| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,987,103 | C→T | 6.8% | intergenic (+27/‑433) | yqeG → / → yqeH | putative transporter/putative LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,987,103 | 0 | C | T | 6.8% | 338.2 / 10.9 | 104 | intergenic (+27/‑433) | yqeG/yqeH | putative transporter/putative LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/51); new base T (3/4); total (48/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGC > NC_000913/2986960‑2987245 | atcatGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑Caa < 4:117979/149‑1 (MQ=255) tcatGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAAt < 2:1406800/149‑1 (MQ=255) tGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAAtttt < 3:961082/149‑1 (MQ=255) gCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTg < 4:1548362/149‑1 (MQ=255) cTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa > 1:1323667/1‑149 (MQ=255) cTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa < 3:814470/149‑1 (MQ=255) cTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa < 3:254712/149‑1 (MQ=255) tACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGAAc < 2:47509/149‑1 (MQ=255) tACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGAAc < 4:115940/149‑1 (MQ=255) tACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAc > 1:630979/1‑149 (MQ=255) gTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCAttttt > 1:546994/1‑149 (MQ=255) tATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa < 2:1393467/135‑1 (MQ=255) tATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCGAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa > 1:1393467/1‑135 (MQ=255) aTCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCa < 2:630979/149‑1 (MQ=255) tctcATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAccattc < 4:261353/139‑1 (MQ=255) tctcATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAccattc > 3:261353/1‑139 (MQ=255) tcATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATGGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTCCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCataa > 3:807836/1‑149 (MQ=255) cATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTCCAAAATTGCTA‑CAATTTTGa < 2:1490801/129‑1 (MQ=255) cATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTCCAAAATTGCTA‑CAATTTTGa > 1:1490801/1‑129 (MQ=255) ccGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTc < 4:807836/149‑1 (MQ=255) cTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGt > 3:1029629/1‑149 (MQ=255) ttAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTa > 3:62114/1‑109 (MQ=255) ttAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTa > 3:1664920/1‑109 (MQ=255) ttAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTa < 4:62114/109‑1 (MQ=255) ttAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTa < 4:1664920/109‑1 (MQ=255) ttAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATCCCATTTTTCATAATATTCATTTGtt < 2:1323667/149‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGttat > 4:1746523/1‑149 (MQ=255) aaCCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGttatt > 4:1501659/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGctatta > 3:737166/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGctatta < 4:737166/149‑1 (MQ=255) cccTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTtattat < 4:1029629/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGTAG‑CAAtttt > 1:806836/1‑110 (MQ=255) ccTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGTAG‑CAAtttt < 2:806836/110‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAc < 4:1763752/112‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAc > 3:1763752/1‑112 (MQ=255) ggCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAAtttt > 3:1354374/1‑107 (MQ=255) ggCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAAtttt < 4:1354374/107‑1 (MQ=255) ccATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTAt < 3:1746523/149‑1 (MQ=255) aTCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCAccc > 1:1021613/1‑144 (MQ=255) aTCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCAccc < 2:1021613/144‑1 (MQ=255) aTCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCa > 4:389934/1‑149 (MQ=255) tCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCAc > 3:333736/1‑149 (MQ=255) tCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCAc > 1:877938/1‑149 (MQ=255) cGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGttatta < 3:871714/134‑1 (MQ=255) ggAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGaa < 4:1604410/99‑1 (MQ=39) ggAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGaa > 3:1604410/1‑99 (MQ=255) aTCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTcc > 3:51215/1‑133 (MQ=255) aTCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTcc < 4:51215/133‑1 (MQ=255) aTCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTtctct < 4:333736/149‑1 (MQ=255) tGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGttat < 3:438287/124‑1 (MQ=255) tGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGttat > 4:438287/1‑124 (MQ=255) gCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCa < 3:79461/100‑1 (MQ=255) gCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCa > 4:79461/1‑100 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCAtt > 2:71650/1‑109 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCAtt < 1:71650/109‑1 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTa > 3:1481862/1‑149 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTa > 3:70111/1‑149 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTa < 4:70111/149‑1 (MQ=255) aTCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGt > 1:542070/1‑149 (MQ=255) gTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGtatt > 4:853246/1‑149 (MQ=255) ggTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATc < 4:1481862/149‑1 (MQ=255) gTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCata < 3:1184170/135‑1 (MQ=255) gTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCa < 2:877938/149‑1 (MQ=255) cTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTtct > 1:19551/1‑121 (MQ=255) cTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTtct < 2:19551/121‑1 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCGATTCTTCATAATATTCATTTGtt < 2:1443059/98‑1 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGtt > 1:1443059/1‑98 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCa < 2:1870758/107‑1 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCa > 1:1870758/1‑107 (MQ=255) gtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttagtt < 2:542070/149‑1 (MQ=255) gTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAac < 3:389934/149‑1 (MQ=255) tATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtt > 3:1501477/1‑140 (MQ=255) tATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtt < 4:1501477/140‑1 (MQ=255) ggTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa > 2:1559493/1‑58 (MQ=255) ggTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGaa < 1:1559493/58‑1 (MQ=255) gTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtt < 2:1141061/135‑1 (MQ=255) gTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtt > 1:1141061/1‑135 (MQ=255) aTGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAaga < 2:546994/149‑1 (MQ=255) gTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta > 1:1037426/1‑131 (MQ=255) gTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta < 2:1037426/131‑1 (MQ=255) tCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATc < 3:853246/149‑1 (MQ=255) gCTAATATCAGTTGTGGATTGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATcc > 3:1501732/1‑108 (MQ=255) gCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATcc < 4:1501732/108‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTAG‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCAccc > 3:536297/1‑65 (MQ=25) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTat < 2:1592341/90‑2 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAg > 1:1592341/1‑90 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGt < 1:1689893/91‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGt > 2:1689893/1‑91 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGAt < 1:1409194/121‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGAt > 2:1409194/1‑121 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATaa < 1:1124289/138‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATaa > 2:1124289/1‑138 (MQ=255) ttCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAg > 2:884486/1‑149 (MQ=255) ttCAAAATTG‑TAGCAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCAccc < 4:536297/65‑1 (MQ=25) tCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGa > 3:1241710/1‑149 (MQ=255) aaaTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGc < 4:1241710/149‑1 (MQ=255) aTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGa < 3:1642318/119‑1 (MQ=255) aTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTaaa > 4:148236/1‑129 (MQ=255) aTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTaaa < 3:148236/129‑1 (MQ=255) aTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTACTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACAAACAGAGATCTGa > 4:1642318/1‑119 (MQ=255) | ATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGC > NC_000913/2986960‑2987245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |