| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,020,841 | 0 | G | A | 9.3% | 404.0 / 25.5 | 140 | R252H (CGC→CAC) | fliM | flagellar motor switching and energizing component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (77/49); new base A (5/8); total (83/57) | |||||||||||
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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGAAGGCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAATGAGTGACATGAATAATCCGGCCGAT > NC_000913/2020572‑2021114 | tGAAGGCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTACGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTAGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTCACCCGCCGCTGGACAACTCGCGTAATGAATATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAg > 2:407995/1‑274 (MQ=255) 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atCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGa > 2:103400/1‑275 (MQ=255) caccTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGCAAANTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAAACTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCNAACTTTTCCGATATCTCGCTCCCCCTTCCGNNACTTTTAACACAGACAccccccgcactcc > 3:89484/1‑266 (MQ=255) cGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTTCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCAGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCTACGTCCTACCg > 2:620641/1‑275 (MQ=255) 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gTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGTTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCgg > 7:25628/1‑149 (MQ=255) tAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTCTTGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTCAGGATAGAACATTTGATTAACCCGa > 2:636275/1‑275 (MQ=255) tAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCACGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCaa > 2:341123/1‑234 (MQ=255) cgccgcTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTc > 7:378154/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) cgTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGt < 4:448803/220‑1 (MQ=255) gTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAAccc < 5:610912/149‑1 (MQ=255) aaTGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGa > 7:1046484/1‑149 (MQ=255) aaTGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGaa < 2:251350/273‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGAc < 6:395165/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc > 7:552366/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt > 8:213073/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGt < 7:601912/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGc > 6:857650/1‑146 (MQ=255) 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TGAAGGCTATAGCGACGCCTGGAAGGCGATTAATCCGCTGGAAGTTGAGTACGTGCGTTCGGAAATGCAGGTGAAATTTACCAATATCACCACCTCGCCGAACGACATTGTGGTTAACACGCCGTTCCATGTGGAGATTGGCAACCTGACCGGCGAATTTAATATCTGCCTGCCATTCAGCATGATCGAGCCGCTACGGGAATTGTTGGTTAACCCGCCGCTGGAAAACTCGCGTAATGAAGATCAGAACTGGCGCGATAACCTGGTGCGCCAGGTGCAGCATTCACAGCTGGAGCTGGTCGCCAACTTTGCCGATATCTCGCTACGCCTGTCGCAGATTTTAAAACTGA‑ACCCCGGCGACGTCCTGCCGATAGAAAAACCCGATCGCATCATCGCCCATGTTGACGGCGTCCCGGTGCTGACCAGTCAGTATGGCACCCTCAACGGTCAGTATGCGTTACGGATAGAACATTTGATTAACCCGATTTTAAATTCTCTGAACGAGGAACAGCCCAAATGAGTGACATGAATAATCCGGCCGAT > NC_000913/2020572‑2021114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |