| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,060,123 | A→T | 8.2% | N290Y (AAC→TAC) ‡ | torA → | trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,060,123 | 0 | A | T | 8.2% | 249.4 / 9.1 | 73 | N290Y (AAC→TAC) ‡ | torA | trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/30); new base T (3/3); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
CCGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCG > NC_000913/1059982‑1060269 | ccGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCa > 2:611250/1‑149 (MQ=255) cGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGGTTAAccgcaa < 2:473027/149‑5 (MQ=255) cGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCaa > 1:164129/1‑149 (MQ=255) gATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGGTTAACCGCaatg < 2:411581/149‑3 (MQ=255) tCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGGTTAACCGCaatgtg < 4:328204/149‑5 (MQ=255) tCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGGTTAACCGCaatgtg > 3:328204/1‑145 (MQ=255) gATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGt > 4:231326/1‑149 (MQ=255) gATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGt > 2:334469/1‑149 (MQ=255) tGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGc > 4:418695/1‑149 (MQ=255) aTGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTg > 4:39202/1‑149 (MQ=255) aTGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTg > 4:232495/1‑149 (MQ=255) tGACTATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGc > 4:97500/1‑149 (MQ=255) atatTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAAc > 4:584099/1‑149 (MQ=255) tatTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACt > 1:127296/1‑149 (MQ=255) ttACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTgg < 3:246253/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCt > 3:613484/1‑149 (MQ=255) gcAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTgg < 3:243190/149‑1 (MQ=255) cTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGcaca < 1:167212/149‑1 (MQ=255) tAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGGTTAAccgcaat > 4:100518/1‑112 (MQ=255) tAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGGTTAAccgcaat < 3:100518/117‑6 (MQ=255) tAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGGTTAACCGCaat < 3:42689/117‑2 (MQ=255) tAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCAGGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGGTTAACCGCaat > 4:42689/1‑116 (MQ=255) aaaGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATAc > 1:198409/1‑149 (MQ=255) aaGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACg < 2:164129/149‑1 (MQ=255) aGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGc < 4:194608/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCt < 1:413231/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCt < 3:584099/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCt < 2:198409/149‑1 (MQ=255) gAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGt > 1:514195/1‑149 (MQ=255) aaaGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTa > 2:83363/1‑149 (MQ=255) ggTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCt < 3:312793/149‑1 (MQ=255) tGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCTGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGt < 3:97500/149‑1 (MQ=255) tGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGaa > 3:119839/1‑142 (MQ=255) tGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGaa < 4:119839/142‑1 (MQ=255) aaaTTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTAc < 2:328379/149‑1 (MQ=255) aGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACaaa < 4:512690/149‑1 (MQ=255) caGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTcc < 4:79716/149‑1 (MQ=255) caGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTcc > 1:109768/1‑149 (MQ=255) gCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCtt > 2:79611/1‑149 (MQ=255) gCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCtt < 1:181591/149‑1 (MQ=255) gATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTaa < 3:544004/149‑1 (MQ=255) aTCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAac > 3:488622/1‑149 (MQ=255) aTCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAac > 4:152838/1‑149 (MQ=255) ccGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAacta < 2:486867/149‑1 (MQ=255) acaTCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACtgtgtg > 1:491947/1‑147 (MQ=255) acaTCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACtgtgtg < 2:491947/147‑1 (MQ=255) tCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGttt < 3:60758/149‑1 (MQ=255) aCCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCtt > 1:146298/1‑126 (MQ=255) aCCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCtt < 2:146298/126‑1 (MQ=255) aCCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGa < 3:152838/149‑1 (MQ=255) ccATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGc > 3:334147/1‑149 (MQ=255) ccATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGc > 3:540964/1‑149 (MQ=255) cATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGGTTAACCGCaat > 4:197044/1‑51 (MQ=37) aTGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAg > 2:347939/1‑149 (MQ=255) gTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTcc < 1:347939/149‑1 (MQ=255) gcgAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATctg > 4:413312/1‑149 (MQ=255) gcgAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATctg > 2:615648/1‑149 (MQ=255) gAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATctgct > 4:245046/1‑149 (MQ=255) aGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATctgctg < 3:231326/149‑1 (MQ=255) aTGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAGACTGACGTGCCGCTGAATCTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACTACAAAAACTTCATTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGt > 4:381149/1‑149 (MQ=255) aTGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTTCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGt < 1:60215/149‑1 (MQ=255) tgAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATGCGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGCTgag > 4:386272/1‑149 (MQ=255) aaGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGaa > 3:275209/1‑149 (MQ=255) acaTTGC‑GGGTAACCCGCAAACTAACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGAc > 4:207084/1‑149 (MQ=255) aTTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTc > 4:183646/1‑87 (MQ=255) aTTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTc < 3:183646/87‑1 (MQ=255) gC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCa < 4:613484/149‑1 (MQ=255) ggTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGTTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGc > 2:17275/1‑149 (MQ=255) ggTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACgg > 4:561666/1‑144 (MQ=255) ggTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACgg < 3:561666/144‑1 (MQ=255) ggTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGc < 1:83363/149‑1 (MQ=255) gTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGcc > 4:67143/1‑149 (MQ=255) ttAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCg > 4:515641/1‑149 (MQ=255) | CCGGATCACGATGTTTATGAATATTACGCGCAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGC‑GGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCG > NC_000913/1059982‑1060269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |