGTTCCGCTGGCGACGTTCCGGCATGAGCGC‑CACCTGGTGTGCGCTGTTGCTGATGGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCACAATACGCCACTTTCTTTTTCCCGGATTTTTACGTTATGTCTCACCGCGACACGCTATTTTCTGCCCCTA > NC_000913/1952441‑1952735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |