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tCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCtt < 4:759728/149‑1 (MQ=255) gttCCCGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc > 2:1518522/2‑149 (MQ=255) aTTCCCTCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCGTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCATTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc < 3:1123621/149‑1 (MQ=255) aTTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgc < 2:941375/149‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt < 2:1077345/134‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGt > 1:1077345/1‑134 (MQ=255) tCCCGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTgcgc > 4:370688/1‑149 (MQ=255) cccGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCt > 2:1152599/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AATATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCtt > 1:646737/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTGGGTCACAGCGGG‑AACATCGCTACCTTTGTATCACATAGCTTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGc < 2:1229763/110‑1 (MQ=255) cGCTGTGACCCCCAGCGGG‑AACCTCGTTACCTTTGTATCACCTAGATTTTTCCC‑GCCCCCACCCCTTTTCCTTTCAGTATGATCTCAAGAGGTTTCTATGTGTGGAAGGTTTGCCCAATCCCCAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTtc < 4:566822/149‑1 (MQ=255) gtgACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑ACCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTcgc < 2:1414759/149‑1 (MQ=255) ccACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCagga > 3:989255/1‑81 (MQ=255) ccACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAg > 3:555210/1‑149 (MQ=255) | TCCTGGAAGTGGTGAGCGACTGTCCGCAGTCGATCAATAATATTCCACTGGATGCGCGTAATCACGGCTATACGGTGCTGGATATTCAGCAAGACGGGCCGACCATTCGTTATTTAATTCAGAAGTAATCCCTCATTCCCGCTGTGACCCACAGCGGG‑AACATCGTTACCTTTGTATCACATAGATTTTACCC‑GCCCCCACTCCTATTCTTTTCAGTATGATCTCAGGAGGTTTCTATGTGTGGACGCTTTGCCCAATCCCAAACGCGTGAAGATTACCTTGCGCTTCTCGCGGAAG > NC_000913/2009585‑2009881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |