| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4321620 = | 147 (0.790) | 8 (0.050) | 6/224 | NT | 5.3% | coding (77/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
| ? | NC_000913 | 4321659 = | 146 (0.830) | coding (38/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACAGCAGCG > NC_000913/4321513‑4321806 | aaaaaCGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATc < 1:1045273/149‑1 (MQ=255) aCGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGt < 4:1061970/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGc > 4:667471/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTc < 3:557312/149‑1 (MQ=255) cccATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGt < 3:667471/149‑1 (MQ=255) cgcCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGt < 1:1103486/149‑1 (MQ=255) ccTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGc > 1:1677051/1‑149 (MQ=255) tGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCAt > 1:845337/1‑149 (MQ=255) aaTCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTcgcg > 3:1702083/1‑133 (MQ=255) aTCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa > 1:1713865/1‑149 (MQ=255) tCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATc > 4:1375867/1‑136 (MQ=255) tCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATc < 3:1375867/136‑1 (MQ=255) tCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa > 3:292099/1‑148 (MQ=255) tCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCa < 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ccAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGt > 4:910529/1‑130 (MQ=255) aGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGa > 1:29137/1‑149 (MQ=255) gTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGaa < 2:845337/149‑1 (MQ=255) gTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGaa > 2:222055/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATa > 4:337185/1‑143 (MQ=255) 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ccggctgaactggcagcacgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAgg < 4:687894‑M2/129‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGt < 1:834651/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCAGCAC‑GGTCATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAg < 3:1215672/104‑1 (MQ=255) tgtgCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAg > 4:1215672/1‑104 (MQ=255) tgtgCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACggt > 1:1759959/1‑135 (MQ=255) tgtgCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACggt < 2:1759959/135‑1 (MQ=255) tgCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCtt < 1:1436570/120‑1 (MQ=255) tgCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCtt > 2:1436570/1‑120 (MQ=255) ccgcCAGCACTGGATGTCC‑GTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCAc < 3:1326885/122‑1 (MQ=255) gcCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGcgcacgca < 1:811592/149‑1 (MQ=255) gcacgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCAcagc > 4:512273‑M2/6‑149 (MQ=255) cacgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCAcagca < 2:368190‑M2/145‑1 (MQ=255) acgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGgcgc < 1:155889‑M2/73‑1 (MQ=255) acgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCa < 3:999432‑M2/111‑1 (MQ=255) gGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACAGCAGCg > 4:510175‑M2/2‑149 (MQ=255) gGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACAGCAGCg > 1:1607117‑M2/2‑149 (MQ=255) gACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGATTTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACgg > 1:1230425/1‑120 (MQ=255) gACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACgg < 2:1230425/120‑1 (MQ=255) | CAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCAC‑GGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACAGCAGCG > NC_000913/4321513‑4321806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |